Gaziantep Workshop, 19-21 Haziran 2008, Gaziantep Üniversitesi GRİD VERİ YÖNETİMİ TR ATLAS Gaziantep Grid Workshop 19-21 Haziran, 2008. Gaziantep Üniversitesi.

... konulu sunumlar: "Gaziantep Workshop, 19-21 Haziran 2008, Gaziantep Üniversitesi GRİD VERİ YÖNETİMİ TR ATLAS Gaziantep Grid Workshop 19-21 Haziran, 2008. Gaziantep Üniversitesi."— Sunum transkripti:

1 Gaziantep Workshop, 19-21 Haziran 2008, Gaziantep Üniversitesi GRİD VERİ YÖNETİMİ TR ATLAS Gaziantep Grid Workshop 19-21 Haziran, 2008. Gaziantep Üniversitesi

2 Gaziantep Workshop, 19-21 Haziran 2008, Gaziantep Üniversitesi Grid Veri Yönetimi Nedir? –Depolama Elemanları gLite Orta Katmanı –Dosya Adları ve Kataloğu –LFC ve Komutları –LFC Komutları-Örnekler Dosya ve Replika Yönetimi –LCG ve Komutları –LCG Komutları-Örnekler 1.Kısım 2. Kısım İÇERİK

3 Gaziantep Workshop, 19-21 Haziran 2008, Gaziantep Üniversitesi Grid Veri Yönetimi: –İşletim sistemi seviyesinde değil, dosya seviyesinde veriler ile ilgilenir. –Veriler salt-okunurdur ve farklı formatlarda olabilirler Değiştirilemezler Silinebilir, sonrasında yeniden oluşturulabilirler Kullanıcı Uygulamalar Veri Depolama Alanı Grid Veri Yönetimi Nedir?

4 Gaziantep Workshop, 19-21 Haziran 2008, Gaziantep Üniversitesi Depolama Elemanı (Storage Element)‏ –JDL (İş Tanımlama Dili) ile ancak 20 MB boyutundan küçük veriler gönderilebilir. –Büyük boyutta dosyaların tutulduğu bilgisayara Depolama Elemanı (SE) denir. –Depolama Elemanı, Hesaplama Elemanları(CE) ile neredeyse tüm sitelerde bulunur. –Kullanıcılar gibi uygulamalar da veri isteğinde bulunup, veri üretebilirler. Depolama Elemanları

5 Gaziantep Workshop, 19-21 Haziran 2008, Gaziantep Üniversitesi Depolama Elemanı (Storage Element)‏ –Grid üzerinde veri depolanmasını sağlayan servisleri içerir. –Kullandığı protokoller: GSIFTP: Depolama elemanı ve uygulamalar arasında güvenli, hızlı ve verimli dosya transferini sağlar. RFIO & gsiDCap: Depolama elemanlarında depolanan dosyalara doğrudan uzaktan erişimi sağlarlar. Depolama Elemanları

6 Gaziantep Workshop, 19-21 Haziran 2008, Gaziantep Üniversitesi Grid ortamında 4 farklı tip depolama elemanı mevcuttur: –ClassicSE –CASTOR –dCache –LCG Disk Pool Manager Depolama Kaynak Yönetimi (SRM)‏ –Pratik kullanımı sağlar Depolama Elemanları

7 Gaziantep Workshop, 19-21 Haziran 2008, Gaziantep Üniversitesi Grid Unique IDentifier (GUID)‏ –Grid de bulunan her bir dosya mutlaka bir GUID ile belirtilir –Dosyanın tüm replikaları aynı GUID ile paylaştırılır –guid: guid:38ed3f60-c402-11d7-a6b0-f53ee5a37e1d Logical File Name (LFN)‏ –GUID’si belirli olan kullanıcının belirlediği takma isim –lfn:/grid/ / / lfn:/grid/trgridb/deneme gLite Orta Katmanında Dosya Adları

8 Gaziantep Workshop, 19-21 Haziran 2008, Gaziantep Üniversitesi Storage URL(SURL) ya da Physical File Name(PFN)‏ –Dosyanın depolama elemanındaki gerçek alanına verilen isim (Dosyanın Grid'de fiziksel yerini tanımlar)‏ –Replika Yönetim Sistemi (RMS) tarafından dosyanın nerede tutulduğunu öğrenmek amacıyla kullanılır. –sfn:// / / sfn://se.ulakbim.gov.tr/data/trgridb/dosya1 Transport URL (TURL)‏ –Dosyanın depolama elemanında geçici olarak tutulduğu alan – :// / / gsiftp://se.ulakbim.gov.tr/data/trgirdb/dosya1 gLite Orta Katmanında Dosya Adları

