PCR Temelli Genetik Analiz Yaklaşımları

Slides:



Advertisements
Benzer bir sunumlar
PCR -Polimeraz Zincir Reaksiyonu-
Advertisements

PCR&REAL TIME PCR Araş.Gör.Ayhan ÜNLÜ.
AFLP VE DNA DİZİLEME DENEYSEL AŞAMALARININ KARŞILAŞTIRILMASI
AFLP (Çoğaltılmış Parça Uzunluk Polimorfizimi)
In vitro DNA AMPLİFİKASYONU PCR
Genetik ve Vücut Kompozisyonu
SÜTÇÜ İNEKLERDE DÖL TUTMA
PCR Temelli Genetik Analiz Yaklaşımları
SUBTRAKTİF MELEZLEME.
PCR (POLİMERAZ ZİNCİR REAKSİYONU)
PPD DIŞI SPESİFİK TBC TESTLERİ
Biyoteknoloji ve Genetik II
Akdeniz Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı
(Polymerase Chain Reaction)
Mutasyon Analiz Teknikleri I
ADLİ BİLİMLER VE BİYOLOJİ Dr. K.Üner Ülküer
AFLP (Amplified Fragment Lenght Polymorphism)
Biyoteknoloji ve Genetik II
Genetik Analiz Deneylerinin Tasarımı
Direkt Mutasyon Analiz Teknikleri
Mutasyon Analiz Teknikleri I
Mutasyon Analiz Teknikleri III
TIBBİ BİYOLOJİ ANABİLİM DALI DÖNEM I ÖĞRENCİ LABORATUVARI / 2
Genetik Analiz Deneylerinin Tasarımı
FEN VE TEKNOLOJİ 8.SINIF DNA VE GENETİK KOD.
Papilloma ve Polyomaviruslar
 Ölçme: Gözlem yapıp sonuçları sembollerle ifade etme.
GENOM PROJELERİ Prof. Dr. Hilal Özdağ.
PCR Temelli Genetik Analiz Yaklaşımları
5 Esneklik BÖLÜM İÇERİĞİ Talebin Fiyat Esnekliği
CASE FAIR OSTER Prepared by: Fernando Quijano & Shelly Tefft.
Ölçme Sonuçlarının Değerlendirilmesi
EŞ YÜKSELTİ EĞRİLERİNİN (TESVİYE EĞRİLERİNİN)
Mutasyon Analiz Teknikleri I
Genetiği Değiştirilmiş Organizmalar
Proje Lideri Mehmet Emin VURAL Araştırmacılar : Ahmet KARATAŞ (GAPUTAEM) Necdet AKAY (BDUTAEM) Yrd. Doç. Dr. Selahattin KİRAZ (H.Ü.Z.F.) Doç. Dr. Seyrani.
FEN VE TEKNOLOJİ 8.SINIF DNA VE GENETİK KOD.
ANA SORU: Bir genin kopyalanması (duplikasyonu) nasıl kansere neden olur?
In situ Hibridizasyon (ISH, FISH, GISH, CGH)
C-KONJUGASYON Genetik bakımdan seks ayrıcalığı gösteren iki bakteri hücresinin yan yana gelip aralarında oluşacak geçici bir hücre birleşmesi ile bakteriden.
GENOMİK.
Araş. Gör. Dinçer göksülük
DÜŞÜK BASINÇ KOŞULLARININ DOKU KÜLTÜRÜNDE ANTİ-PROLİFERATİF VE APOPTOTİK ETKİLERİNİN MOLEKÜLER MEKANİZMASININ ARAŞTIRILMASI Gül Özcan Arıcan1, Walid Khalilia2,
Reverse Transkriptaz ile cDNA Üretimi
B- GENETİK MÜHENDİSLİĞİ ve REKOMBİNANT ÜRÜNLER
Gen Klonlama Basamakları
ADLİ BİLİMLER VE BİYOLOJİ Dr. K.Üner Ülküer
Düzenli ve uygun sıcaklık sistemi Boyamada optimizasyon
Ankara Üniversitesi Sağlık Bilimleri Fakültesi Sosyal Hizmet Bölümü
Polimorfizm/Mutasyon tarama teknikleri
cDNA kütüphanesi yapımı
KALITSAL MOLEKÜLÜN BİÇİMİ ve ORGANİZASYONU
PROTEİN SAFLAŞTIRMA TEKNİKLERİ SOUTHERN BLOT TURGUT ZENGİN.
PCR Temelli Genetik Analiz Yaklaşımları
Prof. Dr. Hilal Özdağ A.Ü Biyoteknoloji Enstitüsü Merkez Laboratuvarı
Mutasyon Analiz Teknikleri I
Bitkilerde Fonksiyonel Genombilim
PCR Temelli Genetik Analiz Yaklaşımları
BİYOİNFORMATİK.
PCR Temelli Genetik Analiz Yaklaşımları
Eş Zamanlı RT-PCR (qRT-PCR)
ROBOTİK SUNU
Araştırma Metodolojisi
DNA Dizilimi ve Gen İfadesi Düzeyinde Varyasyon
Replikasyon genetik materyalin tamamen kendi benzeri yeni bir molekül oluşturma işlemi
NİŞANTAŞI ÜNİVERSİTESİ
DNA 2 Hücrelerdeki yönetici molekül DNA’dır. Hücrelerdeki yönetici molekül DNA’dır. Bir canlıya ait tüm özellikler DNA’da saklanır. Bir canlıya ait tüm.
GENOMİK.
T.C ONDOKUZ MAYIS ÜNİVERSİTESİ ZİRAAT FAKÜLTESİ REAL-TİME PCR İLKER TOKLUCU MEHMET HAN BAŞTÜRK TARIMSAL BİYOTEKNOLOJİ BÖLÜMÜ    2019-SAMSUN  
ONDOKUZ MAYIS ÜNİVERSİTESİ ZİRAAT FAKÜLTESİ TARIMSAL BİYOTEKNOLOJİ ANABİLİM DALI GENOMİKLER DERSİ Tarımsal Biyoteknolojide Mobil Genetik Elementlerin.
Sunum transkripti:

