PCR Temelli Genetik Analiz Yaklaşımları

Slides:



Advertisements
Benzer bir sunumlar
Protein Sentezi (TRANSLASYON)
Advertisements

PROTEİN SENTEZİ Protein sentezi bütün hücrelerde gerçekleşen yaşamsal olaylardan biridir. Canlılar, hiçbir zaman dış ortamdan aldıkları proteinleri doğrudan.
Amino Asitler.
EVRİMSEL DEĞİŞİM MEKANİZMALARI
TRANSLASYON VE PROTEİNLER
AMİNO ASİTLER ve BİYOSENTEZİ
HAZIRLAYAN MİNE HATİPOĞLU
Biyoteknoloji ve Genetik
KLİNİKTE KULLANILAN GENETİK TERMİNOLOJİ.
YÖNETİCİ MOLEKÜLLER VİDEO Ömer YANIK Biyoloji Öğretmeni 2010 / BURSA.
Doç.Dr. Mustafa ALTINIŞIK ADÜTF Biyokimya AD 2009
Yrd.Doç.Dr. Mustafa ALTINIŞIK ADÜ TIP FAKÜLTESİ Biyokimya AD
GENETİK MATERYALDEKİ DEĞİŞİKLİKLER
AMİNO ASİTLERİN YAPISAL VE İŞLEVSEL ÖZELLİKLERİ I
AMİNO ASİTLER Prof. Dr. Kader KÖSE
HÜCRE BÖLÜNMESİ VE KALITIM
DNA sentez mekanizmaları, Mutasyon, DNA Hasarı ve Onarım
Gen Organizasyonu ve Genomların Evrimi
Biyoteknoloji ve Genetik II
Genetik Analiz Deneylerinin Tasarımı
1 “INTRODUCTION TO BIOINFORMATICS” “SPRING 2005” “Dr. N AYDIN” Örnekler Doç. Dr. Nizamettin AYDIN Introduction to Bioinformatics.
Mutasyon Analiz Teknikleri III
PROTEİNLERİN 3 BOYUTLU YAPISI Prof. Dr. Kader KÖSE
Genetik Analiz Deneylerinin Tasarımı
GENETİK (ÜNİTE-3) A) HÜCREDE YAPI VE CANLILIK OLAYLARININ YÖNETİMİ NASIL SAĞLANIR? Hücrede hücre yapısının oluşması ve devamlılığı ile canlılık olaylarının.
FEN VE TEKNOLOJİ 8.SINIF DNA VE GENETİK KOD.
ÇOĞUL GEBELİKLER.
Yrd. Doç. Dr. İzzet YELKOVAN
KARSİNOJENLER.
KARSİNOJENLER.
HAZIRLAYAN MİNE HATİPOĞLU
AYŞE GÜL KEVSER İNCE FEN BİLGİSİ ÖĞRETMENLİĞİ 2. SINIF 2.ŞUBE.
MUTASYON ve MUTAJENLER
MUTASYON ve MUTAJENLER
KANSERDE KROMOZOM ANOMALİLERİ
PROTEİN SENTEZİ.
GENETİK İsmail Hakkı ÇINAR Yrd. Doç. Dr Mehmet MUTLU.
NÜKLEİK ASİTLER Yönetici moleküllerdir.Tüm canlılarda bulunurlar
PROTEİNLER VE AMİNOASİTLER
Serdar SARICI YÖNETİCİ MOLEKÜLLER Serdar SARICI
NÜKLEİK ASİTLER.
BAKTERİ GENETİĞİ. BAKTERİ GENETİĞİ Yaşamın temel maddeleri kabul edilen nükleik asitler (DNA=deoxyribonucleic acid, RNA=ribonucleic acid) dir. Çalışmalar.
FEN VE TEKNOLOJİ 8.SINIF DNA VE GENETİK KOD.
Genetik Kod, Transkripsiyon & Translasyon
NÜKLEİK ASİTLER Nükleik asitler ilk olarak hücre çekirdeğinde bulundukları için nükleik asit olarak adlandırılmışlardır. Daha sonraki araştırmalarda hücrenin.
MUTASYON-MODİFİKASYON
Mutasyonlar ve DNA onarımı
MİKROORGANİZMALARDA GÖRÜLEN
AMİNO ASİTLERİN YAPISAL VE İŞLEVSEL ÖZELLİKLERİ I
Polar Asidik Yan Zincirliler
GEN MUTASYONU, DNA ONARIMI VE YER DEĞİŞTİREN GENETİK ELEMENTLER
PROTEİN SENTEZİ.
Polimorfizm/Mutasyon tarama teknikleri
GENETİK ŞİFRE.
cDNA kütüphanesi yapımı
Biyoteknoloji ve Genetik II
MUTASYON VE POLİMORFİZM
Amino Asitler ve Proteinler
Amino asitlerin karbon iskeletlerinin yıkılması sonucu şu 7 ara ürün ortaya çıkabilir:
Tek-gen Hastalıkları II
MUTASYONLAR.
PROTEİN SENTEZİ. PROTEİN SENTEZİ Protein Sentezi’nin Basamakları TRANSKRİPSİYON TRANSLASYON.
GENOMDA GEN Yakın akraba bakteri türlerinde genom dizilerinin çok benzer olduğunun belirlenmesi ile birlikte, bakteriyal genomlara bakış açımız kökten.
DNA 2 Hücrelerdeki yönetici molekül DNA’dır. Hücrelerdeki yönetici molekül DNA’dır. Bir canlıya ait tüm özellikler DNA’da saklanır. Bir canlıya ait tüm.
TEMEL GENETİK KAVRAMLAR-VI
Protein Biyosentezi Proteinler birçok bilgi yolunun son ürünüdür. Tipik bir hücrede binlerce farklı protein vardır. Bu proteinler hücrenin ihtiyaçlarına.
SERBEST RADİKALLER ve ANTİOKSİDANLAR 6
TEMEL GENETİK KAVRAMLAR-V
Sunum transkripti:

PCR Temelli Genetik Analiz Yaklaşımları Hafta VI PCR Temelli Genetik Analiz Yaklaşımları MUTASYON Prof. Dr. Hilâl Özdağ

Mutasyon Tipleri

Baz düzeyinde mutasyon Tek nükleotid etkilenir: UV’nin neden olduğu timin dimerleri replikasyon sırasında tek bazın delesyonuna neden olabilir. Metilli sitozinlar deamine olarak Timin dönüşebilir. Tekrar eden diziler delesyon veya insersiyona neden olabilir.

Gen düzeyinde mutasyon Bütün bir geni etkiler: Eşit olmayan crossing over nedeniyle gen duplikasyonu.

Kromozom düzeyinde mutasyon Kromozomun bir kısmını etkiler: Delesyon İnversiyon Kopya sayısı değişimi Translokasyon

Mutasyonlar-Hastalıklar Hemoglobinin Beta zincirindeki bir tek nükleotid değişimi amino asit değişimi nedeniyle orak hücreli anemi hastalığına neden olur. Down sendromu 21 kromozomun 3. bir kopyasının varlığı nedeniyle açığa çıkar. Kanser: mutasyonlar hücrenin kontrolsüz çoğalmasına ve ölümsüzleşmesine yolaçtığında ortaya çıkar.

Orak Hücreli Anemi Mutasyonu Normal b-globin DNA T C A Mutant b-globin DNA G U mRNA A G mRNA Glu Normal b-globin Val Mutant b-globin H2N OH C O H2C H CH2 Asit H2N OH C O H3C H CH CH3 Nötral Non-polar

Mutasyonlar-Evrim Mutasyonların sonucu hep kötü değildir. Hücrelerimizde mutasyon gerçekleşir ve sonucu her zaman kötü değildir. Mutasyon yok ise popülasyonlar değişip yeni koşullara adapte olamaz. DNA dizilimindeki tesadüfi değişimler Fenotipte yararlı değişiklikler Doğal seçilim Popülasyonların evrimi

NOKTA MUTASYONLARI Baz değişimleri (substitutions) Geçiş (Transition) Bir pürini diğer bir pürine veya bir pirimidini diğer bir pirimidine değiştirir. Toplam 4 çeşit; A  G ve T  C

2. Değişim (Transversion) Bir pürini bir pirimidine veya bir pirimidini bir pürine değiştirir Toplam 8 çeşit; A  T, G  C, A  C, G  T

Okuma çerçevesindeki mutasyonlar Yanlış anlam mutasyonu (Missense mutation) Baz değişikliği aminoasidin değişimine neden olur.

