Sunum yükleniyor. Lütfen bekleyiniz

Sunum yükleniyor. Lütfen bekleyiniz

GEBZE YÜKSEK TEKNOLOJİ ENSTİTÜSÜ MÜHENDİSLİK VE FEN BİLİMLERİ FAKÜLTESİ BAKTERİLER ARASI İLETİŞİMDE. QUORUM-SENSİNG MEKANİZMASI,. AHL SİNYAL MOLEKÜLLERİ.

Benzer bir sunumlar


... konulu sunumlar: "GEBZE YÜKSEK TEKNOLOJİ ENSTİTÜSÜ MÜHENDİSLİK VE FEN BİLİMLERİ FAKÜLTESİ BAKTERİLER ARASI İLETİŞİMDE. QUORUM-SENSİNG MEKANİZMASI,. AHL SİNYAL MOLEKÜLLERİ."— Sunum transkripti:

1 GEBZE YÜKSEK TEKNOLOJİ ENSTİTÜSÜ MÜHENDİSLİK VE FEN BİLİMLERİ FAKÜLTESİ BAKTERİLER ARASI İLETİŞİMDE. QUORUM-SENSİNG MEKANİZMASI,. AHL SİNYAL MOLEKÜLLERİ. VE İLGİLİ GENLERİN EKSPRESYONU Yüksek Lisans Semineri-I.11 SUNUM MURAT KEMAL AVCI. DANIŞMAN Prof. Dr. İ. YAVUZ SEZEN GEBZE

2 2 Murat Kemal AVCI_GYTE Kasım_2005 ﻬ 1. Quorum-sensing (olayı / mekanizması / süreci) nedir ? ﻬ 2. Bu süreçte görülen aşamalar nelerdir ? ﻬ 3. Hangi moleküller kullanılır ? ﻬ 4. QS mekanizmasının çeşitleri var mıdır ? / nelerdir ? ﻬ 5. Hangi canlılarda görülür ? ﻬ 6. İlgili genlerin kontrolü nasıl yapılır ? ﻬ 7. QS ile düzenlenen davranışlar nelerdir?

3 3Murat Kemal AVCI_GYTE 1. QUORUM-SENSİNG NEDİR? Bir hücrenin, populasyondaki hücre konsantrasyonunu, ortamda biriken sinyal molekülleri aracılığıyla algılayabilmesini “quorum-sensing” terimiyle ifade ediyoruz. Bir hücrenin, populasyondaki hücre konsantrasyonunu, ortamda biriken sinyal molekülleri aracılığıyla algılayabilmesini “quorum-sensing” terimiyle ifade ediyoruz. Quorum : Yeterli sayı Sense : Hissetmek, algılamak algılamak Kasım_2005

4 4Murat Kemal AVCI_GYTE ◊ Salgılanan molekül  autoinducer (sinyal molekülü) (sinyal molekülü) ◊ Algılama  türe özgü davranış Kasım_2005

5 5Murat Kemal AVCI_GYTE Şekil.1 : Quorum - sensing mekanizmasının meydana gelmesinde hücre yaoğunluğunun etkisi. Şekil.1 : Quorum - sensing mekanizmasının meydana gelmesinde hücre yaoğunluğunun etkisi. [ (K.C. Mok et al., EMBO J. 22 (2003), pp. 870–881’e uyarlanmıştır.] [ (K.C. Mok et al., EMBO J. 22 (2003), pp. 870–881’e uyarlanmıştır.] Kasım_2005

6 6Murat Kemal AVCI_GYTE 2. Quorum-sensin mekanizması sinyal molekülünün, 1. Sentezlemesi, 2. Salgılanması, 2. Salgılanması, 3. Algılanması 3. Algılanması olmak üzere üç aşamada gerçekleşir. olmak üzere üç aşamada gerçekleşir. Türe özgü davranış sergilenir (Henke,J.M., Bassler, B.L. (2004) Bacterial Social Engagement. Trends in Cell Bio. Vol14 No:11 ) Trends in Cell Bio. Vol14 No:11 ) Kasım_2005

7 7Murat Kemal AVCI_GYTE 2. QS mekanizmasında görülen aşamalar Quorum-sensin mekanizması sinyal molekülünün, Quorum-sensin mekanizması sinyal molekülünün, 1. Sentezlemesi, 2. Salgılanması, 2. Salgılanması, 3. Algılanması 3. Algılanması olmak üzere üç aşamada gerçekleşir. olmak üzere üç aşamada gerçekleşir. (Henke,J.M., Bassler, B.L. (2004) Bacterial Social Engagement. Trends in Cell Bio. Vol14 No:11 ) Trends in Cell Bio. Vol14 No:11 ) Türe özgü davranış sergilenir Kasım_2005

