PCR Temelli Genetik Analiz Yaklaşımları Hafta XI PCR Temelli Genetik Analiz Yaklaşımları DNA FRAGMENT ANALİZİ Doç. Dr. Hilâl Özdağ
DNA FRAGMENT ANALİZİ STR/SSR/Microsatellit Analizi Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) Loss of Heterozygosity (LOH) MI (Microsatellite Instability) SNP Genotipleme
DNA FRAGMENT ANALİZİ Boy tayini Agaroz jel elektroforezi Agaroz NuSieve Metaphor Poliakrilamid jel elektrofezi Kapiller elektroforez Genetik analizör (Otomatik DNA Dizi Analiz Sistemi) Qiagen Egene Agilent Bioanalyzer
DNA FRAGMENT ANALİZİ Boy tayini Agaroz jel elektroforezi Agaroz NuSieve Metaphor Johnson N et al, BMC Med Gen., 2004, 5 http://www.med.yale.edu/genetics/ward/tavi/p15.html
DNA FRAGMENT ANALİZİ Boy tayini Agaroz jel elektroforezi/PAGE http://www.med.yale.edu/genetics/ward/tavi/p15.html
DNA FRAGMENT ANALİZİ Boy tayini PAGE ANALYTICAL BIOCHEMISTRY 253, 130–132 (1997) http://www.med.yale.edu/genetics/ward/tavi/p15.html
DNA FRAGMENT ANALİZİ Kapiller Elektroforez Genetik Analizör
DNA FRAGMENT ANALİZİ Kapiller Elektroforez Genetik Analizör STR/Microsatellite Analysis RFLP/AFLP/TRFLP
DNA FRAGMENT ANALİZİ 10pleks
DNA FRAGMENT ANALİZİ Fragment boylarının tespiti
DNA FRAGMENT ANALİZİ Elektroferogramların karşılaştırılması
DNA FRAGMENT ANALİZİ L O H Heterozigot PCR
DNA FRAGMENT ANALİZİ L O H
DNA FRAGMENT ANALİZİ QIAxcel/EGene 0.5 kb’den küçük fragmentler için 3-5 bç’ine dek ayırım sağlar. Hazır kapiller kartuşlarının içindeki polimerin içinde çok düşük konsantrasyonda EtBr bulunmaktadır. Aynı anda 96 örneğe kadar analizi gerçekleştirmek mümkündür. Sistemde RNA analizi yapmak da mümkündür. %2 agaroz
DNA FRAGMENT ANALİZİ Agilent/Bioanalyzer
DNA FRAGMENT ANALİZİ Agilent/Bioanalyzer