Okuma çerçevesindeki mutasyonlar Anlamsız mutasyon (Nonsense mutation) Baz değişikliği DUR kodonunun oluşumuna neden olur ve protein kısa kalır.

Anlamsız mutasyonun translasyon üzerindeki etkisi

Okuma çerçevesindeki mutasyonlar Sessiz mutasyon (Silent mutation) Baz değişikliği kodonun 3. bazında gerçekleşir ve aminoasit değişikliğine yol açmaz.

Okuma çerçevesindeki mutasyonlar Çerçeve kayması mutasyonu (Frameshift mutation): 3’ün katları olmaya delesyon veya insersiyon okuma çerçevesini kaydırır, bu mutasyonun ardından gelen aminoasitler değişir ve protein ya olması gerekenden önce veya sonra sonlanır.

SPONTAN MUTASYONLAR Depürinasyon A veya G kaybedilip rasgele bir bazla değişir. Deaminasyon C’nin amino grubu kaybedilince U haline gelir. U eğer düzeltilmezse bir sonraki döngüde A ile eşleşeceği için (CG  TA) şeklinde değişir. 5MC (Metilli sitozinler) mutasyonlar için “hot spot”turlar.

Deaminasyon.

İNDÜKLENMİŞ MUTASYONLAR Radyasyon (X ışınımı, UV) İonize edici radyasyon DNA’dakiler de dahil olmak üzere kovalent bağları kırar böylece kromozom mutasyonlarına yolaçar. İonize edici radyasyonun etkisi kümülatiftir ve yüksek dozda hücrelerin ölümüne sebep olur. UV (254-260 nm) pürin ve pirimidinlerin anormal dimer bağları yapmasına neden olur. UV’nin neden olduğu timin dimeri

Makromutasyonlar 1 Delesyon – Kromozomun bir kısmının kaybı. 2 Duplikasyon – Kromozomun bir kısmının duplikasyonu. Inversiyon – Kromozomun bir kısmının dönmesi Translokasyon – Kromozomun bir kısmının başka bir kromozoma eklenmesi

Delesyon Kromozom Sentromer A B C D E F G H Genler A B C D G H E F

Duplikasyon Kromozom Sentromer A B C D E F G H Genler A B C D E F E F G H E F Duplikasyon

Inversiyon Kromozom Sentromer Genler A B C D E F G H A B C D F E G H

Translokasyon Kromozom Sentromer Genler A B C D E F G H A B E F C D G H

Genetik Kod U C A G U C A G İKİNCİ BAZ B Ü İ Ç R N N C C B A A Z Z Phe Nötral Non Polar Polar Bazik Asidik İKİNCİ BAZ U C A G B İ R N C A Z U UUU UUC UUA UUG UCU UCC UCA UCG UAU UAC UAA UAG UGU UGC UGA UGG U C A G Ü Ç N C B A Z Phe Tyr Cys Ser Stop Leu Stop Trp C CUU CUC CUA CUG CCU CCC CCA CCG CAU CAC CAA CAG CGU CGC CGA CGG U C A G His Leu Pro Arg Gln† A AUU AUC AUA AUG ACU ACC ACA ACG AAU AAC AAA AAG AGU AGC AGA AGG U C A G Asn† Ser Ile Thr Lys Arg †Amin grubu taşır Met/ start G GUU GUC GUA GUG GCU GCC GCA GCG GAU GAC GAA GAG GGU GGC GGA GGG U C A G Asp Val Ala Gly* *Bazı metinlerde Nonpolar olarak geçer. Glu

Mutasyon, mutasyon, mutasyon… David W. Stockton1,2*, Parimal Das3*, Monica Goldenberg4, Rena N. D’Souza4 & Pragna I. Patel1,3 Mutation of PAX9 is associated with oligodontia, 2000, Nat. Genet, 24, 18-19