8 8 Murat Kemal AVCI_GYTE 3. SİNYAL MOLEKÜLLERİ Bu mekanizmada salgılanan sinyal molekülleri; Açil Homoserin Lakton (AHL) türevleri, Açil Homoserin Lakton (AHL) türevleri, Oligopeptitler Oligopeptitler Diğer moleküller… Diğer moleküller…HOH C CH 2 COOH H2NH2NH2NH2N Şekil.2 : Nonprotein amino asitlerden homoserin. Kasım_2005

9 9Murat Kemal AVCI_GYTE Şekil.3 : Açil homoserin lakton türevleri. (Nottingham) Kasım_2005

10 10Murat Kemal AVCI_GYTE Şekil. 4 : Autoinducer moleküllerin çeşitleri. moleküllerin çeşitleri. A ) Gram negatif bakteriler tarafından kullanılan Açil homoserin laktonlar. B ) Gram pozitif bakteriler tarafından kullanılan oligopeptitler. C ) Furanonların 3(2H) sınıfına ait genel yapı. 3(2H) Furanonların LuxS proteinine bağlı bir autoinducer madde olduğu düşünülmektedir. (Schauder, S., Bassler, B.L. The Languages of Bacteria. Genes & Development 15: ) (Schauder, S., Bassler, B.L. The Languages of Bacteria. Genes & Development 15: ) 3-oxo-C12-HSL C4--HSL C8-HSL 3-OH-C4-HSL C6-HSL Kasım_2005

11 11Murat Kemal AVCI_GYTE 4. YARARLARI Quorum-sensing mekanizması Türe özgü davranışı hep birlikte sergileme, Türe özgü davranışı hep birlikte sergileme, Bakterilerin davranışlarını birbirlerine göre ayarlama (zamanlama), Bakterilerin davranışlarını birbirlerine göre ayarlama (zamanlama), Çevresel şartlar sık sık değiştiği için bu değişikliklere hızlı bir şekilde cevap verme imkanı sağlar. Çevresel şartlar sık sık değiştiği için bu değişikliklere hızlı bir şekilde cevap verme imkanı sağlar. Kasım_2005

12 12Murat Kemal AVCI_GYTE 5. Türe özgü davranışlar 1.Biyolüminesans, 2.Virülans faktörlerinin salgılanması, 3.Biyofilm oluşumu, 4.Konjugasyon, 5.Sporulasyon, (Henke,J.M., Bassler, B.L. (2004) Bacterial Social Engagement Trends in Cell Bio. Vol14 No:11 ) Kasım_2005

13 13Murat Kemal AVCI_GYTE Türe özgü davranışlar 1. Sporulasyon, 13. Toplu kaçış, 2. Konjugasyon, 12. Hücre bölünmesi, 3. Bakterial lipaz, 11.Antibiyotik üretimi, 3. Bakterial lipaz, 11.Antibiyotik üretimi, 4. Biyolüminesans, 10.Lag fazından çıkma, 4. Biyolüminesans, 10.Lag fazından çıkma, 5. Biyofilm oluşumu, 9. Nodül sayısını sınırlama, 5. Biyofilm oluşumu, 9. Nodül sayısını sınırlama, 6. Virülans faktörlerinin salgılanması, 6. Virülans faktörlerinin salgılanması, 7. Ekstrasellüler proteaz üretim 7. Ekstrasellüler proteaz üretim 8. Ekzoemzimler, 8. Ekzoemzimler, Kasım_2005

14 14Murat Kemal AVCI_GYTE Quorum-sensing iletişim mekanızması Quorum-sensing iletişim mekanızması Aynı türe ait bakteriler arasında, Aynı türe ait bakteriler arasında, Farklı bakteri türleri arasında, Farklı bakteri türleri arasında, Prokaryot canlı ile ökaryot konağı arasında Prokaryot canlı ile ökaryot konağı arasında meydana gelebilir. (Henke,J.M., Bassler, B.L. (2004) Bacterial Social Engagement Trends in Cell Bio. Vol14 No:11 ) 6. Kimler arasında gerçekleşir Kasım_2005

15 15Murat Kemal AVCI_GYTE 7.QUORUM-SENSİNG MEKANİZMALARI ☺ Üç tip mekanizma vardır: 1. Lux I / Lux R sistemi (Gram (-) Bakterilerde) (Gram (-) Bakterilerde) 2.Oligopeptit sistemi (Gram (+) Bakterilerde) 3.Hibrid sistemi 3.Hibrid sistemi ( Gr (-) ve Gr (+) Bakterilerde) ( Gr (-) ve Gr (+) Bakterilerde) (Xavier, K. B., Bassler B. L., (2003) LuxS quorum sensing: more than just a numbers game. Current Opinion in Microbiology 6: )  Salgılanan moleküle ve  Algılama mekanizmasına göre: göre: Kasım_2005

