Malezya üzerinden gelen insanlar Papua’da ilk yerleşim birimlerini kurmuştur. Portekizli denizci Jorge de Meneses adayı keşfeden ilk kaşiftir ve adalara, bulanık saçlı insanların toprağı anlamına gelen “ilhas dos papuas” ismini vermiştir. İspanyol kaşif İnigo Ortiz de Retes, adaya “Yeni Gine” ismini vermiştir çünkü Afrika’daki Ginelilerle, bu adadaki Papualılar birbirine çok benzediğini söylemiştir. Bölgeye Fransız denizciler gelmiş ve adayı bir süre yönetmişlerdir. Adaya gelen birkaç İngiliz’den biri olan Sir Moresby, kısa sürede ipleri eline alarak adanın İngilizler tarafından ilhak edildiğini ilan etmişti Bismarck’ın yaptığı reformlar sonucu sömürge pazarına adım atan Almanya, Yeni Gine’nin kuzeyini ele geçirmiş ve güneydeki İngiliz kolonisiyle komşu olmuştur.
İngiltere, Yeni Gine’nin yönettiği kısmı ile Papua adasını birleştirerek oluşan yeni adaların genel ismini “Papua Yeni Gine” olarak değiştirmiştir. I.Dünya Savaşı sırasında sömürgelerine asker gönderemeyen Almanya’nın zayıflığından faydalanan Avustralya, adaları ele geçirmiştir. I.Dünya Savaşından sonra Milletler Cemiyeti, adaları Avustralya manda yönetimi olarak tanımıştır. Adada keşfedilen altın madenleri sayesinde binlerce kişi iş sahibi olmuştur. II.Dünya Savaşı esnasında Japonya adayı işgal etmiştir. ABD ile adada yapılan savaş II.Dünya Savaşının en kanlı muhaberelerinden biri olmuş ve her iki taraftan toplam ’e yakın kayıp meydana gelmiştir. BM kararıyla ada Avustralya’ya “Papua Yeni Gine” adıyla bırakılmıştır. Avustralya tarafından adanın yönetilmesi için 28 kişilik bir konsey kurulmuştur.
Ülke genelinde ilk kez yerli halkın da katılımıyla seçimler yapılmıştır. Ülkeye özerklik verilmiş ve Michael Somare geçici bir koalisyon hükümeti kurarak başbakanlık yapmıştır. Yeni para birimi olan Kina, Avustralya Dolarının yerini almıştır. Papua Yeni Gine, Avustralya’dan bağımsızlığını kazanmıştır. Bağımsızlıktan bu yana ilk genel seçimler yapılmış ve Somare hükümeti iktidarı devam etmiştir. Pasifik Okyanusunda meydana gelen deprem sonrası oluşan tsunami sonucunda ülkenin kıyı şeridi büyük zarar görmüş ve yaklaşık kişi yaşamını kaybetmiştir. BM, iktidardaki PNG partisinin talebi üzerine ülkede siyasi ofis açmıştır. Yapılan seçimler sonucunda Joseph Kabui Bougainville, cumhurbaşkanı seçilmiştir.
Ülkeye bağlı adacıklardan biri olan Duke Of York Mercan adasının küresel ısınma nedeniyle yavaş yavaş sulara gömüldüğü belirtilmiştir. Sir Michael Somare, 3. Kez üst üste başbakan seçilmiştir. Ülke Çin’e sıvılaştırılmış doğalgaz satmak için anlaşmıştır. Yapılan seçimlerde oy kaybı yaşayarak başarısız olan Somare hükümeti kuramamış ve yeni başbakan Peter O’Neill olmuştur. Avustralya’nın Papua Yeni Gine’den göçmen kabul etmemesi üzerine 400 kişi açlık grevine başlamış yalnız bir sonuç alınmamıştır.