Sunum yükleniyor. Lütfen bekleyiniz

Sunum yükleniyor. Lütfen bekleyiniz

PBS Betiği Hazırlama ve PBS Komutları I. Ulusal Yüksek Başarım ve Grid Konferansı 15-18 Nisan 2009, ODTÜ, Ankara

Benzer bir sunumlar


... konulu sunumlar: "PBS Betiği Hazırlama ve PBS Komutları I. Ulusal Yüksek Başarım ve Grid Konferansı 15-18 Nisan 2009, ODTÜ, Ankara"— Sunum transkripti:

1 PBS Betiği Hazırlama ve PBS Komutları I. Ulusal Yüksek Başarım ve Grid Konferansı Nisan 2009, ODTÜ, Ankara

2 TR-Grid Okulu, TAEK, ANKARA İÇERİK –PBS Betik Dili –PBS Seçenekleri –PBS Betiğinin Hazırlanması –PBS Komutları –Uygulamalar I. Ulusal Yüksek Başarım ve Grid Konferansı, ODTÜ, Ankara

3 TR-Grid Okulu, TAEK, ANKARA PBS İşleri –PBS’in temel işlevi gönderilmiş olan işleri yönetmektir. Sisteme gönderilmiş olan her iş: –İhtiyaç duyulan kaynakları tanımlayabilir, –Öncelik belirtebilir, –Çalışma zamanını belirleyebilir, –Çalışmasının başlama ve bitiş zamanında e-posta gönderebilir, –Diğer işler ile zamanlama uyumunu sağlayabilir. I. Ulusal Yüksek Başarım ve Grid Konferansı, ODTÜ, Ankara

4 TR-Grid Okulu, TAEK, ANKARA PBS Kullanımı –En basit anlamda, PBS ile birlikte iş çalıştırabilmek için: –Bir PBS betiği oluşturmak (ornek.sh) –qsub komutu yardımıyla hazırlanan işi kuyruk sistemine göndermek gerekmektedir. –Gönderilen iş tamamlandıktan sonra, çalışma dizininizde, –İşİsmi.eİşNumarası –İşİsmi.oİşNumarası –olmak üzere standart hata ve standart çıktı dosyaları oluşturur. I. Ulusal Yüksek Başarım ve Grid Konferansı, ODTÜ, Ankara

5 TR-Grid Okulu, TAEK, ANKARA PBS Betik Dili I. Ulusal Yüksek Başarım ve Grid Konferansı, ODTÜ, Ankara –PBS Betikleri, herhangi bir betik dilinde yazılabilir: csh, bash, tcsh, sh, perl, etc. –Hazırlanan betiğin çalıştırılabilir olması önemli değil, göndermek istediğiniz işin çalıştırılabilir olması önemlidir. –PBS betiğinin ana yapısını şu şekilde özetleyebiliriz: –PBS seçenekleri –Shell komutları –Çalıştırmak istediğiniz dosyanız ve bu dosyanın parametreleri

6 TR-Grid Okulu, TAEK, ANKARA PBS Seçenekleri #PBS –V : İşin gönderildiği shellden çevre değişkenlerinin taşınmasını sağlar. #PBS –l : İşin gereksinim duyduğu kaynakları listeler. –#PBS –l nodes=2:ppn=2 –#PBS –l mem=4gb –#PBS –l walltime=10:00:00 #PBS –N: İşin ismini belirler. –#PBS –N hello_world #PBS –q : İşin gönderildiği kuyruğu ve bu kuyruğun bulunduğu PBS sunucusunu tanımlar. –#PBS –q #PBS –M : İş ile ilgili bilgilendirmelerin gönderileceği e-posta adresini belirler. –#PBS –M #PBS –m : İş ile ilgili bilgilendirme durumlarını belirler. –#PBS –m bae : [b]egin, [a]bort, [e]nd I. Ulusal Yüksek Başarım ve Grid Konferansı, ODTÜ, Ankara

7 TR-Grid Okulu, TAEK, ANKARA PBS Betikleri - I SSH terminallerinden: Sunucu adı: lufer.ulakbim.gov.tr Kullanıcı Adı: egitimxx Kullanıcı Şifresi: xxxxxxx $ cd pbs $ ls -la I. Ulusal Yüksek Başarım ve Grid Konferansı, ODTÜ, Ankara