9 Gaziantep Workshop, 19-21 Haziran 2008, Gaziantep Üniversitesi LFC –Grid servisi –GUID, LFN ve SURL’ler arasında eşleştirmeyi sağlar –Kayıt yaptırmış tüm dosyaların bilgisini tutar ve yayınlar –Yerel ya da genel olarak servis verebilir Grid Dosyası: Fiziksel olarak depolama elemanında yer alan, ve mantıksal olarak LFC kaydı yapılmış dosyalardır. gLite Orta Katmanında Dosya Kataloğu LCG File Catalogue - LFC

10 Gaziantep Workshop, 19-21 Haziran 2008, Gaziantep Üniversitesi GUID Xxxxxx-xxxx-xxx-xxx- Sistem Meta Verisi “size” => 10234 “cksum_type” => “MD5” “cksum” => “yy-yy-yy” Replika srm://host.example.com/foo/bar host.example.com Replika sfn://host.example.com/foo/bar host.example.com Sembolik Bağlantı / grid/dteam/mydir/mylink / grid/dteam/dir1/dir2/file1.root Kullanıcı Meta Verisi Kullanıcı Tanımlı Meta Veri gLite Orta Katmanında Dosya Kataloğu

11 Gaziantep Workshop, 19-21 Haziran 2008, Gaziantep Üniversitesi Veri Yönetimini iki temel seviye altında özetlenebilir. –Fiziksel Seviye : Depolama Elemanı (SE)‏ –Mantıksal Seviye: Dosya Katalogu (LFC)‏ Depolama Elemanları verilerin fiziksel olarak tutulduğu bilgisayarlardır. LFN'ler dosyaların metadata bilgisi ile (Dosyanın gerçek ismi, boyutu, erişim izinleri, düzenlenme zamanı gibi) birlikte Kataloga kaydedilir. Böylece, kullanıcılara tek bir UNIX sistem kullanılıyormuş izlenimi verilir. Veri Yönetimi Sistemi (Özet)

12 Gaziantep Workshop, 19-21 Haziran 2008, Gaziantep Üniversitesi Dosya katalogunun kullanılabilmesi için –Geçerli bir proxy sertifikasının oluşturulması gereklidir. –$LFC_CATALOG_TYPE, $LFC_HOST çevre değişkenlerinin tanımlanmış olması gerekmektedir: export LCG_CATALOG_TYPE=lfc export LFC_HOST=lfc.ulakbim.gov.tr –lfc-* komutları kullanılırken, LFC üzerinde işlem yapabileceğimiz dizinin /grid/sanal_organizasyon_adi (Örn: /grid/trgridb/)‏ olduğunu unutmamalıyız. Dizin yok ise, bu sanal organizasyon, depolama elamanı tarafından desteklenmiyordur. LFC Komutları

13 Gaziantep Workshop, 19-21 Haziran 2008, Gaziantep Üniversitesi – lfc-chmod: LFC dosya ya da dizininin erişim haklarını değiştirir – lfc-chown: LFC dosya ya da dizininin sahiplik bilgilerini değiştirir – lfc-delcomment : LFC dosya ya da dizininin eklenmiş yorum bilgisini siler – lfc-getacl: LFC dosya ya da dizininin erişim kontrol listesini alır – lfc-ln: LFC dosya ya da dizinine sembolik Link yaratır – lfc-ls : LFC’de dosya ve dizinleri listeler – lfc-mkdir: LFC dizin yaratır – lfc-rename: LFC dosya ya da dizininin dosya/dizin ismini değiştirir – lfc-rm: LFC dosya ya da dizinini siler – lfc-setacl: LFC dosya ya da dizininin erişim kontrol listesini tanımlar – lfc-setcomment: LFC dosya ya da dizininin üzerine yorum bilgisi ekler LFC Komutları

