Case study Multi-country salmonella outbreak Eşleştirme Projesi TR 13 IB AG 03  Resmi kontroller, hayvan refahı, zoonozlar ve hayvansal yan ürünlere ilişkin kapasitenin geliştirilmesi “Güvenilir Gıda için Resmi Kontroller” Twinning Project TR 13 IB AG 03  Capacity Building regarding official controls, animal welfare, zoonoses and animal by-product management “Official Controls for Safe Food” Case study Multi-country salmonella outbreak Vaka çalışması Salmonella çoklu ülke salgını

Multicountry Salmonella Enteritidis outbreak Çoklu ülke Salmonella Enteritidis salgını - This case study is inspired by a real fact, that occured in 2014 (5 countries). - In compliance with Directive 2003/99, scientific articles on these kind of outbreak are regularly published. More information are available in www.eurosurveillance.org - These publications allow to improve countries on better diagnosis and control methods - Bu vaka çalışması 2014’te gerçekleşen gerçek bir olaya dayanmaktadır (5 ülke). 2003/99 Yönetmeliğine uygun olarak , bu tür salgınlara dair bilimsel makaleler düzenli olarak basılır. Daha fazla bilgi www.eurosurveillance.org adresinden alınabilir - Bu tür yayınlar, ülkelerin daha iyi teşhis koymasını ve kontrol tedbirlerini daha iyi uygulamasına imkan sağlamaktadır.

Case study Vaka çalışması 4 European countries (A, B, C, D) Human cases by country: A : 24 cases B : 61 cases (= France) C : 45 cases from 6 outbreaks D : 247 cases Salmonella Enteritidis phase type 14b An egg packing centre (country A) becomes the centre of attention 4 Avrupa ülkesi (A, B, C, D) Ülkelere göre insan vakaları: A : 24 vaka B : 61 vaka (= Fransa) C : 45 vaka 6 salgına dair D : 247 vaka Salmonella Enteritidis faj tip 14b Bir yumurta paketleme merkezi (ülke A) ilgi odağı haline gelmiştir.

Case study : question 1 Vaka çalışması : soru 1 1. Country D : analyse the graph of cases, compare to the timeline of events. When did the first and last case happen, when was the peak of cases ? First alert : country D first week of june country B end of July country C second week of July 1. D ülkesindeki vakaların haftalık olarak grafiğini analiz edin ve yukarıda tanımlanan olayların zaman süreci ile karşılaştırın. İlk ve son vaka ne zaman olmuş ve vakaların zirve yaptığı zaman ne zaman? ast case happen, when was the peak of cases ? Birinci uyarı : ülke D Haziran’ın birinci haftası ülke B Temmuz sonu ülke C Temmuzun ikinci haftası 15 local authorities (central, North West and South of the country) 15 yerel otoritesi (merkez, Ülkenin Kuzey batısı ve güneyi)

Case study : question 2 Vaka çalışması : soru 2 2. Why do you think there is always a delay between the peak of cases and the identification of a multy-country outbreak ? Irregular distribution of poisonned eggs, concerning both quantity, and timing (in country D, probably an important supply on may-june, interruption and knew supply in july-august) List all factors which contribute to such a delay: Quality of surveillance organisation in each country, on both food safety and human health Quality of laboratory test used Quality of exchange of information between countries eggs from country A : reports on « rapid alert system for food and feed » by country B (31 July) and country C (9 July and 1 August) 2. Vakaların zirve yapması ile salgının tanımlanması arasında neden her zaman bir gecikme olduğunu düşünüyorsunuz? Bu tür bir gecikmeye neden olabilecek faktörleri listeleyin. Zehirli yumurtaların düzensiz dağılımı, hem miktar hem de zamanlamayı içerecek şekilde (ülke D’de, mayıs-haziran da büyük olasılıkla önemli bir tedarik, aralık verme ve temmuz-ağustosta tekrar tedarik) Bu tür bir gecikmeye neden olabilecek faktörlerin listesi : Gıda güvenilirliği ve insan sağlığı konusundaki her ülkenin kurumundaki izlemenin kalitesi Kullanılan laboratuvar testlerinin kalitesi Ülkeler arasındaki bilgi alış verişinin kalitesi A ülkesinden yumurtalar : B ülkesi tarafından « gıda ve yem için hızlı alarm sistemi » raporları (31 Temmuz) ve C ülkesi (9 Temmuz ve 1 Ağustos)

Country D : result of food traceback investigation 247 cases linked to restaurants and take-aways, in different places across the country No eggs supplied by Company X were found for testing. Ülke D : Gıda geriye doğru izleme sonucu 247 vaka restoran ve al-götürlerle ilişkili ülkenin farklı yerlerinde X firması tarafından sağlanan yumurtalara dair test yumurta bulunamadığından yapılamamıştır.

