ÇEVRE MİKROBİYOLOJİSİ Prof.Dr. Gönül DÖNMEZ

KAYNAKLAR 1) Environmental Microbiology, Sharma, P.D. Alpha Science International Ltd. Harrow, U.K. 2005. 2) Microbial Ecology Fundamentals and Applications Atlas, R. M., Bartha, R. Wesley Longman Inc. 1997. 3) Environmental Microbiology (Second Edition), A Laboratory Manual. Pepper, I.L., Gerba, C.P. Elsevier Inc. 2004. 4) Microbial Biotechnology, Energy and Environment, Rajesh arora, CAB International, 2012 5) Güncel bilgiler için, konuyla ilgili süreli yayınlar ve internet siteleri kullanılacaktır.

Çevre Mikrobiyolojisi Mikrobiyel Ekoloji Mikroorganizmaların biyotik ve abiyotik çevreleri ile olan ilişkilerini inceleyen bir bilim dalıdır.

1. TARİHSEL GELİŞİM Saf kültür eldesi Louis Pasteur (1822-1895) Robert Koch (1843-1910)

Sergei Winogradsky (1856-1953) Winogradsky kolonu Nitrifikasyon bakterilerinin izolasyonu H2S, S ve Fe+2 oksidasyonu Kemolitotrofik gelişme

Martinus Beijerinck (1851-1931) Simbiotik (1888) ve Simbiotik olmayan (1901) aerobik azot fikse eden mikroorganizmaların izolasyonu, Sülfat redükleyen mikroorganizmaların izolasyonu Zenginleştirme ile izolasyon

Albert Jan Kluyver (1888-1956), Mikrobiyel metabolizma (oksidatif, fermentatif ve kemolitotrof metabolizma) Cornelius Bernardus van Niel (1897-1985), Bakteriyel fotosentez (bakterilerde H2S) Roger Stanier, organik bileşiklerin aerobik mikroorganizmalarla (Pseudomonas spp.) parçalanması Robert Hungate, Zorunlu anaerob mikroorganizmaların kütüre alınması (rumen ve termit barsak bakterileri ilişkileri)

Çevre Mikrobiyolojisinde kullanılan metotlar Biyoçeşitlilik Mikrobiyel populasyonların kültüre alınarak analizi Mikrobiyel populasyonların moleküler analizi Mikrobiyel aktivitenin belirlenmesi

Biyoçeşitlilik 1. Mikrobiyel populasyonların kültüre alınarak analizi Zenginleştirme ve izolasyon (azotsuz besiyerleri, winogradsky kolonu) Saf kültür izolasyonu (çizgi ekim, agar shake tüp metodu, sıvı seyreltme, optikal tweezers)

Biyoçeşitlilik 2. Mikrobiyel populasyonların moleküler analizi Boyama teknikleriyle canlılık ve sayının belirlenmesi Genetik boyama Özel genlerin belirlenmesi Çevresel genomik (Metagenomiks)

Mikrobiyel aktivitenin belirlenmesi Bir habitatdaki önemli metabolik reaksiyonların hem tipleri hem de oranları hakkında bilgi verir. Radyoizotoplar Mikroelektrotlar Stabil izotoplar