16 16Murat Kemal AVCI_GYTE Şekil.5 : Salgılanan moleküle ve kullanılan algılama düzeneğine göre quorum-sensing mekanizmaları.  A) Gram (-) bakterilerde LuxI tipi enzimler türe özgü HSL moleküllerini ( sarı küreler ) katalizler. Bu HSL’ler LuxR tipi transkripsiyonel düzenleyiciler tarafından algılanır. Bu HSL’ler LuxR tipi transkripsiyonel düzenleyiciler tarafından algılanır.  B) Gram (+) bakterilerde sinyal iletimi için oligopeptitlere ( yeşil dikdörtgenler ) bağlı qs mekanizması ve iki-bileşenli fosforlama zinciri kullanılır.  C) Hibrit sistem. Vibrio harveyi modeli. LuxLM AI-1 sinyal moleküllerini (mavi) sentezlerken, LuxS AI-2 simyal moleküllerinin (kırmızı üçgen) sentezinde görevlidir. ♦ Luxp periplazmik AI-2 bağlanma proteinidir. ♦ Luxp periplazmik AI-2 bağlanma proteinidir. ♦ Sinyal iletimi iki – bileşenli fosforlama mekanizmasıyla gerçekleşir. ♦ Sinyal iletimi iki – bileşenli fosforlama mekanizmasıyla gerçekleşir. ♦ (b) Ve (c)’de iki bileşenli proteinlerde korunmuş fpsforlama bölgeleri H (his) ve D (Asp) ile gösterilmiştir. ♦ (b) Ve (c)’de iki bileşenli proteinlerde korunmuş fpsforlama bölgeleri H (his) ve D (Asp) ile gösterilmiştir. ♦ P, fosforilasyonu ifade eder. ♦ P, fosforilasyonu ifade eder. Gram negatif: LuxI/R Gram negatif: LuxI/R Gram pozitif : oligopeptit Gram pozitif : oligopeptit Hibrit Hibrit (Xavier, K.B. and Bassler, B.L. (2003) LuxS quorum sensing: more than just a numbers game. Curr. Opin. Microbiol. 6, 191–197) Kasım_2005

17 17Murat Kemal AVCI_GYTE Şekil.5-A:  A) Gram (-) bakterilerde LuxI tipi enzimler türe özgü HSL moleküllerini ( sarı küreler ) katalizler. Bu HSL’ler LuxR tipi transkripsiyonel düzenleyiciler tarafından algılanır. Bu HSL’ler LuxR tipi transkripsiyonel düzenleyiciler tarafından algılanır. Gram negatif: LuxI/R Gram negatif: LuxI/R Hedef genler Kasım_2005

18 18Murat Kemal AVCI_GYTE V Şekil.5-B:  B) Gram (+) bakterilerde sinyal iletimi için oligopeptitlere (yeşil dikdörtgenler) bağlı qs mekanizması ve iki-bileşenli fosforlama zinciri kullanılır. Gram pozitif : oligopeptit Gram pozitif : oligopeptit Öncül peptit lokusu Hedef genler İşlenmişpeptit Kasım_2005

19 19Murat Kemal AVCI_GYTE Şekil.5-C:  C) Hibrit sistem. Vibrio harveyi modeli. LuxLM AI-1 sinyal moleküllerini (mavi) sentezlerken, LuxS AI-2 sinyal moleküllerinin (kırmızı üçgen) sentezinde görevlidir. Hibrit sistem Hibrit sistem Kasım_2005

20 20Murat Kemal AVCI_GYTE 8. Quorum-sensing mekanizmasını kullanan mikroorganizmalar Gr (-)  Vibrio fischeri P. aeruginosa P. aeruginosa Gr (+)  Bacillus subtilis Hibrit sistem  Vibrio harveyi Kasım_2005

21 21Murat Kemal AVCI_GYTE Kasım_2005 Tablo. X :Gram negatif bakterilerde quorum-sensing özeti Sinyal molekülü Düzenleyici protein Düzenleyici protein Tür Tür Fenotip Fenotip De Kievit, T.R., and Iglewski, B.h. (2000). Bacterial Quorum Sensing in Pathogenic Relationship. Infection and Immunity, De Kievit, T.R., and Iglewski, B.h. (2000). Bacterial Quorum Sensing in Pathogenic Relationship. Infection and Immunity,

22 22Murat Kemal AVCI_GYTE Tablo.1 :Gram negatif bakterilerde quorum-sensing özeti Sinyal molekülü Düzenleyici protein Düzenleyici protein Tür Tür Fenotip Fenotip De Kievit, T.R., and Iglewski, B.h. (2000). Bacterial Quorum Sensing in Pathogenic Relationship. Infection and Immunity, De Kievit, T.R., and Iglewski, B.h. (2000). Bacterial Quorum Sensing in Pathogenic Relationship. Infection and Immunity, Kasım_2005

