Sunuyu indir
Sunum yükleniyor. Lütfen bekleyiniz
1
Amino Asitler ve Proteinler
Ankara Üniversitesi Veteriner Fakültesi Biyokimya Anabilim Dalı Dr. Tevhide SEL
2
Zwitter iyon - Amfoter bileşik
Hem negatif hem de pozitif yük bulunan iyonlara Alman bilimadamlarınca bu ad verilmiştir (Zwitter iyon). +H3N – CH2 – COO- pI =izoelektrik nokta pH a. a , pI da zwitter iyon şeklindedir.
3
a.a. Asit ve baz özellikleri
a.a amfoter bileşiklerdir Hem asit (proton verir) hem de baz (proton alır) gibi davranırlar.
4
Düşük pH da, proton konsantrasyonu [H+] yüksektir
Düşük pH da, proton konsantrasyonu [H+] yüksektir. Hem amino hem de korboksil grupları protonlanır (- NH3+, -COOH) Yüksek pH da, proton konsantrasyonu düşüktür. Hem amino hem de korboksil grupları proton verir. (- NH2, -COO- ) Nötral pH da, amino grubu protonlanır ve karboksil grubu ise proton verir. (- NH3+, -COO- )
5
Glisini farklı pH da gösterelim
H2N – CH2 - COOH pH=1: pH=7: pH=12:
6
H2N – CH2 - COOH pH=1: +H3N – CH2 - COOH pH=7: pH=12:
7
H2N – CH2 - COOH pH=7: +H3N – CH2 – COO- pH=12:
pH=1: +H3N – CH2 - COOH pH=7: +H3N – CH2 – COO- pH=12:
8
H2N – CH2 - COOH pH=7: +H3N – CH2 – COO- pH=12: H2N – CH2 – COO-
pH=1: +H3N – CH2 - COOH pH=7: +H3N – CH2 – COO- pH=12: H2N – CH2 – COO-
9
Peptit bağ
10
Peptit bağ Kovalent bağdır
Proteinleri denatüre eden şartlarda kırılmaz, ancak çok yüksek sıcaklıkta, uzun süre güçlü asit ve bazlarla işlem yapıldığında ya da enzimlerle kırılabilir
11
Peptit bağ Genellikle trans şeklindedir
Polar ama yüksüzdür. Bağ yapısındaki –CO ve –NH grupları yüksüzdür(proton alıp-vermez) ancak polar olduğundan H bağı oluşumuna katılır (örn. -Helix, β-tabaka)
12
Peptit bağ Parsiyel çift bağ özelliğindedir
Bağ etrafında rotasyon yapmaz,ancak ana karbonla amino ve karboksil grubunun yaptığı bağda rotasyon olabilir Çok sayıda a.a bağlanmasıyla oluşan dallanmamış zincire polipeptid denir
13
Peptit bağ Polipeptid yazarken serbest amino uç sola(N-terminal), karboksil uç sağa(C-terminal)yazılır Peptid bağa katılan gruplar proton alıp-vermez, polipeptidde yüklü gruplar N-terminal, C-terminal ve R-gruplarıdır.
14
Peptid bağ Peptid (< 50 amino asid) protein (> 50 amino asid)
15
Proteinlerin yapısı Primer yapı…… aa dizisi Sekonderyapı… -Helix
Tersiyer yapı…. polipeptid zincir Kuaternar yapı.. birden fazla alt ünite
16
Primer yapı Bir proteindeki lineer a.a dizisine denir
Proteinin üç boyutlu yapısını oluşturmak için gerekli bilgiyi taşır
17
Sekonder yapı(-helix, - yapısı) H bağları etkili-zayıf ama çok sayıda
Polipeptid zincirinin uzun ekseni boyunca oluşturduğu yapıyla ilişkilidir. Özellikle fibröz proteinlerde belirgindir.
18
-helix, Her karbonil oksijen diğer sarmal dönüşteki N-H hidrojenle H bağı yapar
N bağlı H ile 4 a.a sonraki karbonil grubunun O arasında H bağı oluşur, 1-4, 2-5, 3-6 a.a NH2 ve CO grupları arasında H bağı oluşur. Her sarmalde 3,6 a.a yer alır. R grupları sarmal yapının dışında kalır.
19
Örn. Saç ve derideki alfa-keratin, Hb büyük bölümü
Prolin, valin, izolösin ve aromatik a.a birbirleriyle etkileşime girebildiklerinden heliks yapıyı bozarlar, bu nedenle heliks yapıda daha az yer alırlar.
20
- tabakalı (paralel, antiparalel
Her karbonil oksijen komşu peptid N-H hidrojenle H bağı yapar, 2-5 polipeptid zinciri birbirine komşu yerleşir aralarında H bağı vardır. aynı zincir üzerine katlanabilir
21
Antiparalel - yapısı Komşu polipeptid zincirler ters yönde uzanır
22
Paralel - yapısı Komşu polipeptid zincirler aynı yönde uzanır
23
-kıvrım,alt alta dizilen
antiparalel B-tabakaları birbirine bağlayan yapılardır Genellikle 4 a.a oluşur Tekrarlamayan sekonder yapılar, rastgele kıvrımlardır.
24
Tersiyer yapı Proteinin 3 boyutlu yapısıdır
Birbirinden oldukça uzakta olan bulunan a.a arasında etkileşim kurulur. -helix ve -tabaka yapıları içerir A.a yan zincirleri proteinin nasıl katlanacağını belirler Biyolojik aktivite kazanır
25
Globuler proteinlerin yapısında yer alır.
Yapıda kovalent ve kovalent olmayan etkileşimler/ bağlar vardır. H-bağı,NH, SH, OH ile COO-, C=O arasında kurulur, nonkovalent
26
Elektrostatik (iyonik) etkileşim, negatif ve pozitif yüklü gruplar arasında kurulur, nonkovalent
Van der Waals etkileşimleri, birbirine çok yakın gruplar arasında olan çekim kuvvetleridir, nonkovalenttir Disülfid bağı, kovalenttir, -SH grupları arasında –S-S- köprüleri kurulur
27
Kuarterner yapı tersiyer yapıyı tamamlayan alt üniteler bir araya gelir. Birden fazla polipeptid zincirden oluşur Oligomerik proteinler denir, her bir zincire alt birim veya monomer
28
Alt birimler aynı yada farklı olabilirler
Alt birimler nonkovalent bağ ile bağlanır Örn. Hb, bazı enzimler
Benzer bir sunumlar
© 2024 SlidePlayer.biz.tr Inc.
All rights reserved.