RETİNA GÖRÜNTÜLERİNDE YAŞA BAĞLI MAKULA DEJENERASYONUNUN (ARMD) İSTATİSTİKSEL YÖNTEMLERLE SEGMENTASYONU Uğur ŞEVİK Karadeniz Teknik Üniversitesi İstatistik.

Slides:



Advertisements
Benzer bir sunumlar
TOPRAĞIN HİKAYESİ HORİZON: Toprağı meydana getiren katmanlara horizon adı verilir. TOPRAK: Toprak taşların parçalanması ve ayrışmasıyla meydana gelen,
Advertisements

Yanık, Donma ve Sıcak Çarpması
Mastarlar.
Prof.Dr.Mehmet Tunç ÖZCAN
Entegre Savaş Zararlı ve hastalık etmenlerine karşı kullanılan çeşitli yöntemlerin birbirini tamamlayıcı, ekosistemdeki dengeyi koruyucu şekilde uygulanmaları...
HİPOTEZ TESTLERİNE GİRİŞ 1. Şu ana kadar örneklemden elde edilmiş istatistiklerden yararlanarak, kitle parametresini kestirebilmek için nokta tahmini.
Biçimbilimsel Özniteliklerin Eş-Oluşumlarına Dayalı Doku Betimleme Okan Üniversitesi Bilgisayar Mühendisliği Bölümü / İstanbul İzzet Özen Erchan Aptoula.
AKIL (ZİHİN) HARİTASI.
Arş.Gör.İrfan DOĞAN.  Bugün otizm tedavisinde en önemli yaklaşım, özel eğitim ve davranış tedavileridir.  Tedavi planı kişiden kişiye değişmektedir,
Öğretim Teknolojileri ve Materyal Geliştirme
DİYARBAKIR 2008.
ŞEKER(DİABETES MELLİTUS DM) HASTALARININ YAŞAM KALİTESİNİ ARTIRMAK İÇİN YAPILMASI GEREKENLER Şeker ya da diyabet denilen hastalık genellikle kalıtsal ve.
KİRİŞ YÜKLERİ HESABI.
YAKUP KAYA SABİT BAĞLANTILAR SABİT BAĞLANTILAR 1.MEKANİKSEL EKLER 1.MEKANİKSEL EKLER 2.FÜZYON EKLER 2.FÜZYON EKLER.
Tırmanma Oğlaklar için Davranışsal bir Gereksinim mi ? Türker Savaş, Cemil Tölü, Hande Işıl Akbağ, Baver Coşkun, İ. Yaman Yurtman Çanakkale Onsekiz Mart.
DİRENÇ. Cisimlerin elektrik akımını geçirirken gösterdiği zorluğa direnç denir. Birimi ohm olup kısaca R ile gösterilir. Devredeki her elemanın direnci.
HİPOTEZ TESTLERİNE GİRİŞ Şu ana kadar örneklemden elde edilmiş istatistiklerden yararlanarak, kitle parametresini kestirebilmek için nokta tahmini.
ÖZEL TANIMLI FONKSİYONLAR