23 23Murat Kemal AVCI_GYTE Tablo.2 :Gram negatif bakterilerde quorum-sensing özeti Sinyal molekülü Düzenleyici protein Düzenleyici protein Tür Tür Fenotip Fenotip De Kievit, T.R., and Iglewski, B.h. (2000). Bacterial Quorum Sensing in Pathogenic Relationship. Infection and Immunity, De Kievit, T.R., and Iglewski, B.h. (2000). Bacterial Quorum Sensing in Pathogenic Relationship. Infection and Immunity, Kasım_2005

24 24Murat Kemal AVCI_GYTE dfd Tablo.3 : Gram pozitif bakterilerde A) Quorum sensing ile düzenlenen davranışlar ve B) Salgılanan moleküller davranışlar ve B) Salgılanan moleküller Kompetens, Spor oluşum Virülans, biyofilm oluşumu Nisin üretimi Kompetens, A) B) E : Glutamik asit, R: Arginin, T:Threonin, P: Prolin, D: Aspartik asit, Q: Glutamin, W: Triptofan, (Henke,J.M., Bassler, B.L. (2004) Bacterial Social Engagement Trends in Cell Bio. Vol14 No:11 ) Kasım_2005

25 25Murat Kemal AVCI_GYTE Tablo.4 : Hibrid quorum-sensing mekanizmasını kullanan türlerden(A) ve salgılanan moleküllerden bazıları(B). A) B) (Henke,J.M., Bassler, B.L. (2004) Bacterial Social Engagement Trends in Cell Bio. Vol14 No:11 ) Kasım_2005

26 26Murat Kemal AVCI_GYTE I. Vibrio fischeri’de quorum-sensing mekanizması Şekil.6 : Vibrio fischeri’’de quorum- sensing mekanizması. Şekil.6 : Vibrio fischeri’’de quorum- sensing mekanizması. a) Düşük hücre konsantrasyonunda biyolüminesans genlerinin durumu, a) Düşük hücre konsantrasyonunda biyolüminesans genlerinin durumu, b)Yüksek hücre b)Yüksek hücre konsantrasyo-nunda biyolüminesans genlerinin durumu, konsantrasyo-nunda biyolüminesans genlerinin durumu, IŞIK b) Yüksek hücre konsantrasyonu a) Düşük hücre konsantrasyonuIŞIK Kasım_2005

27 27Murat Kemal AVCI_GYTE Şekil.7 : A)Vibrio fischeri b) Sıvı kültürde V. Fischeri tarafındanmeydana getirilen biyolüminesans. C)V. Fischeri’nin simbiyoz olarak yaşadığı Melenocetus sp. D) Petri kabında Vibrio fischeri tarafından meydana getirilen biyolüminesans olayı a) d) b) c) Kasım_2005

28 28Murat Kemal AVCI_GYTE II. Pseudomonas aeruginosa’da quorum-sensing mekanizması P. aeruginosa ile ilgili iki farklı quorum-sensing mekanizması tanımlanmıştır: P. aeruginosa ile ilgili iki farklı quorum-sensing mekanizması tanımlanmıştır:. 1. las sistemi : 1. las sistemi : i. LasR (transkripsiyon faktörü) i. LasR (transkripsiyon faktörü) ii. LasI (AHL sentaz) ( N-3-oxo- ii. LasI (AHL sentaz) ( N-3-oxo- dodecanoil–homoserin laktanın dodecanoil–homoserin laktanın [3-oxo-C12-HSL] sentezinden [3-oxo-C12-HSL] sentezinden sorumludur) sorumludur). 2. rhl sistemi : 2. rhl sistemi : i. RhIR i. RhIR ii. RhII (N-bütanoil-homoserin laktan’ın [C4 - ii. RhII (N-bütanoil-homoserin laktan’ın [C4 - HSL] sentezinden sorumludur) HSL] sentezinden sorumludur) Şekil.8 : P. aeruginosa Kasım_2005

29 29Murat Kemal AVCI_GYTE Şekil.9 : P. aeruginosa’da quorum-sensing mekanizması. Şekil.9 : P. aeruginosa’da quorum-sensing mekanizması. (Henke,J.M., Bassler, B.L. (2004) Bacterial Social Engagement Trends in Cell Bio. Vol14 No:11 ) Kasım_2005

30 30Murat Kemal AVCI_GYTE III. Bacillus subtilis’te quorum-sensing mekanizması Birden fazla sinyal molekülüne eş zamanlı cevap veren mekanizmaları kullanır. 4 ihtimal vardır: 1. Her iki sinyal molekülü var (AI1 ve AI2) 2. Sadece AI1 var 1. Her iki sinyal molekülü var (AI1 ve AI2) 2. Sadece AI1 var 3. Sadece AI2 var 3. Sadece AI2 var 4. İki sinyal molekülüde yok 4. İki sinyal molekülüde yok Şekil.10 : Bacillus subtilis Şekil.10 : Bacillus subtilis Kasım_2005

