PCR Temelli Genetik Analiz Yaklaşımları

Slides:



Advertisements
Benzer bir sunumlar
PCR&REAL TIME PCR Araş.Gör.Ayhan ÜNLÜ.
Advertisements

PCR (POLİMERAZ ZİNCİR REAKSİYONU)
PPD DIŞI SPESİFİK TBC TESTLERİ
(Polymerase Chain Reaction)
PCR Temelli Genetik Analiz Yaklaşımları
Mutasyon Analiz Teknikleri I
Genetik Analiz Deneylerinin Tasarımı
Mutasyon Analiz Teknikleri III
TIBBİ BİYOLOJİ ANABİLİM DALI DÖNEM I ÖĞRENCİ LABORATUVARI / 2
Genetik Analiz Deneylerinin Tasarımı
PCR Temelli Genetik Analiz Yaklaşımları
Genetiği Değiştirilmiş Organizmalar
ANA SORU: Bir genin kopyalanması (duplikasyonu) nasıl kansere neden olur?
Hâsılat kavramları Firmaların kârı maksimize ettikleri varsayılır. Kâr toplam hâsılat ile toplam maliyet arasındaki farktır. Kârı analiz etmek için hâsılat.
SAKARYA SAĞLIK MÜDÜRLÜĞÜ İl Kanser Koordinatörü Uzm. Dr. Sevda Gürsel.
Avrupa Birliği Yaşamboyu Öğrenme Proğramı Grundtvig Learning Partnership Project.
KAS-İSKELET SİSTEMİ ve REJENERATİF TIP DOKTORA PROGRAMI
MOLEKÜLER BİYOLOJİDE KULLANILAN YÖNTEMLER II:
Weblog! Eğitimde Günlük Uygulaması. İçerik »Weblog »Kavramsal Tanımlama »Sınıflandırma »Eğitimde Weblog Uygulaması »Eğitim Sisteminde Yaygınlaşmamasının.
MOLEKÜLER BİYOLOJİDE KULLANILAN YÖNTEMLER II:
GEOMETRİK CİSİMLER VE HACİM ÖLÇÜLERİ
Arasınav ders ve temaları. Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı , Bahar, Trakya Üniv Tıp Fak 6. Kurul, Neşe Akış, PhD, Tıbbi Mikrobiyoloji.
YOZGAT TAPU VE KADASTRO XXII. BÖLGE MÜDÜRLÜĞÜ Takım Lideri : Elvan SİVAS Takım Raportörü : İsmail AKSOY Takım Üyeleri :Seval ŞAHİNER Onur EREN Hakan.
Temel Matematik 2 Diziler ve Seriler Temel Matematik 2 Diziler ve Seriler Ocak 2016 İ stanbul Üniversitesi Prof. Dr. Ergün Ero ğ lu İ Ü İ şletme Fakültesi.
BİY 440 Mİkrobİyal bİyoteknolojİ
Performans Değerlendirme
X-IŞINLARI KRİSTALOGRAFİSİ
B- GENETİK MÜHENDİSLİĞİ ve REKOMBİNANT ÜRÜNLER
Temel Matematik 2 9-Seriler Ocak 2016 İstanbul Üniversitesi
FOTOGRAMETRİ - I Doç. Dr. Eminnur AYHAN KTÜ GÜZ dönemi
Polimorfizm/Mutasyon tarama teknikleri
C-KONJUGASYON Genetik bakımdan seks ayrıcalığı gösteren iki bakteri hücresinin yan yana gelip aralarında oluşacak geçici bir hücre birleşmesi ile bakteriden.
Faj Vektörler 8-25 kb arası fragmentleri etkin olarak taşıyabilirler
PROTEİN SAFLAŞTIRMA TEKNİKLERİ SOUTHERN BLOT TURGUT ZENGİN.
Kalıtsal madde (kalıtsal molekül, genetik materyal)
PCR Temelli Genetik Analiz Yaklaşımları
İÇSU VE DENİZLERDE AVCILIK YÖNTEMLERİ
ZTM307 Makine ve Mekanizmalar Teorisi 3.Hafta
Yatay Gen Transferinin Hesaplanması
Mutasyon Analiz Teknikleri I
Karşılaştırmalı Yönetim
ASAL SAYILAR Nilsu Yurtseven
Bitkilerde Fonksiyonel Genombilim
PCR Temelli Genetik Analiz Yaklaşımları
NİŞANTAŞI ÜNİVERSİTESİ
Mikrodizin Teknolojisi ve Mikrodizin Veri Analizi
Eş Zamanlı RT-PCR (qRT-PCR)
DNA Dizilimi ve Gen İfadesi Düzeyinde Varyasyon
Örnekler: Eşitliklerini sağlayan a ve b değerlerini bilgisayarla nasıl bulursunuz? Bilgisayarla 40 n = 2 … 41 xb(1) = 1: xb(2) = 0: xh(1) = .001: xh(2)
Geçerlik ve Kullanışlılık
NİŞANTAŞI ÜNİVERSİTESİ ©
ELEKTRİK DEVRE TEMELLERİ
SPORDA TEKNİK ve TAKTİK ÖĞRETİM YÖNTEMLERİ
NİŞANTAŞI ÜNİVERSİTESİ
NİŞANTAŞI ÜNİVERSİTESİ ©
SÜTÇÜ İNEKLERDE DÖL TUTMA
Spor Atlarında Performans Artırıcı Maddelerin Analizleri ve Önemi
Biyoteknoloji İçin Mikrobiyoloji 1
Agrobacterium tumefaciens Aracılığıyla Bitkilere Gen Aktarımı
Ankara Üniversitesi Sağlık Bilimleri Fakültesi Sosyal Hizmet Bölümü
Hazırlayanlar Halime Eda SEFER Kübra ATALAY Ayşenur Efşan YARAR
Öğretmenlik Meslek Etiği
TOPLUMSAL TABAKA ve SINIFLAR
MAK-404 Takım Tezgahları Tasarımı
GENOMİK.
SERBEST RADİKALLER VE ANTİOKSİDANLAR 8
T.C ONDOKUZ MAYIS ÜNİVERSİTESİ ZİRAAT FAKÜLTESİ REAL-TİME PCR İLKER TOKLUCU MEHMET HAN BAŞTÜRK TARIMSAL BİYOTEKNOLOJİ BÖLÜMÜ    2019-SAMSUN  
T.C. ZİRAAT FAKÜLTESİ TARIMSAL BİYOTEKNOLOJİ BÖLÜMÜ OMİK TEKNOLOJİSİ
EŞ YÜKSELTİ (TESVİYE) EĞRİLERİNİN
NİŞANTAŞI ÜNİVERSİTESİ ©
Sunum transkripti:

PCR Temelli Genetik Analiz Yaklaşımları Hafta XIII PCR Temelli Genetik Analiz Yaklaşımları EŞ ZAMANLI PCR Prof. Dr. Hilâl Özdağ

Son nokta tespitindeki eksiklikler (End point detection) Düşük hassasiyet Düşük çözünülürlük Otomasyon eksikliği Yalnızca boy belirlenebilmesi Sonuçların rakamsal olarak ifade edilmemesi EtBr ile boyamanın nicelik belirlemede etkin olmaması PCR sonrası işleme devam gereği (agaroz jel elektroforezi) www.appliedbiosystems.com

Eş zamanlı PCR Geleneksel PCR’a Karşı www.appliedbiosystems.com

Geometrik artış fazı/ Plato etkisi www.appliedbiosystems.com

Örnekler arası miktar farkının gözlendiği aşama www.appliedbiosystems.com

Eş Zamanlı PCR Sistemleri

Eş zamanlı PCR’da saptama yöntemleri Çift zincirli DNA’ya bağlanan boyalar (SYBR Green; LC Green) Hidroliz probları (Taqman probları) Hibridizasyon probları

SYBR Green

SYBR Green www.appliedbiosystems.com

Hidroliz Probları www.appliedbiosystems.com

Hidroliz Probları www.appliedbiosystems.com

Hibridizasyon Probları www.appliedbiosystems.com

Gen ifadesinin bağıl olarak ölçümü

Gen ifadesinin bağıl olarak ölçümü

Referans/Standart Gen Zorunlu İdare Genleri (Housekeeping Genes) Her dokuda hücre hayatiyetini temin için mutlak suretle ifadelenen genlerdir. İfade düzeylerinin doku/hücreler arası değişmediği düşünülmektedir.

Zorunlu İdare Genleri Her Dokuda Eş Düzeyde mi İfadelenir? Vandesompele J ve ark, 2002, Genome Biology, 3: 7

Gen ifadesinin bağıl olarak ölçümü E= 10-1/slope

Erime Eğrisi (Melting Curve) Roche “PCR Applications Manual”

Erime Eğrisi ile Genotipleme Roche “PCR Applications Manual”

Erime Eğrisi ile Genotipleme Roche “PCR Applications Manual”