14 Gaziantep Workshop, 19-21 Haziran 2008, Gaziantep Üniversitesi lfc-ls: Verilen bir dizindeki LFN’leri listeler /grid/ / LFC İsimlendirmesi Kullanıcı tarafından tanımlanır $ lfc-ls –l /grid/trgridb/... -rw-rw-r-- 1 4401 4400 0 Jun 21 09:39 tutor14 -rw-rw-r-- 1 4401 4400 0 Jun 21 09:40 tutor16-mytxt -rw-rw-r-- 1 4401 4400 0 Jun 21 09:36 uploadfile -rw-rw-r-- 1 4401 4400 0 Jun 21 09:36 uploadfilelfn -rw-rw-r-- 1 4401 4400 0 Jun 21 09:38 user.example -rw-rw-r-- 1 4401 4400 0 Jun 21 09:38 user.example2... LFC Komutları - Örnekler

15 Gaziantep Workshop, 19-21 Haziran 2008, Gaziantep Üniversitesi $ lfc-ls –l /grid/trgridb/egitim_antep -rw-rw-r-- 1 176 108 18 Jun 20 10:37 user.example –Çalışmak istediğiniz ev dizinini belirtirseniz, her zaman girmek zorunda kalmazsınız. $ export LFC_HOME=/grid/trgridb/ $ lfc-ls –l egitim_antep -rw-rw-r-- 1 176 108 18 Jun 20 10:37 user.example LFC Komutları - Örnekler

16 Gaziantep Workshop, 19-21 Haziran 2008, Gaziantep Üniversitesi lfc-ln –s dosya/dizin link_adı : Sembolik bağlantı oluşturur: $ lfc-ln -s egitim_antep link_to_antep lfc-mkdir : Dizin oluşturur. $ lfc-mkdir Haziran2008-antep Oluşturulan dizini görmek için: $ lfc-ls -l Orijinal Dosya Sembolik Bağlantı LFC Komutları - Örnekler

17 Gaziantep Workshop, 19-21 Haziran 2008, Gaziantep Üniversitesi Meta verisi eklenmesi/çıkartılması –lfc-setcomment path aciklama LFC’deki bir dosya/dizine ilişkin açıklama ekler –lfc-delcomment path LFC’deki bir dosya dizine ait açıklamayı siler LFC Komutları - Örnekler

18 Gaziantep Workshop, 19-21 Haziran 2008, Gaziantep Üniversitesi lfc-setcomment $lfc-setcomment egitim_antep “Merhaba Antep” Eklediğimiz yorumu görmek için: $lfc-ls --comment egitim_antep /grid/gilda/egitim_antep Merhaba Antep lfc-delcomment $lfc-delcomment egitim_antep Silindiğini görmek için: $lfc-ls –l --comment egitim_antep -rw-rw-r-- 1 4401 4400 0 Jun 21 09:38 /grid/trgridb/egitim_antep LFC Komutları - Örnekler

19 Gaziantep Workshop, 19-21 Haziran 2008, Gaziantep Üniversitesi Grid Veri Yönetimi Nedir? –Depolama Elemanları gLite Orta Katmanı –Dosya Adları ve Kataloğu –LFC ve Komutları –LFC Komutları-Örnekler Dosya ve Replika Yönetimi –LCG ve Komutları –LCG Komutları-Örnekler 1.Kısım 2. Kısım İÇERİK

20 Gaziantep Workshop, 19-21 Haziran 2008, Gaziantep Üniversitesi LCG –Basit ve etkin dosya transfer yöntemidir. –Grid ortamına veri aktarımı ve grid ortamından veri alımı için kullanılır. –Aynı zamanda grid ortamında bulunan verilerin işlenmesini sağlar. Dosya ve Replika Yönetimi

21 Gaziantep Workshop, 19-21 Haziran 2008, Gaziantep Üniversitesi lcg-* komutlarını çalıştırabilmek için: –Geçerli bir proxy sertifikasına sahip olmak gereklidir. –$LCG_GFAL_INFOSYS çevre değişkenin tanımlanmış olması gerekmektedir. export LCG_GFAL_INFOSYS=bdii.ulakbim.gov.tr:2170 $LCG_GFAL_VO çevre değişkenin tanımlanması, lcg-* komutlarının kullanılmasında kolaylık sağlar. export LCG_GFAL_VO=trgridb LCG Komutları

