Sunum yükleniyor. Lütfen bekleyiniz

Sunum yükleniyor. Lütfen bekleyiniz

Mutasyon Analizi İçin Moleküler Genetik Yöntemi: SSCP Ayaz Najafov Boğaziçi Üniversitesi Moleküler Biyoloji ve Genetik bölümü.

Benzer bir sunumlar


... konulu sunumlar: "Mutasyon Analizi İçin Moleküler Genetik Yöntemi: SSCP Ayaz Najafov Boğaziçi Üniversitesi Moleküler Biyoloji ve Genetik bölümü."— Sunum transkripti:

1 Mutasyon Analizi İçin Moleküler Genetik Yöntemi: SSCP Ayaz Najafov Boğaziçi Üniversitesi Moleküler Biyoloji ve Genetik bölümü

2 Taslak Giriş Prensip Teknik Sonuçlar Tartışma

3 SSCP nedir? Single Strand Conformational Polymorphism (Tek Zincir Konformasyon Polimorfizmi) İlk kez Orita et al. (1989) En basit ve en sık kullanılan mutasyon tespit yöntemi. Sensitivity 80-90%

4 Prensip

5 Teknik Bir eksonun PCR ürünü 2% agarose gel check SSCP boyası: Formamide, EDTA, BPB, XC Hasta genomik DNA’sı PCR ürünü + 8% non-denaturing acrylamide:bisacrylamide (29:1) gels 16 saat oda sıcaklığında 10-15V/cm 0.6X TBE buffer Gümüş nitrat boyaması

6 Sonuçlar

7 Dezavantajlar Uzun fragmanlar tercih edilmiyor Düşük pH tamponları (Kukita et al. 1997) RFLP-SSCP Tespit edilemeyen 10-20% Mutasyonu tanımlamak için dizi analizi gerektiriyor

8 Avantajlar Mutasyonların 80-90% tespit ediliyor Hızlı Kolay Ucuz Tehlikeli: Radiyoaktif / Mutajen

9 Referanslar L. Davis, M. K. a. and J. Battey (1995). Basic Methods in Molecular Biology, McGraw-Hill Professional. Kukita, Y., T. Tahira, et al. (1997). "SSCP analysis of long DNA fragments in low pH gel." Hum Mutat 10(5):


"Mutasyon Analizi İçin Moleküler Genetik Yöntemi: SSCP Ayaz Najafov Boğaziçi Üniversitesi Moleküler Biyoloji ve Genetik bölümü." indir ppt

Benzer bir sunumlar


Google Reklamları