PCR Temelli Genetik Analiz Yaklaşımları Hafta XII PCR Temelli Genetik Analiz Yaklaşımları EŞ ZAMANLI PCR Prof. Dr. Hilâl Özdağ

Son nokta tespitindeki eksiklikler (End point detection) Düşük hassasiyet Düşük çözünülürlük Otomasyon eksikliği Yalnızca boy belirlenebilmesi Sonuçların rakamsal olarak ifade edilmemesi EtBr ile boyamanın nicelik belirlemede etkin olmaması PCR sonrası işleme devam gereği (agaroz jel elektroforezi) www.appliedbiosystems.com

Eş zamanlı PCR Geleneksel PCR’a Karşı www.appliedbiosystems.com

Geometrik artış fazı/ Plato etkisi www.appliedbiosystems.com

Örnekler arası miktar farkının gözlendiği aşama www.appliedbiosystems.com

Eş Zamanlı PCR Sistemleri

Eş zamanlı PCR’da saptama yöntemleri Çift zincirli DNA’ya bağlanan boyalar (SYBR Green; LC Green) Hidroliz probları (Taqman probları) Hibridizasyon probları

SYBR Green

SYBR Green www.appliedbiosystems.com

Hidroliz Probları www.appliedbiosystems.com

Hidroliz Probları www.appliedbiosystems.com

Hibridizasyon Probları www.appliedbiosystems.com

Gen ifadesinin bağıl olarak ölçümü

Gen ifadesinin bağıl olarak ölçümü

Referans/Standart Gen Zorunlu İdare Genleri (Housekeeping Genes) Her dokuda hücre hayatiyetini temin için mutlak suretle ifadelenen genlerdir. İfade düzeylerinin doku/hücreler arası değişmediği düşünülmektedir.

Zorunlu İdare Genleri Her Dokuda Eş Düzeyde mi İfadelenir? Vandesompele J ve ark, 2002, Genome Biology, 3: 7

Gen ifadesinin bağıl olarak ölçümü E= 10-1/slope

Erime Eğrisi (Melting Curve) Roche “PCR Applications Manual”

Erime Eğrisi ile Genotipleme Roche “PCR Applications Manual”

Erime Eğrisi ile Genotipleme Roche “PCR Applications Manual”