22 Gaziantep Workshop, 19-21 Haziran 2008, Gaziantep Üniversitesi $VO_ _DEFAULT_SE çevre değişkeni: komutlarda kullanıcının depolama elemanı belirtmesine gerek kalmaz. export VO_trgridb_DEFAULT_SE=se.ulakbim.gov.tr LCG Komutları

23 Gaziantep Workshop, 19-21 Haziran 2008, Gaziantep Üniversitesi lcg-cp: Bir grid dosyasını yerel makinaya kopyalar ( download ) ‏ lcg-cr: Yerel makinadaki bir dosyayı SE’ye kopyalar ve LFC’ye kaydeder ( upload ) ‏ lcg-del: SE’deki bir dosyayı siler (bir replika ya da tüm replikalar olabilir) ‏ lcg-rep: Bir dosyayı bir SE’den başka bir SE’ye kopyalar ve LFC’ye kaydeder ( replicate ) ‏ lcg-aa: Verilen bir GUID’ye LFC’de takma isim ( alias ) ekler lcg-ra: Verilen bir GUID’nin LFC’deki takma ismini kaldırır lcg-rf: SE’deki bir dosyayı LFC’ye kaydeder lcg-uf: SE’deki bir dosyanın LFC’deki kaydını siler lcg-la: Verilen bir LFN, GUID ya da SURL takma isimlerini listeler lcg-lg: Verilen bir LFN ya da SURL’nin GUID’sini getirir lcg-lr: Verilen bir LFN, GUID ya da SURL’nin replikalarını listeler LCG Komutları

24 Gaziantep Workshop, 19-21 Haziran 2008, Gaziantep Üniversitesi lcg-cr: $lcg-cr -d se.ulakbim.gov.tr –l lfn:/grid/trgridb/egitim.out -v file:/home/egitim20/egitim.out –trgridb VO’sunun kullanıcısına ait –kullanıcı arayüzündeki /home/egitim20/egitim.out dosyasını –lfn:/grid/ trgridb/egitim.out LFC kaydı altında –se.ulakbim.gov.tr depolama elemanına –-v verbose özelliğini kullanarak kopyalar Komutun çıktısı –se.ulakbim.gov.tr’ye kopyalanan egitim.out dosyası için oluşturulmuş GUID geri döner: guid:5dfb82d2-c26a-444a-8c83-9d2c35d84d05 LCG Komutları - Örnekler

25 Gaziantep Workshop, 19-21 Haziran 2008, Gaziantep Üniversitesi lcg-rep: $lcg-rep –d eymir.grid.metu.edu.tr -v guid:5dfb82d2-c26a-444a- 8c83-9d2c35d84d05 –trgridb VO’sunun kullanıcısına ait, –guid:5dfb82d2-c26a-444a-8c83-9d2c35d84d05 ile saklanan dosyanın, –se02.grid.acad.bg isimli depolama elamanına replikasını oluşturur. LCG Komutları - Örnekler

26 Gaziantep Workshop, 19-21 Haziran 2008, Gaziantep Üniversitesi $lcg-rep –d torik1.ulakbim.gov.tr -v lfn:/grid/trgridb/egitim.out –trgridb VO’sunun kullanıcısına ait, –lfn:/grid/trgridb/egitim.out ile saklanan dosyanın –se02.grid.acad.bg isimli depolama elemanına replikasını oluşturur. LCG Komutları - Örnekler

27 Gaziantep Workshop, 19-21 Haziran 2008, Gaziantep Üniversitesi $lcg-rep –d torik1.ulakbim.gov.tr -v sfn://se.ulakbim.gov.tr/storage3/trgridb/generated/2006-11-10/fileX trgridb VO’sunun kullanıcısına ait, sfn://se.ulakbim.gov.tr/storage3/trgridb/generated/2006-11-10/fileX ile saklanan dosyanın, se02.grid.acad.bg isimli depolama elemanına replikasını oluşturur. LCG Komutları - Örnekler

28 Gaziantep Workshop, 19-21 Haziran 2008, Gaziantep Üniversitesi lcg-lr: $ lcg-lr lfn:/grid/trgridb/egitim.out –trgridb VO’sunun kullanıcısına ait, –LFC’de lfn:/grid/trgridb/test.out takma ismi ile saklanan, –tüm replikaları listeler. Komutun çıktısı: sfn://se.ulakbim.gov.tr/storage3/trgridb/generated/2006-11- 10/fileX sfn://se02.grid.acad.bg /storage/trgridb/generated/2007-02-11/fileY LCG Komutları - Örnekler