31 31Murat Kemal AVCI_GYTE Şekil.11 : Bacillus subtilis’ te quorum sensing mekanizması. (Henke,J.M., Bassler, B.L. (2004) Bacterial Social Engagement Trends in Cell Bio. Vol14 No:11 ) Kasım_2005

32 32Murat Kemal AVCI_GYTE Vibrio harveyi’de Quorum-sensing Mekanizması Kasım_2005

33 33Murat Kemal AVCI_GYTE Şekil.12 : V. harveyi’de quorum sensing mekanizması. (Henke,J.M., Bassler, B.L. (2004) Bacterial Social Engagement Trends in Cell Bio. Vol14 No:11 ) Kasım_2005

34 34Murat Kemal AVCI_GYTE GELECEKTEKİ ARAŞTIRMALAR Biyoteknolojik araştırmalar, yapı olarak sinyal molekülleri ile ilişkili moleküllerin geliştirilmesi üzerine odaklanmış durumdadır. Bu tip moleküller, virülansını qs mekanizmasıyla kontrol eden bakteriler üzerinde antimikrobiyal ilaç olarak kullanılma potansiyeline sahiptir. Çeşitli bakterilerdeki sinyal moleküllerinin üretiminde ve algılanmasında görevli olan enzimlerin yeni antimikrobiyal ilaçların üretimi için kullanılması düşünülmektedir.. Kasım_2005

35 35Murat Kemal AVCI_GYTE Faydalı qs mekanizmalarını kullanmak için düzenlenen biyoteknolojik yöntemlerle, antibiyotik gibi doğal ürünlerin endüstriyel olarak üretimi sağlanabilir. Bitkilerdeki bazı AHL’lerin üretimi sayesinde gelecekte tahıl üretimini arttırmak amacıyla bitki-mikrop etkileşimine dışarıdan müdahale ederek bitki hastalıkları kontrol edilebilir. Kasım_2005

36 36Murat Kemal AVCI_GYTE Kasım_2005 Sadece yeterli sayıya ihtiyacım var. Sinyal vermeliyim. Sadece yeterli sayıya ihtiyacım var. Sinyal vermeliyim. YARDIM EDİİİİİİİİİİİNNN… YARDIM EDİİİİİİİİİİİNNN…

37 37Murat Kemal AVCI_GYTE Kasım_2005 Te ş ekkürler… Te ş ekkürler…

38 38Murat Kemal AVCI_GYTE Kasım_2005 REFERANSLAR 1. Miller, M.B. and Bassler, B.L. (2001) Quorum sensing in bacteria. Annu. Rev. Microbiol. 55, 165–199. Annu. Rev. Microbiol. 55, 165– Engebrecht, J. et al. (1983) Bacterial bioluminescence: isolation and genetic analysis of functions from Vibrio fischeri. Cell 32, 773–781. genetic analysis of functions from Vibrio fischeri. Cell 32, 773– Fuqua, W.C. et al. (1994) Quorum sensing in bacteria: the LuxR-LuxI family of cell density-responsive transcriptional regulators. J. Bacteriol. 176, 269–275. family of cell density-responsive transcriptional regulators. J. Bacteriol. 176, 269– More, M.I. et al. (1996) Enzymatic synthesis of a quorum-sensing autoinducer through use of defined substrates. Science 272, 1655–1658. autoinducer through use of defined substrates. Science 272, 1655– Schaefer, A.L. et al. (1996) Generation of cell-to-cell signals in quorum sensing: acyl homoserine lactone synthase activity of a purified Vibrio fischeri LuxI protein. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 93, 9505– Fuqua, C. et al. (2001) Regulation of gene expression by cell-to-cell communication: acyl-homoserine lactone quorum sensing. Annu. Rev. Genet. 35, 439– Lazazzera, B.A. and Grossman, A.D. (1998) The ins and outs of peptide signaling. Trends Microbiol. 6, 288– Otto, M. et al. (1998) Structure of the pheromone peptide of the Staphylococcus epidermidis agr system. FEBS Lett. 424, 89–94. Staphylococcus epidermidis agr system. FEBS Lett. 424, 89– Ansaldi, M. et al. (2002) Specific activation of the Bacillus quorumsensing systems by isoprenylated pheromone variants. Mol. quorumsensing systems by isoprenylated pheromone variants. Mol. Microbiol. 44, 1561–1573. Microbiol. 44, 1561– Ji, G. et al. (1997) Bacterial interference caused by autoinducing peptide variants. Science 276, 2027–2030. peptide variants. Science 276, 2027– Surette, M.G. et al. (1999) Quorum sensing in Escherichia coli, Salmonella typhimurium, and Vibrio harveyi: a new family of genes Salmonella typhimurium, and Vibrio harveyi: a new family of genes responsible for autoinducer production. Proc. Natl. Acad. Sci. USA responsible for autoinducer production. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 96, 1639– , 1639– Schauder, S. et al.(2001) The LuxS family of bacterial autoinducers: biosynthesis of a novel quorum-sensing signal molecule. biosynthesis of a novel quorum-sensing signal molecule. Mol. Microbiol. 41, 463–476. Mol. Microbiol. 41, 463– Miller, S.T. et al. (2004) Salmonella typhimurium recognizes a chemically distinct form of the bacterial quorum-sensing signal AI-2. chemically distinct form of the bacterial quorum-sensing signal AI-2. Mol. Cell 15, 677–687. Mol. Cell 15, 677–687.

