ASTIM GENETİĞİ:2006 GEN KEŞFİNDE UZUN VE DOLANBAÇLI BİR YOL

Slides:



Advertisements
Benzer bir sunumlar
Çocuklarda Sublingual İmmünoterapinin Sistemik ve Lokal Yan Etkileri
Advertisements

KORUNMA ÖNLEMLERİ NE KADAR ETKİN? Dr. A. Füsun Kalpaklıoğlu.
DERİ TESTLERİ SÜLEYMAN YILMAZ.
Diabetik Nefropati Son dönem böbrek yetmezliğinin 1/3 nedenidir ve görülme sıklığı hızla artmaktadır. Tip 1 DM otoimmün mekanizma; insülin ve C-peptit.
Bronşiyal astma Tanım Etiyoloji Patogenez Morfoloji.
GELİŞİME ETKİ EDEN FAKTÖRLER
ASTIM Kronik hava yolu inflamasyonu
Astım’ da Tanı Yaklaşımı
EKOSİSTEMLERDE DEĞİŞKENLİK
EVRİMSEL DEĞİŞİM MEKANİZMALARI
Genetik ve Vücut Kompozisyonu
Bu çalışma için herhangi bir kurumdan maddi destek alınmamıştır.
Hışıltılı Çocukta Tanı
Gene Set Enrichment Analysis (GSEA)
Biyoteknoloji ve Genetik
Hakan Öktem Orta Doğu Teknik Üniversitesi
1. 2 SERUM ÖRNEKLERİNDE HDV VİREMİ BELİRLEMEDE ANTİ-HDV ENZİM İMMUNOASSAY GÖSTERGESİ Dr. Özlem Aydemir Doç. Dr. Mehmet Özdemir 3.
Biber Gazı Maruziyeti Sonrası Gelişen, Hayatı Tehdit Edici Hapşırık E. Özdemir, E. Karabiber, G. Karakaya, A. F. Kalyoncu Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesi.
ALLERJİ, ALLERJİK RİNİT ve ASTIM
Allerji ve Allerjik Nezle: Hastalık Belirtileri ve Tanısı
Hazırlayan:Stj.Dr.Yasin YARDİBİ Prof.Dr.Itır YEĞENAĞA
KRONİK BÖBREK HASTALIĞI TANI ve YAKLAŞIM
GELİŞİM PSİKOLOJİSİ.
MADDE BAĞIMLILIĞI Bağımlılığa Yatkınlıkta Genlerin Rolü
BRONŞ ASTIMI PROF.DR.A.FUAT KALYONCU HACETTEPE TIP FAKÜLTESİ
PULMONER REHABİLİTASYON ve EVDE BAKIM MERKEZİ
GRUP TESTOSTERON Öğretim Üyesi : Doç. Dr. Haşim BOYACI
Epidemiyolojik Araştırma Tipleri ve Bazı Temel Kavramlar R. Erol Sezer
Günümüz genomik çağında modern tıp
HOŞGELDİNİZ HOŞGELDİNİZ UĞURBAYRAMOĞLU. BİYOENFORMATİK  biyolojik problemlerin çözümünde bilişim teknolojilerinin kullanılması.
Erken Çocukluk Döneminde
Biyoinformatik.
Proje Lideri Mehmet Emin VURAL Araştırmacılar : Ahmet KARATAŞ (GAPUTAEM) Necdet AKAY (BDUTAEM) Yrd. Doç. Dr. Selahattin KİRAZ (H.Ü.Z.F.) Doç. Dr. Seyrani.
Serum sT4 düzeyleri obez kadınlarda kilo verme tedavisinin etkinliği ile ilişkilidir Dr. Ceyhun YURTSEVER KTÜ Aile Hekimliği ABD Aralık 2015.