TEMELLER.
ÇOK BOYUTLU SİNYAL İŞLEME
Çoklu Doğrusal Bağlantı X3X3 X2X2 r X 2 X 3 = 1 Tam Çoklu Doğrusal Bağlantı.
ARAZİ TESVİYESİ.
GELİŞİMLE İLGİLİ ARAŞTIRMA YÖNTEM VE TEKNİKLERİ
FOTOSENTEZ HIZINA ETKİ EDEN FAKTÖRLER
BİLİMSEL ARAŞTIRMA YÖNTEMLERİ ÜNİTE 3
Yaşa Bağlı Makula Dejenerasyonu
IR SPEKTROKOPİSİ.
T- Testİ: ORTALAMALAR ARASI FARKLARIN TEST EDİLMESİ
MİKROEKONOMİ YRD. DOÇ. DR. ÇİĞDEM BÖRKE TUNALI
Yapay Sinir Ağı Modeli (öğretmenli öğrenme) Çok Katmanlı Algılayıcı
ÇOCUKLUK DÖNEMİNDE YARATICILIK VE SANAT EĞİTİMİ
TANIMLAYICI İSTATİSTİKLER
Mutlak Dağılım Ölçüleri Nispi Dağılım Ölçüleri
İŞ SAĞLIĞI VE GÜVENLİĞİ KARŞILAŞTIRMA ÖLÇÜTLERİ
Kırınım, Girişim ve Müzik
Sağlık Bilimleri Fakültesi
Sağlık Bilimleri Fakültesi
GÖRÜŞME İLKE VE TEKNİKLERİ Sağlık Bilimleri Fakültesi
ÖDE5024 DAVRANIŞ BİLİMLERİNDE İSTATİSTİK Yüksek Lisans
Temel Bilgisayar Bilgileri
PARAMETRİK HİPOTEZ TESTLERİ
Gözde Görüntü Oluşumu ve Göz Kusurları
NİŞANTAŞI ÜNİVERSİTESİ
Ölçü transformatorları
SAMSUN EĞİTİM VE ARAŞTIRMA HASTANESİ
Kemal AKYOL, Şafak BAYIR, Baha ŞEN
NİŞANTAŞI ÜNİVERSİTESİ
NİŞANTAŞI ÜNİVERSİTESİ
NİŞANTAŞI ÜNİVERSİTESİ
ÖDE5024 DAVRANIŞ BİLİMLERİNDE İSTATİSTİK Yüksek Lisans
Evren-Örneklem, Örnekleme Yöntemleri 2
ZTM321 MAKİNE ELEMANLARI 10.hafta
NİŞANTAŞI ÜNİVERSİTESİ
DİL GELİŞİMİ KURAMLARI - I
EĞİTİME GİRİŞ Mehmet Akif Ersoy Üniversitesi
ÇİFT SİLİNDİR İNFİLTROMETRE İLE İNFİLTRASYON TESTLERİ
Gelişim ve Temel Kavramlar
NİŞANTAŞI ÜNİVERSİTESİ
2. Isının Işıma Yoluyla Yayılması
HİPOTEZ TESTLERİ.
Kesikli Olay benzetimi Bileşenleri
KARIK SULAMA YÖNTEMİ Prof. Dr. A. Halim ORTA.
Dönem 2 Biyoistatistik Uygulama
TOPLUMSAL TABAKA ve SINIFLAR
Nimet IŞIK Mehmet Akif Ersoy Üniversitesi İlköğretim Bölümü
Bilgehan Arslan, Süreyya Gülnar
İŞ SAĞLIĞI ve GÜVENLİĞİ EĞİTİMİ
Bilimsel Araştırma Yöntemleri
Medİkal görüntülerde doktor – hasta bİlgİ gİzlİlİğİnİn sağlanmasI
KİMYA DERSİNİ SEVMENİN YOLU
Sunum transkripti:

RETİNA GÖRÜNTÜLERİNDE YAŞA BAĞLI MAKULA DEJENERASYONUNUN (ARMD) İSTATİSTİKSEL YÖNTEMLERLE SEGMENTASYONU Uğur ŞEVİK Karadeniz Teknik Üniversitesi İstatistik ve Bilgisayar Bilimleri usevik@ktu.edu.tr 28 Aralık 2018 Cuma

Konu Başlıkları 1 YBMD nedir? 2 Görüntü İyileştirme 3 3 Makulanın lokalize edilmesi 4 4 Makulanın Segmentasyonu 28 Aralık 2018 Cuma

1)Retina ve YBMD (ARMD - Age-Related Macula Dejeneration) - 1 Göz küresi 3 tabakadan oluşur. Bağ tabakası, damar tabaka ve sinir tabakası (retina) Sinir tabakası, gözün saydam tabakası ve lensinden kırılarak gelen ışıkların odaklanıp görüntünün oluştuğu yer. (Retina) Makula, retinanın merkezinde ve keskin görmeyi sağlayan ve gözde en çok kullanılan bölüm Burada, görüntünün algılanması için beyne iletimi sağlayan görme sinirleri bulunur YBMD genellikle 50 yaş üzeri hastalarda izlenir. 60 yaş üzerinde kalıcı görme kaybının başta gelen nedenidir, genellikle iki gözü etkiler YBMD ile görmeyi sağlayan hücrelerin sayısı azalır ve hücrelerde bazı maddeler birikmeye başlar Makulada küçük, sarı-beyaz hafifçe kabarık (drusen) ve değişik büyüklüklerde lezyonlar ortaya çıkar. 28 Aralık 2018 Cuma

Retina ve YBMD (ARMD - Age-Related Macula Dejeneration) - 2 YBMD olan hastada, tam merkezde gri renkte bir leke görür, baktığı yeri değil çevresini görmesi, düz çizgileri kırık, cisimleri eğri görmesi, cisimleri olduğundan küçük görmesi ve renk görme bozukluğu olabilir. Makuladaki hastalıkların takibinde Amsler Grid denilen bir test kullanılır (kareli kağıt testi) 28 Aralık 2018 Cuma

Retina ve YBMD (ARMD - Age-Related Macula Dejeneration) - 3 YBMD, iki türü vardır. Kuru tip ve yaş tip. Kuru tip yukarıdaki oluşumlardan kaynaklanır. Yaş tip ise damarlarda sızıntı ve kanamalardan kaynaklanmakta Bazı vitamin ve destekleyici ilaçlar ile kısmen tedavisi olabilir. Daha önemlisi anormal damarlanma tespit edildiğinde derhal lazerle yakılarak ilerlemesinin durdurulması gerekir, aksi halde 21 aylık takipte ¾ oranında yasal körlükle sonuçlanmakta Retina Görüntülerinin Elde Edilmesi Retina görüntüsü almadan önce ilaçla hastanın göz bebeği büyütülür ve hassas odaklı kameralarla görüntü alınır Fundus floresein anjiografi, koldaki toplardamardan renkli bir ilaç verilir ve seri olarak retina resimleri alınır 28 Aralık 2018 Cuma

Retina Görüntüleri Normal Retina Görüntüsü Floresein anjiografi Retina Görüntüsü 28 Aralık 2018 Cuma

2) Retina Görüntüsünün İyileştirilmesi(Image Enhancement) 2.1) Histogram Eşitleme (Equalization) Parlaklık dağılımlarının normal dağılıma sahip olmadığı ve dar aralıklı bir parlaklık histogramına sahip olduğu durumlarda kullanılır. Frekansı yüksek piksel seviyesi, geniş piksel alanına yayılır Düşük frekanslı piksel seviyesi ise dar piksel alanına yerleştirilir Yoğun olan piksel seviyeleri belirgin hale getirilerek detaylar daha iyi algılanır Piksellerin karşıtlık değerleri iyileştirilmiş olur Makula lokalizasyonunda başarılı olmuştur. 28 Aralık 2018 Cuma

2.2) Histogram Eşitleme Uygulaması 28 Aralık 2018 Cuma

3) Makulanın lokalize edilmesi 3.1 Optik diskin algılanması Optik diskin algılanmasında kullanılan bazı özellikler; Optik diskin parlaklık değeri Çap uzunluğu (yaklaşık 1.8 mm) Alanı (yaklaşık 2.7 mm2) Retina üzerindeki damarların bir hiperbol çizerek optik disk bölgesinde kesişmesi 28 Aralık 2018 Cuma

3.2) Makulanın algılanması Makulanın algılanmasında kullanılan bazı özellikler; Sağlıklı bir makulanın merkezi siyah parlaklık değerine yakındır Etrafında kılcal damarlar yoğundur Ayrıca makula ile optik diskin arasındaki sabit mesafede göz önüne alınabilir 28 Aralık 2018 Cuma