39 39Murat Kemal AVCI_GYTE Kasım_ Mok, K.C. et al.(2003)Vibrio harveyi quorum sensing: a coincidence detector for two autoinducers controls gene expression. EMBO J. 22, 870– Lazazzera, B.A. (2001) The intracellular function of extracellular signaling peptides. Peptides 22, 1519–1527. signaling peptides. Peptides 22, 1519– Smith,R.S. and Iglewski, B.H.(2003) P. aeruginosa quorum-sensing systems and virulence. Curr. Opin. Microbiol. 6, 56–60. systems and virulence. Curr. Opin. Microbiol. 6, 56– Joris,P.X. et al.(1998) Coincidence detection in the auditory system: 50 years after Jeffress. Neuron 21, 1235– years after Jeffress. Neuron 21, 1235– Edwards, D.H. et al. (1998) Neuronal coincidence detection by voltage-sensitive electrical synapses. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. voltage-sensitive electrical synapses. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 95, 7145– , 7145– Hausser, M. et al. (2001) Differential shunting of EPSPs by action potentials. Science 291, 138–141. potentials. Science 291, 138– Perego, M.(1997) A peptide export-import control circuit modulating bacterial development regulates protein phosphatases of bacterial development regulates protein phosphatases of the phosphorelay. the phosphorelay. 21. Lenz, D.H. et al. (2004) The small RNA chaperone Hfq and multiple small RNAs control quorum sensing in Vibrio harveyi and Vibrio small RNAs control quorum sensing in Vibrio harveyi and Vibrio cholerae. Cell 118, 69–82. cholerae. Cell 118, 69– Xavier, K.B. and Bassler, B.L. (2003) LuxS quorum sensing: more than just a numbers game. Curr. Opin. Microbiol. 6, 191–197. than just a numbers game. Curr. Opin. Microbiol. 6, 191– McNab, R. et al. (2003) LuxS-based signaling in Streptococcus gordonii: autoinducer 2 controls carbohydrate metabolism and gordonii: autoinducer 2 controls carbohydrate metabolism and biofilm formation with Porphyromonas gingivalis. J. Bacteriol. 185, biofilm formation with Porphyromonas gingivalis. J. Bacteriol. 185, 274– – Duan, K. et al. (2003) Modulation of Pseudomonas aeruginosa gene expression by host microflora through interspecies gene expression by host microflora through interspecies communication. Mol. Microbiol. 50, 1477–1491. communication. Mol. Microbiol. 50, 1477– Ahmer, B.M. (2004) Cell-to-cell signalling in Escherichia coli and Salmonella enterica. Mol. Microbiol. 52, 933–945. Salmonella enterica. Mol. Microbiol. 52, 933–945.