8 TR-Grid Okulu, TAEK, ANKARA PBS Betikleri - II /home_palamut2/egitim/egitimxx/pbs/ornek_pbs1.sh Kendi derlediğimiz bir C kodu /home_palamut2/egitim/egitimxx/pbs/ornek_pbs2.sh Mevcut sistem komutlarından “hostname” komutu /home_palamut2/egitim/egitimxx/pbs/ornek_pbs3.sh Hello World MPI kodu I. Ulusal Yüksek Başarım ve Grid Konferansı, ODTÜ, Ankara

9 TR-Grid Okulu, TAEK, ANKARA PBS Komutları I. Ulusal Yüksek Başarım ve Grid Konferansı, ODTÜ, Ankara PBS işinin silinmesini sağlarqdel Belirli bir kullanıcının PBS işlerini gösterirqstat –u Bir PBS işinin ayrıntılı durumunu gösterirqstat –f Yığın işleri PBS sunucuya teslim ederqsub

10 TR-Grid Okulu, TAEK, ANKARA PBS Komutları - qsub qsub [seçenekler] betik_dosyası –PBS betiği içinde yer alan, PBS seçeneklerini qsub komutu ile birlikte komut satırından da vermemiz mümkündür. –qsub –l nodes=4:ppn=2 betik_dosyasi –qsub –l mem=4gb betik_dosyasi –... Detaylı bilgi için Torque PBS qsub yardım dosyalarından edinilebilir. I. Ulusal Yüksek Başarım ve Grid Konferansı, ODTÜ, Ankara

11 TR-Grid Okulu, TAEK, ANKARA PBS Komutları - qstat qstat [seçenekler] I. Ulusal Yüksek Başarım ve Grid Konferansı, ODTÜ, Ankara –Bir işin durumu: –E : İş çalışmış ve bitti (ended) –H : İş beklemeye alındı (held) –Q : İş kuyrukta bekliyor (queued) –R : İş çalışıyor (running) –W: İş çalışma zamanını bekliyor (waiting)

12 TR-Grid Okulu, TAEK, ANKARA PBS Komutları – qstat, qdel qstat -u {kullanici_adi} I. Ulusal Yüksek Başarım ve Grid Konferansı, ODTÜ, Ankara qdel {is_numarasi}

13 TR-Grid Okulu, TAEK, ANKARA Uygulamalar - I I. Ulusal Yüksek Başarım ve Grid Konferansı, ODTÜ, Ankara –SSH terminallerinden: –Sunucu adı: lufer.ulakbim.gov.tr –Kullanıcı Adı: egitimxx –Kullanıcı Şifresi: xxxxxxx $ cd pbs $ less helloworld.c $ gcc –o helloworld helloworld.c $ less ornek_pbs1.sh $ qsub ornek_pbs1.sh $ qstat –u egitimxx $ ls –lrt $ less helloworld.out

14 TR-Grid Okulu, TAEK, ANKARA Uygulamalar - II I. Ulusal Yüksek Başarım ve Grid Konferansı, ODTÜ, Ankara $ less ornek_pbs2.sh $ qsub ornek_pbs2.sh $ qstat –u egitimxx $ ls –lrt $ less hostname.out

15 TR-Grid Okulu, TAEK, ANKARA Uygulamalar - III I. Ulusal Yüksek Başarım ve Grid Konferansı, ODTÜ, Ankara $ module avail $ module {un}load tr-10-ulakbim/library/mpich-1.2.7p1/gcc $ module list $ less MPItest.c $ mpicc –o MPItest MPItest.c $ less ornek_pbs3.sh $ qsub ornek_pbs3.sh $ qstat –u egitimxx $ ls –lrt $ less mpitest.out

16 TR-Grid Okulu, TAEK, ANKARA


"PBS Betiği Hazırlama ve PBS Komutları I. Ulusal Yüksek Başarım ve Grid Konferansı 15-18 Nisan 2009, ODTÜ, Ankara" indir ppt

Benzer bir sunumlar


Google Reklamları