29 Gaziantep Workshop, 19-21 Haziran 2008, Gaziantep Üniversitesi lcg-lg: $ lcg-lg sfn://se.ulakbim.gov.tr/storage3/trgridb/generated/2006-11-10/fileX –trgridb VO’sunun kullanıcısına ait, –SE’de lfn://se.ulakbim.gov.tr/storage3/trgridb/generated/ 2006-11-10/fileX ile saklanan dosyanın, –GUID’sini göster. $ lcg-lg - lfn:/grid/trgridb/egitim.out –trgridb VO’sunun kullanıcısına ait, –LFC’de lfn:/grid/trgridb/egitim.out ile kayıtlı dosyanın, –GUID’sini göster. LCG Komutları - Örnekler

30 Gaziantep Workshop, 19-21 Haziran 2008, Gaziantep Üniversitesi lcg-cp: $ lcg-cp -t 100 -v lfn:/grid/trgridb/egitim.out file:///tmp/egitim.kopya – trgridb VO’sunun kullanıcısına ait, –LFC’de lfn:/grid/trgridb/egitim.out ile kayıtlı dosyayı, –-t timeout 100 saniye olacak şekilde, – kullandığımız kullanıcı arayüz makinasında /tmp/ altına egitim.kopya olarak, –- v verbose modda kopyalar. Diğer komutlarda da olduğu gibi lfn yerine guid ya da sfn de kullanılabilir. LCG Komutları - Örnekler

31 Gaziantep Workshop, 19-21 Haziran 2008, Gaziantep Üniversitesi lcg-del: $ lcg-del -s se.ulakbim.gov.tr guid:91b89dfe-ff95-4614-bad2- c538bfa28fac –trgridb VO’sunun kullanıcısına ait, –91b89dfe-ff95-4614-bad2-c538bfa28fac GUID’li grid dosyasının, –se.ulakbim.gov.tr’deki replikasını siler. $ lcg-del –a guid:91b89dfe-ff95-4614-bad2-c538bfa28fac –trgridb VO’sunun kullanıcısına ait, – 91b89dfe-ff95-4614-bad2-c538bfa28fac –GUID’li grid dosyasının tüm replikalarını siler. LCG Komutları - Örnekler

32 Gaziantep Workshop, 19-21 Haziran 2008, Gaziantep Üniversitesi lcg-aa: $ lcg-aa guid:91b89dfe-ff95-4614-bad2-c538bfa28fac lfn:/grid/trgridb/antep_yeni –trgridb VO’sunun kullanıcısına ait, –91b89dfe-ff95-4614-bad2-c538bfa28fac GUID’li grid dosyası için, –LFC’de lfn:/grid/trgridb/antep_yeni isimli yeni bir takma isim (alias) tanımlanmasını sağlar. lcg-la: Belirtilen GUID’ye ait bütün takma isimleri listeler. $lcg-la guid:91b89dfe-ff95-4614-bad2-c538bfa28fac Komutun çıktısı: lfn:/grid/trgridb/test.out (eski alias)‏ lfn:/grid/trgridb/yeni_alias (eklenen yeni alias)‏ LCG Komutları - Örnekler

33 Gaziantep Workshop, 19-21 Haziran 2008, Gaziantep Üniversitesi lcg-ra: $ lcg-ra - guid:91b89dfe-ff95-4614-bad2-c538bfa28fac lfn:/grid/trgridb/egitim.out –trgridb VO’sunun kullanıcısına ait, –91b89dfe-ff95-4614-bad2-c538bfa28fac GUID’li grid dosyası için, –LFC’deki lfn:/grid/trgridb/test.out alias’ını siler. $lcg-la guid:91b89dfe-ff95-4614-bad2-c538bfa28fac –Belirtilen GUID’ye ait bütün takma isimlerini listeler. –Komutun çıktısı: lfn:/grid/trgridb/yeni_alias test.out takma ismi silindiği için artık listede görünmemektedir. LCG Komutları - Örnekler

34 Gaziantep Workshop, 19-21 Haziran 2008, Gaziantep Üniversitesi KAPANIŞ SORULAR ? TÜBİTAK-ULAKBİM NOT: Bu sunum ULAKBİM tarafından organize edilmis diğer etkinliklerde kullanılan dökümanlardan derlenmiştir.