40 40Murat Kemal AVCI_GYTE Kasım_ Williams, S.C. et al. (2004) Pseudomonas aeruginosa autoinducer enters and functions inmammalian cells. J. Bacteriol. 186, enters and functions inmammalian cells. J. Bacteriol. 186, 2281– – Oh, K.B. et al. (2001) Purification and characterization of an autoregulatory substance capable of regulating the morphological autoregulatory substance capable of regulating the morphological transition in Candida albicans. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 98, transition in Candida albicans. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 98, 4664– – Wang, L.H. et al. (2004) A bacterial cell-cell communication signal with cross-kingdom structural analogues. Mol.Microbiol.51,903–912 with cross-kingdom structural analogues. Mol.Microbiol.51,903– Mathesius, U. et al. (2003) Extensive and specific responses of a eukaryote to bacterial quorum-sensing signals. Proc. Natl. Acad. eukaryote to bacterial quorum-sensing signals. Proc. Natl. Acad. Sci.U. S. A. 100, 1444–1449. Sci.U. S. A. 100, 1444– Joint, I. et. al. (2002) Cell-to-cell communication across the prokaryote - eukaryote boundary. Science 298, prokaryote - eukaryote boundary. Science 298, Urban, S. et al. (2002) Conservation of intramembrane proteolytic activity and substrate specificity in prokaryotic and eukaryotic activity and substrate specificity in prokaryotic and eukaryotic rhomboids. Curr. Biol. 12, 1507–1512. rhomboids. Curr. Biol. 12, 1507– Gallio, M. et al. (2002) A conserved mechanism for extracellular Signaling in eukaryotes and prokaryotes. Proc. Natl. Acad. Sci. Signaling in eukaryotes and prokaryotes. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A.99, 12208– U. S. A.99, 12208– Lyon, G.J. et al. (2002) Key determinants of receptor activation in the agr autoinducing peptides of Staphylococcus aureus. the agr autoinducing peptides of Staphylococcus aureus. Biochemistry 41, 10095– Biochemistry 41, 10095– Dong, Y.H. et al. (2000) AiiA, an enzyme that inactivates the acylhomoserine lactone quorum-sensing signal and attenuates the acylhomoserine lactone quorum-sensing signal and attenuates the virulence of Erwinia carotovora. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97, virulence of Erwinia carotovora. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97, 3526– – Lin, Y.H. et al. (2003) Acyl-homoserine lactone acylase from Ralstonia strain XJ12B represents a novel and potent class of Ralstonia strain XJ12B represents a novel and potent class of quorum-quenching enzymes. Mol. Microbiol. 47, 849–860. quorum-quenching enzymes. Mol. Microbiol. 47, 849– Ren, D. et al. (2002) Inhibition of biofilm formation and swarming of Bacillus subtilis by (5Z)– 4 – bromo-5-(bromomethylene)-3-butyl- Bacillus subtilis by (5Z)– 4 – bromo-5-(bromomethylene)-3-butyl- 2(5H)-furanone. Lett. Appl. Microbiol. 34, 293–299. 2(5H)-furanone. Lett. Appl. Microbiol. 34, 293– Chun, C.K. et al. (2004) Inactivation of a Pseudomonas aeruginosa quorum-sensing signal by human airway epithelia. Proc. Natl. Acad. quorum-sensing signal by human airway epithelia. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 101, 3587–3590 Sci. U. S. A. 101, 3587–3590

41 41Murat Kemal AVCI_GYTE Kasım_ Wu,H. et al. (2004) Synthetic furanones inhibit quorum-sensing and enhance bacterial clearance in Pseudomonas aeruginosa lung enhance bacterial clearance in Pseudomonas aeruginosa lung infection in mice. J. Antimicrob. Chemother. 53, 1054–1061 infection in mice. J. Antimicrob. Chemother. 53, 1054– Hirakawa, H., Inazumi, Y., Masaki, T., Hirata, T., and Yamaguchi, A.,(2005)Indole induces the expression of multidrug exporter genes A.,(2005)Indole induces the expression of multidrug exporter genes in Escherichia coli. Mol. Bio. 55(4), in Escherichia coli. Mol. Bio. 55(4), Minogue, T.D., Carlier, A.L., Koutsoudis, M.D., and von Bodman, S.B. (2005) The cell density-dependent expression of stewartan S.B. (2005) The cell density-dependent expression of stewartan exopolysaccharide in Pantoea stewartii ssp. Stewartii is a function exopolysaccharide in Pantoea stewartii ssp. Stewartii is a function of EsaR-mediated repression of the rcsA gene. Mol. Bio. 56 (1), of EsaR-mediated repression of the rcsA gene. Mol. Bio. 56 (1), Valde´z, J.C., Peral, M.C., Rachid, M., Santana, M., and Perdigo´n, G.(2005)Interference of Lactobacillus plantarum with Pseudomonas G.(2005)Interference of Lactobacillus plantarum with Pseudomonas aeruginosa in vitro and in infected burns: the potential use of aeruginosa in vitro and in infected burns: the potential use of probiotics in wound treatment. Clin. Microbio. Infect, 11: probiotics in wound treatment. Clin. Microbio. Infect, 11: Castonguay, M.H., van der Schaaf, S., Koester, W., Krooneman, J., van der Meer, W., Harmsen, H., Landini, P. (2005) Biofilm formation van der Meer, W., Harmsen, H., Landini, P. (2005) Biofilm formation by Escherichia coli is stimulated by synergistic interactions and by Escherichia coli is stimulated by synergistic interactions and co-adhesion mechanisms with adherence-proficient bacteria. Res. co-adhesion mechanisms with adherence-proficient bacteria. Res. in Mİcrobio. (Elsavier) in Mİcrobio. (Elsavier) 43. Hammer, B.K., and Bassler, B.L. (2003) Quorum sensing controls biofilm formation in Vibrio cholerae. Mol. Microbio. 50: biofilm formation in Vibrio cholerae. Mol. Microbio. 50: Ren, D., Bedzyk,A.D., Ye, R.W., Thomas,S.M. and Wood, T.K., (2004) Stationary-Phase Quorum-Sensing Signals Affect (2004) Stationary-Phase Quorum-Sensing Signals Affect Autoinducer-2 and Gene Expression in Escherichia coli. Applied Autoinducer-2 and Gene Expression in Escherichia coli. Applied and Environmental Mıcrobiology, Vol.70 No.4 and Environmental Mıcrobiology, Vol.70 No March, J.C., and Bentley, W.E. (2004). Quorum sensing and bacterial cross-talk in biotechnology. Curr.Opin.in Biotech. bacterial cross-talk in biotechnology. Curr.Opin.in Biotech. 15: : Schauder, S., and Bassler, B.L. (2001). The languages of bacteria. Genes&Development. 15: Genes&Development. 15: Bassler, B.L. (1999). How bacteria talk to each other: Regulation of gene expression by quorum sensing. Curr. Opin. Microbiol. gene expression by quorum sensing. Curr. Opin. Microbiol. 2: 582–587. 2: 582– Cao, J.G. and Meighen, E.A. (1989). Purification and structural identification of an autoinducer for the luminescence system of identification of an autoinducer for the luminescence system of Vibrio harveyi. J. Biol. Chem. 264: 21670– Vibrio harveyi. J. Biol. Chem. 264: 21670–21676.

