DNA Dizilimi ve Gen İfadesi Düzeyinde Varyasyon

... konulu sunumlar: "DNA Dizilimi ve Gen İfadesi Düzeyinde Varyasyon"— Sunum transkripti:

1 DNA Dizilimi ve Gen İfadesi Düzeyinde Varyasyon
Prof. Dr. Hilâl Özdağ

2 Genom-Transkriptom DNA mRNA Protein Genom Transkriptom Proteom

3 Mikrosatellitler Basit ve kısa dizi tekrarları (short tandem repeats-STR) 2, 3, 4, 5 nt’lik tekrarlar Allel sayısı çeşitli İnsan genomunda her 100kb’de bir.

4 Mikrosatellitler

5 TNP’ler Tekli Nükleotid Polimorfizmleri 2 alleli bulunur.
İnsan genomunda yaklaşık her 600 bç’de bir tekrarlanır.

6 TNP’ler Nature. 409: 929

7 TNP’lerin tanımlanması
ASA

8 TNP’lerin tanımlanması
RFLP Yabanıl Tip Allel AGATCT TCTAGA RE kesim bölgesi Mutant allel AGAGCT TCTCGA RE bölgesi kaybolmuş

9 TNP’lerin tanımlanması
RFLP Yabanıl Tip Allel AGATCT TCTAGA RE kesim bölgesi Mutant allel AGAGCT TCTCGA RE bölgesi kaybolmuş

10 TNP’lerin tanımlanması

11 TRANSKRİPSİYON

12 Gen ifadesinin bağıl olarak ölçümü

13 Gen ifadesinin bağıl olarak ölçümü

14 Gen ifadesinin bağıl olarak ölçümü

15 Gen ifadesinin bağıl olarak ölçümü
E= 10-1/slope