4) Makula Segmentasyonu Sağlıklı bölgelerin istatistiksel özelliklerinden yararlanarak makula bölgesinin analizi Öncelikle makula çevresindeki sağlıklı bölgelerin öz temsil karesi (ÖTK) dediğimiz ve sağlıklı bölgeleri istatistiksel olarak temsil edebilecek en küçük kare seçilir. Seçilen bu ÖKT sağlıklı bölgeleri temsil eder. Öz Temsil Kare (ÖTK) boyutu (11x11) 121 ÖTK’nın ortalama parlaklık değeri 90 Ortalama parlaklık değeri frekansı 23 varyans 2 Std.sapma (roundlanmış hali) 1 Maksimum parlaklık değeri Maksimum parlaklık değeri frekansı ÖTK’nın istatisitksel değerleri tutulur 28 Aralık 2018 Cuma

4.1) Dağılımların Karşılaştırılması ve Hata Hesabı -1 ÖTK’nın ortalama parlaklık değerinden varyans kadar sağdaki ve soldaki değerler, ÖTK boyutunda tarama yaptığımız diğer karelerin histogramlarıyla karşılaştırılarak aradaki mutlak hata bulunur. Mutlak _Hata = 3+2+2+3+3 Mutlak_Hata = 13 28 Aralık 2018 Cuma

4.1) Dağılımların Karşılaştırılması ve Hata Hesabı -2 Bizim belirlediğimiz hata eşiği altında tüm resim taranır ve bu hatanın altındaki karelerin dağılımları ÖTK’ya benzediği varsayılarak sağlıklı olarak işaretlenir. Burada hata eşiği değiştirilerek optimum segmentasyon gözlenebilir. İkinci bir etken de maksimum parlaklık değeridir. Yukarıda ortalamanın sağı ve solu analiz edilirken buna ek olarak ta max değere göre analiz yapılır. Max değere göre analiz yöntemi ort. değere göre yapılan analize tamamlayıcı faktör olarak alabiliriz. Çünkü, max değere göre yapılan tarama kenarlara doğru daha iyi yaklaşım göstermiştir. 28 Aralık 2018 Cuma

4.1) Dağılımların Karşılaştırılması ve Hata Hesabı -3 Yaşa Bağlı Makula Dejenerasyonu olan retina görüntüsü Drusen ve lezyonların segmentasyon sonucunda belirlenmesi Segmentasyon yapılmış resim üzerinde damarlarında algılandığı görülmektetir. Bu yöntemin damar bulma analizinde de başarılı olacağı görülmektedir. Fakat burada damarların elenmesi gerektiği için şuan ki çalışmalar o yöndedir. 28 Aralık 2018 Cuma

Sonuç Önemli olan hata miktarının optimum biçimde tespit edilmesidir. Retina görüntülerindeki hastalıkların çoğu birbirine benzemediğinden ve retina dokularının farklılaşmasından dolayı tüm hastalıklar için bir hata payı veya eşiği belirleyip otomatik olarak bu değerle tarama yapmak yanlış olabilmektedir. Bu nedenle hata eşiği, görsel bilgilere dayandırılarak, elle seçilmektedir. Burada hata eşiğinin belirlenmesi tamamen klinik testler ve deneyimlere göre yapılmalıdır. Sistemin daha başlangıç aşamasında olduğu düşünülürse hata eşiğinin tüm durumları göz önünde bulundurarak doğru olarak belirlenmesi gelecekteki önemli çalışmalarınızdan biri olacaktır. 28 Aralık 2018 Cuma

Teşekkürler Uğur ŞEVİK usevik@ktu.edu.tr Karadeniz Teknik Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi İstatistik ve Bilgisayar Bilimleri 61080 - TRABZON 28 Aralık 2018 Cuma