GENETİK ve ÇEVRESEL TEMELLER
KARDİYAK REHABİLİTASYON
Giriş ve Amaç: Sigara kullanımı dünyadaki önlenebilir ölüm nedenlerinin başında gelmektedir. Bu ölümlerin çoğu düşük ve orta gelirli ülkelerde oluşmakta,
Astım Gelişmesini ve Ortaya Çıkmasını Etkileyen Faktörler
Yrd.Doç.Dr.Özgür ALDEMİR TIBBİ GENETİK AD.
OKUL ÇAĞI ÇOCUKLARINDA ASTIM RİSK FAKTÖRLERİ Dr.Mehmet Seyhan A Acta Pædiatrica , 1606–1610.
Astımda özel durumlar fatih türkmensoy. astım ve gebelik 1/3, 1/3, 1/3 İlaç alamalıyım ? Bebeğe bir zararı olur mu ?
ÇOCUKLUK DÖNEMİNDE IG G2 DÜZEYLERİNDEKİ DÜŞÜKLÜK PEDIATRICS Volume 120, Number 3, September 2007 Dr. Cem BECERİR
Comt Val158Met Polimorfizminin Obez Erişkinlerdeki Önemi Avşar, Orçun 1,2,3 ;Kuşkucu, Aysegül 2 ; Sancak, Seda 4 ;Genç, Ece 1 1 Tıbbi Farmakoloji Anabilim.
Tek-gen Hastalıkları.
YAŞLILARDA SERUM B12 VİTAMİNİ, FOLAT VE PLAZMA HOMOSİSTEİN DÜZEYLERİ
PROSTAT KANSERİ TANISI KONMUŞ HASTALARDA KEMİK SİNTİGRAFİSİNİN SAĞ KALIM SÜRESİNİ ÖNGÖRMEDEKİ DEĞERİ Elif Marangoz, Doğangün Yüksel, Olga Yaylalı, Suna.
Ezgi Günger, Medine Taşdemir, Selin Kaymaz, Alize Yılmazlar, Asiye Gok
Otozomal Dominant Kalıtım
1Ebru D.Yenilmez, 1Abdullah Tuli, 2Abdi Bozkurt, 2Esmeray Acartürk
VİTAMİN D EKSİKLİĞİ VE ASTIMLI ÇOCUKLARDA ASTIM ŞİDDETİNE ETKİSİ
ÇOCUKLARDA SOLUNUM SİSTEMİ HASTALIKLARI VE HEMŞİRELİK BAKIMI
DOÇ. DR. MÜDRİYE YILDIZ BIÇAKÇI
Çekirdek Dışı Kalıtım.
POPULASYON GENETİĞİ.
Fonksiyonel MR Görüntüleme
Arş.Gör.Dr.Kevser Ayar KTÜ Tıp Fakültesi Aile Hekimliği AD
POPULASYON PARAMETRELERİ
Biyoteknoloji ve Genetik II
Gen Bağlılığı Crossing Over Kromozom Haritaları
Araç Takip ve Güzergah Planlama Sistemi
Alerjik hastalıklarda tanı
GENETİK MATERYAL DNA ve RNA’dır. DNA nedir? RNA nedir?
Çocuklarda Solunum Yolu Enfeksiyonu ve Astım Kontrolü
Aile Hekimliği Anabilim Dalı
GELİŞİM DÖNEMLERİ İÇİNDE RUH SAĞLIĞI İLKELERİ
GENOMDA GEN Yakın akraba bakteri türlerinde genom dizilerinin çok benzer olduğunun belirlenmesi ile birlikte, bakteriyal genomlara bakış açımız kökten.
UYKUDA GASTROİSTESTİNAL SİSTEM
Op. Dr. Deniz OLUKLU 03/02/2019.
VAKA SUNUMU Arş. Gör. Dr. Kevser AYAR KTÜ Tıp Fakültesi
Sunum transkripti:

ASTIM GENETİĞİ:2006 GEN KEŞFİNDE UZUN VE DOLANBAÇLI BİR YOL Genes and Immunity (2006) 7, 95–100 Dr.Cem BECERİR 19.11.2007

Astım ve atopi hem genetik hem de çevresel faktörlerden etkilenen kompleks fenotiplerdir Yaklaşık 500 sayfalık bir derleme astım ve atopi fenotipini 6 veya daha fazla popülasyonda 25 gen ile ilişkilendirmiştir 2 ila 5 popülasyonda ise 54 ek gen daha belirlenmiştir.

ADAY GENLER VE YAYGIN GENOM BAĞLANTILI ÇALIŞMALAR Bu yaklaşımın avantajları ve dezavantajları yıllardır tartışılmaktadır Burada 2006 perspektifinden bazı konulara bakılacaktır Bu çalışmaların ana avantajı : Hem aday genleri veya yolları Hem de genlerin daha geniş fenotipik etkilerini tanımlayabilmektir.

Daha önceki çalışmalardan gelen inanış: Tipik olarak genetik çalışmalarda kullanılan örneklerden sadece yaygın olarak etkilenen genlerin sinyal verecekleridir Eğer çeşitli popülasyonlarda aynı bölge ile ilişki tanımlanmışsa bu kısmen doğru kabul edilebilir Bununla birlikte artık daha açık görülmektedir ki: Astım veya onunla ilişkili fenotiplerin çoğu belki de tamamı çeşitli popülasyonlarda birden fazla lokusla ilişkilidir

Astım veya atopi ile ilişkili olarak en çok gözlenen ve iyi tanımlanmış kromozomlar: 5q31-33 6p21 12q13-q24

En azından 14 gen 5q bölgesinde astım veya atopik fenotip ile ilişkilendirilmektedir Bunlar çok bilinen genlerdir: IL 4 IL 13 CD 14 ADRB2 SPINK5 LTC4S Aynı pozisyonda olan CYFIP2 geni çevresel faktörlerle (CD14,TIM1) ve ilaç cevabını etkileyen ADRB2 geni ile güçlü bir ilişki göstermektedir.

6p21 kromozomundaki ilgili bölge HLA bölgesindedir: Hem klasik hem de klasik olmayan HLA genleri ile TNF LTA TAP kodlayan genlerle ilişkilidir Birçok değişik toplumda astım fenotipi ile ilişkilendirilmiştir.

12q üzerindeki geniş bir bölgede VDR geni proksimal uçta NOS1 geni distal uçta IFNG geni bulunmaktadır Üçü de çeşitli örneklerle astım ve atopi ile ilişkilendirilmiştir

6p21 deki HLA-G geni 5q deki CYFIP2 geni 20p deki ADAM33 geni gibi pozisyonu tespit edilen genler şüphelenilen lokasyonlara yakın pozisyondadırlar.

Geçen yıl, kompleks hastalıklarda vaka kontrollü çalışmalar kullanılarak yaygın genom çalışmasında tek nükleotid polimorfizmi ile ilişkili ilk raporlara şahit olmuştur Gelecek aylarda da benzer çok sayıda rapor yayınlanacaktır.

Bunun gibi birçok fenotip bu durumla ilişkilidir Astım, allerjik rinit ve atopik dermatitin klinik gidişinin altında farklı genetik yapı yatmasına rağmen birçok gen ve yol ilk atak, gidiş ve hastalığın ciddiyetini etkilemektedir. Bunun gibi birçok fenotip bu durumla ilişkilidir Bronşial hiperreaktivite Akciğer fonksiyonları, Total ve spesifik IgE aynı genlerden etkilenmektedir.

Örneğin IL 4 genindeki fonksiyonel -589 c/T promoter polimorfizmi, spesifik olarak astım atopik dermatit allerjik rinit total serum IgE spesifik IgE (ev akarlarına karşı) akciğer fonksiyonları ile ilgili olarak FCER1B geninde Gly237 glu aminoasid polimorfizmi spesifik olarak bronş hiperreaktivitesi spesifik IgE ile ilgili olarak dünyada farklı popülasyonlarda saptanmıştır.

Daha önceki derlemede 64 gen (en azından bir çalışmada pozitif ilişki saptanmış) tanımlanmıştır Bu genler arasında 33 gen en azından ikinci bir çalışma 8 gen 5 veya daha fazla çalışma ile saptanmıştır Son yayından yaklaşık 2 yıl sonra bugün, 118 gen astım ve atopi ile ilişkili olarak saptanmıştır.