42 42Murat Kemal AVCI_GYTE Kasım_ Davies, D.G., Parsek, M.R., Pearson, J.P., Iglewski, B.H., Costerton, J.W., and Greenberg, E.P. (1998). The involvement of Costerton, J.W., and Greenberg, E.P. (1998). The involvement of cellto-cell signals in the development of a bacterial biofilm. Science cellto-cell signals in the development of a bacterial biofilm. Science 280: 295– : 295– Day, W.A. and Maurelli, A.T. (2001). Shigella flexneri LuxS quorum- sensing system modulates virB expression but is not essential for sensing system modulates virB expression but is not essential for virulence. Infect. Immunol. 69: 15–23. virulence. Infect. Immunol. 69: 15– de Kievit, T.R. and Iglewski, B.H. (2000). Bacterial quorum sensing in pathogenic relationships. Infect. Immunol. 68: 4839–4849. in pathogenic relationships. Infect. Immunol. 68: 4839– ———. 1999b. Sequence and function of LuxU: A two-component phosphorelay protein that regulates quorum sensing in Vibrio phosphorelay protein that regulates quorum sensing in Vibrio harveyi. J. Bacteriol. 181: 899–906. harveyi. J. Bacteriol. 181: 899– Freeman, J.A., Lilley, B.N., and Bassler, B.L. (2000). A genetic analysis of the functions of LuxN: A two-component hybrid sensor analysis of the functions of LuxN: A two-component hybrid sensor kinase that regulates quorum sensing in Vibrio harveyi. Mol.Microbi. kinase that regulates quorum sensing in Vibrio harveyi. Mol.Microbi. 35: 139– : 139– Hanzelka, B.L., Parsek, M.R., Val, D.L., Dunlap, P.V., Cronan,Jr., J.E., and Greenberg, E.P.(1999). Acylhomoserine lactone synthase J.E., and Greenberg, E.P.(1999). Acylhomoserine lactone synthase activity of the Vibrio fischeri AinS protein. J. Bacteriol. 181: 5766– activity of the Vibrio fischeri AinS protein. J. Bacteriol. 181: 5766– Arevalo-Ferro, C., Hentzer, M., Reil, G., Görg, A., Kjelleberg, S., Givskov, M., Riedel, K., and Eberl, L., (2003). Identification of Givskov, M., Riedel, K., and Eberl, L., (2003). Identification of quorum-sensing regulated proteins in the opportunistic pathogen quorum-sensing regulated proteins in the opportunistic pathogen Pseudomonas aeruginosa by proteomics. Environmental Microbio. Pseudomonas aeruginosa by proteomics. Environmental Microbio. 5(12): (12): Shiner, E.K., Rumbaugh, K.P., Williams, S.C., (2005) Interkingdom signaling: Deciphering the language of acyl homoserine lactones. signaling: Deciphering the language of acyl homoserine lactones. Mol. Microbio. 55 (4), Mol. Microbio. 55 (4),

43 43Murat Kemal AVCI_GYTE Kasım_2005


"GEBZE YÜKSEK TEKNOLOJİ ENSTİTÜSÜ MÜHENDİSLİK VE FEN BİLİMLERİ FAKÜLTESİ BAKTERİLER ARASI İLETİŞİMDE. QUORUM-SENSİNG MEKANİZMASI,. AHL SİNYAL MOLEKÜLLERİ." indir ppt

Benzer bir sunumlar


Google Reklamları