Pürinler Pirimidinler

Şeker Pentoz (5-C şeker)

Nükleozit

Nükleotid

Pürin ve primidin bazlarının katabolizması ve yeniden kullanımı mavi-katabolizma kırmızı-salvaj yolu endonukleazlar: pankreatik RNAse pankreatik DNAse Fosfodiesterazlar: Genellikle non-spesifik

Page 1069

PRPP sentetaz (-) AMP, ADP, GDP

Transformilasyon reaksiyonları multiprot Transformilasyon reaksiyonları multiprot. kompleksi tarafından katalizlenir Kompleksin bileşenleri: GAR transformylase (4) AICAR transformylase (10) serine hydroxymethyl transferase, trifunctional formylmethenyl-methylene-THF synthase (activities shown with asterisk)

AMP ve GMP den ATP ve GTP oluşumu Spesifik kinazlar GMP + ATP <-------> GDP + ADP Guanilat kinaz AMP + ATP <-------> 2 ADP Adenilat kinaz Nukleozit difosfat kinaz (NDK) enziminin katalizlediği reaksiyon ile trifosfatlara dönüşüm: GDP + ATP <------> GTP + ADP

GMP IMP AMP IMP GMP redüktaz (+) (-) GTP XMP AMP deaminaz (-) (+) K+, ATP Pi, GDP, GTP

AMP + H2O  IMP + NH4+ (AMP Deaminase) IMP + Aspartate + GTP  AMP + Fumarate + GDP + Pi (Adenylosuccinate Synthetase) İki reaksiyonun toplamı: Aspartate + H2O + GTP  Fumarate + GDP + Pi + NH4+ İki reaksiyonun birleşimi GTP harcanarak aspartatın fumarata deaminasyonudur

Net: Asp+GTP+H2ONH3+GDP+Pi+fumarate Purin Nükleotid Döngüsü Net: Asp+GTP+H2ONH3+GDP+Pi+fumarate

Purinlerin salvaj yolu: Hipoksantin-guanin fosforibozil transferaz (HGPRT) HGPRT Hipoksantin + PRPP IMP + PPi APRT Adenin + PRPP AMP + PPi APRT: Adenin fosforibozil transferaz

Kontrol

Purin Nükleotid Yıkımı

Ürik asidin sonu

Pyrimidine Synthesis

UTP 3 basamakta CTP ye dönüşür UMP + ATP UDP + ADP + Pi 1 UDP + ATP UTP + ADP + Pi 2 Nükleozit monofosfat kinaz Nükleozit difosfat kinaz

3

Bir enzyme, ribonucleotide reductase, tüm ribonucleotidleri deoxyribo türevlerine dönüştürür. Serbest radical mekanisması ribonucleotide reductase reaksiyonunda rol alır. Doğada 3 sınıf ribonucleotide reductase var Class I: tyrosine radikal, NDP kullanır Class II: adenosylcobalamin. NTP kullanır (cyanobacteria, bacteria, Euglena). Class III: SAM and Fe-S radical, NTP ları kullanır. (anaerobes and fac. anaerobes).

KAP Sentetaz II allosterik olarak kontrol edilir (Ökaryotlarda kontrol basamağı) PRPP ve IMP aktivatör Bazı primidinler inhibitör Aspartat transkarbamoilaz prokaryotlarda kontrol basamağı

Fe-içeren ribonükleozit difosfat redüktaz ribonükleozit difosfatları karşılık gelen deoksiribonükleotidlerine indirger: NDP  dNDP

Salvage and de novo pathways to thymine nucleotides

Timidilat sentaz ve tetrahidrofolat metabolizması enzimleri arasındaki ilişki

Thioredoxin and glutaredoxin okside RR yi indirger NDP indirgenmesi için electron transfer yolu

RR is feedback yoluyla düzenlenir RR is feedback yoluyla düzenlenir. Herhangibir dNTP nin bulunmaması öldürücüdür vefazla bulunması da DNA ya hatalı nükleotid eklenmelerine neden olur

dUMP metil vericisi olarak methylene-tetrahydrofolate kullanılarak thymidine synthetase enzimi ile dTMP ye dönüştürülür. Bu rxn. THF ın hem karbon vericisi hem de indirgeyici ajan olarak kullanıldığı bilinen tek rxn. dur.

Timidin sentaz ve DHFR are kemoterapi için hedef enzimlerdir

Antifolatlar antikanser ilaçlardır

Primidinler okside olmak yerine indirgenirler Primidinlerin katabolizması Primidinler okside olmak yerine indirgenirler

dUMP nin metilasyonu dTMP oluşturur Deoksitimidilat (dTMP) ( DNA sentezi için gerekli) UMP den 4 basamakta oluşur UMP UDP dUDP dUMP dTMP

dUMP den dTMP sentezi

Timidinden dTMP oluşturan salvaj yolu

İnsan dihydrofolate reductase (DHFR) Metatroksat (kırmızı) DHFR enzimini inhibe eder NADHP kosubstrattır (sarı)

Primidin nukleotidlerin birbirine dönüşümü

(deoksi) ribozdan bazın ayrılması Purin Katabolisması (deoksi) ribozdan bazın ayrılması Purine-nucleoside phosphorylase (PNP) separates the free purine base from the ribose (or deoxyribose) (Deoxy)Nucleoside + Pi Base + (Deoxy)-a-D-Ribose 1-phosphate

Urasil ve timin katabolizması

Timin oluşumu deoxyuridine monophosphate (dUMP) ın metilasyonu ile oluşur UTP RNA sentezi için gerekli dUTP dUTPase (dUTP difosfohidrolaz) ile dUMP ye hidroliz edilir dUMP  C5de metillenir ve dTMP oluşur dTMP  dTTP oluşturmak üzere yeniden fosforile edilir

Anti-Folat İlaçlar Kanser hücreleri DNA replikasyonu için hızla dTMP tüketir. Timidilat sentaz rxn.nun inhibisyonu dTMP üretimini engeller (florodeoksiuridilat – irreversible inhibitor) – aynı zamanda hızla çoğalan hücrelerin çoğalmasını da baskılar (saç folikülleri, kemik iliği, immun sistem, intestinal mukoza) Dihidrofolat reduktaz basamağı DHF analogları tarafından baskılanır Anti-Folates: Aminopterin, methotrexate, trimethoprim

Ribonükleosit difosfat redüktaz

dUDP nin dUMP ye dönüşümü için iki yol 1. dUDP + ADP dUMP + ATP 2. dUDP + ATP dUTP dUMP + PPi H2O ADP