54 gen……… 2-5 bağımsız örnekleme ile 10 gen……… > 10 dan fazla örnekleme ile saptanmış ve toplamda 492 sayfada rapor edilmiştir.

ilişkilerini kapsamaktadır İki yıl öncesi ile bugün arasındaki en önemli fark daha önceki çalışmalar : daha geniş örneklemleri ve kontrol gruplarını çeşitli varyantları ve haplotipleri gen-gen ve gen-çevre ilişkilerini kapsamaktadır Daha geniş gruplar prensip olarak tip1 ve tip 2 hata oranlarını azaltmakla birlikte varyantların çeşitliliği Haplotipler Etkileşimler tip 1 hata oranlarını artırmaktadır

astım veya atopi ile ilişkilendirilen genler: 10 dan fazla çalışmada astım veya atopi ile ilişkilendirilen genler: IL4 IL13 ADRB2 TNF HLA-DRB1 FCER1B IL4RA tıpkı CD14, HLA-DQB1 ve ADAM33 gibi belirlenmiştir. İlk pozisyonu belirlenen astım ilişkili gen olan ADAM33 astım ve benzeri fenotiplerde 10 dan fazla bağımsız çalışmada gösterilmiştir.

Dahası son meta analizlerde hem pozitif hem negatif çalışmalar kombine edilmiş ve 8 popülasyonda ADAM33 teki genel tek nükleotid polimorfizmi için sapma oranının 1.46 (p:0,0001) olduğu saptanmıştır ST+7 olarak söylenmektedir(riskli allel sıklığı astımlılarda %84.9,kontrolde %79.1 olarak saptanmıştır)

Ek olarak 15 gen ……….6-10 çalışmada diğer bir pozisyonu saptanan GRPA gibi saptanmıştır. En geniş gen grubu astım ve atopi ile ilişkili olarak …….2-5 bağımsız çalışmada belirlenmiştir Burada da üç genin pozisyonu DPP10, HLA-G PFH11 saptanmıştır.

Son olarak 39 gen astım ve allerjik fenotiple ilgili tek bir örneklemde belirlenmiştir Bunlardan 24 gen tek bir çalışmada yayınlanmış, 15 gen bir veya daha fazla çalışmada ilişkilendirilmiştir Bu grupta en fazla lokalize edilen gen: CYFIP2

Özetlemek gerekirse; 25 gen astım ve atopi ile ilişkilendirilmekle birlikte 6 veya daha fazla çalışmada hiçbir gen astım geni olarak tanımlanmamıştır Bu,etyolojinin kompleks olduğunu göstermektedir ve en çok etkileşimin risk açısından gen-gen ve gen-çevre ilişkisinde olduğunu göstermektedir.

Astım ve atopi belirgin olarak heterojen fenotipe sahiptir. Artmış risk İlk ortaya çıkış yaşı Ciddiyeti çeşitli biyolojik yollardan ve çevresel faktörlerden etkilenmektedir Sürpriz olmamakla birlikte ilgili genler çeşitli yollarda farklı fonksiyon ve etkilere sahiptir Bu hastalıklarla ilişkili genlerin sayısı bilinmemekle birlikte oldukça fazla olduğu düşünülmektedir.

Bu literatürün temelinde ; Risk oluşturan gen sayısının 100 ü aşabileceği ve bu genlerle bireysel etkinin hastalık riskini az miktarda arttırdığını düşünmekteyiz Bununla birlikte herhangi bir hastalık fenotipinde birkaç gen çeşitliliğine neden olabilir. Dahası daha az sayıdaki gen her bir şahıs için risk oluşturabilir. Astım ve atopik hastalıklı hastaların moleküler fenotiplerinin ortaya konması,önümüzdeki on yılda genetik ilaçlarının bulunmasında ve tedaviye karar vermede bize yol gösterecektir