Case study Question 3 Vaka çalışması Soru 3 3. Try to come up with suggestions on how to identify an outbreak as early as possible. Think about outbreaks which only affect one country. Patients are interviewed using a local questionnaire (foods they have eaten in the 5 days before onset of symptoms). Shops, restaurants and other food outlets are identified and, when a source is related to several cases, environmental or food samples are taken. 3. Bir salgının en erken şekilde tanımlanması için öneriler oluşturun. Sadece bir ülkeyi veya birden fazla ülkeyi etkileyen salgınları düşünün. Hastalar yerel bir anket kullanılarak sorgulandı(belirtilerin görülmesinden 5 gün öncesine kadar yedikleri yemekler). Dükkanlar, restoranlar ve diğer gıda sağlayıcılar belirlendi ve birden fazla vaka ile bağlantılı kaynaklar bulunduğunda, çevreden ve yemeklerden numuneler alındı.

Vaka çalışması : soru 4 Case study : question 4 4. A ülkesindeki otoritenin temsilcisisiniz Yapacağınız tüm eylemleri listeleyin. Araştırma: kontaminasyona dair tüm hipotezleri araştırın Firma X 4 alanda yumurtacı sürüye sahip : 3 tanesi A ülkesinde, 1 tanesi Çek Cumhuriyetinde. Hepsi genç tavukları (piliç) 2 yerden alır   → 2 yumurtacı sürüde geç kontaminasyon 4. You are a representative of the Competent Authority in country A. List all actions you would take. Investigation: explore all hypothesis of contamination Company X has 4 sites of laying flocks: 3 in country A, 1 in Czech Republic. All supplied on young chickens (pullets) from 2 sites  → late contaminations in 2 laying flocks Paketleme merkezi Çiftlik 1 ? Çiftlik 2 ?    Yem operatörü ? Piliç Packing centre Farm 1 ? Farm 2 ?    Feed business operator ? Pullets Yumurtaların analizi, kaynağın çoklu ülke salgını ile bağlantısını sağlamak için genetik kanıt sağlamıştır.Tedbirler iki çiftlikte de Ağustos 2014’te alınmıştır. Bunlar insan tüketiminden önce yumurtaların işlenmesini içermektedir. Analysis of eggs made the genetic evidence linking this source tothe multi-country outbreak Measures were taken in August 2014, at both farms. These included eggs processed before human consumption At one of the sites Salmonella found in chicken faeces and dust, along with eggs positive with the MLVA outbreak profile; at another site also found eggs positive for the outbreak strain Two asymptomatic carriers are identified, one of them being a member of staff at the packing centre.

Case study : question 6 Vaka çalışması : soru 6 6. Do you think routine phagetyping of all S.E. isolates, in all Member States, would help? What would be the advantages, what the disadvantages? Advantage: muti-country outbreak prevention, or good reactivity (recall of contaminated food) with limited human cases Disadvantage: price (high level of technicity needed), low capacity of analysis (phagetyping is sent only to the national referent laboratory) In this outbreak, whole genome sequencing (WGS) was used for the first time in ‘near real- time’ to define a multi-country Salmonella outbreak and inform public health control measures Initial WGS results were available by 26 August for different countries Multilocus variable-number tandem repeat analysis (MLVA) was used in august for the human isolates (countries A, B, C) and the eggs from company X 6. Tüm üye devletlerde tüm SE izolatlarından Rutin Faj tiplemenin (phagetyping) yardımcı olacağını düşünüyor musunuz? Avantajlar nelerdir, dezavantajlar nelerdir? Avantaj: çoklu ülke salgınlarının önlenmesi, veyasınırlı insan vakalarında iyi reaktivite (kontamine gıdanın geri çağırılması) Dezavantaj: ücret (yüksek derecede teknoloji gerekiyor), düşük analiz kapasitesi (faj tipleme sadece ulusal referans laboratuvarına gönderiliyor) Bu salgında, tüm genom sekansı (WGS) ilk defa çoklu ülke Salmonella salgınını belirlemek için «neredeyse gerçek zamanlı» olarak ve halk sağlığı kontrol tedbirlerinin bildirilmesi için kullanılmıştır. İlk WGS sonuçları farklı ülkeler için 26 Ağustos’ta hazır olmuştur. Multilocus variable-number tandem repeat analysis (Çok lokuslu değişken sayıda ardışık tekrar analizi) (MLVA) Ağustos’ta insan izolatlarında (ülke A,B,C) ve X firmasından yumurtalarda kullanılmıştır.

Conclusion Sonuç This multycountry Salmonella outbreak demonstrates : - the complexity of food supply investigations - the importance of cooperation within the EU. Information, both official and informal, exchange between European countries was important in detecting the outbreak and ensuring that public health actions were as timely as possible. Bu çoklu ülkeli Salmonella salgını şunları gösterir: - gıda tedariki araştırmalarının karmaşıklığı - AB içinde işbirliğinin önemi. Avrupa ülkeleri arasında resmi ve gayri resmi bilginin paylaşımı salgının belirlenmesinde önemliydi ve halk sağlığı ile ilgili tedbirlerin bir an önce alınmasını sağladı.

Thank you for your attention İlginiz için teşekkürler