Yaşam ağacı: Sınıflandırma ve Filogeni

Evrimsel sınıflandırmada temel tanımlar Filogenetik çeşitli organizma grupları (örneğin türler veya topluluklar) arasındaki evrimsel ilişkinin araştırmasıdır. Bu ilişkiler filogeni olarak adlandırılır.  Filogenetik terimi Yunanca kökenlidir, "kabile, ırk" anlamına gelen file veya filon ve doğumla ilişkili anlamındaki  genetikos  ("doğum" anlamında olan genesis kökünden gelir) terimlerinden türetilmiştir. İlgili bir kavram olan filogenez, bir biyolojik türün (veya bir organizmalar grubunun) evrimsel gelişimidir. Evrimsel hayat ağacının araştırılması için filogenetik analiz yöntemleri vazgeçilmez hâle gelmiştir.

Filogenetik Yaşam Ağacı

Hipotetik soy ağacı (Darwin)

Filogenetik geçmişi belirlemek Filogenetik geçmişi çıkarsamakta canlılar arasında değişebilen özelliklerin benzeşimine ve farklılığına bakılır. Ortak bir atadan oluşmuş olan türler kümesi monofiletik grup (takson) olarak adlandırılır.

Filogeniyi bulmada güçlükler Evrim hızının farklı olması Homoplasi: Bir özelliğin iki veya daha fazla kere birbirinden bağımsız bir biçimde evrimleşmesi Homoplasi benzeştirici (convergent) evrime yol açar Evrimsel geri dönüş

En yalının yeğlenmesi ilkesi ‘En az belgelenemeyen varsayıma dayalı en yalın açıklamanın, kanıtsız çok sayıda varsayıma dayanan daha karmaşık hipotezlere yeğlenmesi.’

En yalının yeğlenmesi ilkesi Yalınlık, en iyi filogenetik ilişkinin en az sayıda homoplas değişim gerektirdiğini varsayar.

Gen Ağaçları Filogenetik ağaçları çıkarsamada kullanılan ilkeler kullanılarak bir genin DNA dizi çeşitleri (Haplotipler) arasındaki tarihsel ilişkileri çıkarsayabiliriz

Gen Ağaçları Köksüz ağaç: 7-6-5-4-1-2-3

Filogenetik Analizde Sorunlar Özellikleri ölçmek zordur Homoplasi çok yaygındır Evrim süreci çoğu zaman önceki evrimsel tarihe ait izleri siler Bazı soy hatlarındaki ayrım hızının yüksekliği aralarındaki ilişkiyi anlamayı zorlaştırır

Monofilektik, parafilektik ve polifilektik taksonlar

Sistematikteki evrimsel değişikliklerin temel ilkeleri

Canlıların çoğu özellikleri daha önce var olan özelliklerden farklılaşmıştır

Homoplasi yaygındır (Benzeştirici evrim)

Homoplasi yaygındır (Benzeştirici evrim)

Özellik evriminin hızı farklıdır ve evrim genellikle kademelidir Düdükçünlerde (Scolopacidae) gaga biçimi ve uzunluğu çeşitliliği

Biçimdeki değişiklik genellikle fonksiyondaki değişiklik ile paraleldir Zar kanatlıların (Hymenoptera) iğneleri yumurta borusunun bir modifikasyonudur

Türler arasında benzerlik gelişim boyunca değişir Türler genellikle yetişkin durumlarına oranla embriyo aşamasında iken birbirine daha çok benzemektedir

Çoğu gruplar uyumsal açılım (yayılım) gösterir