TRANSPOZONLAR HAZIRLAYANLAR SERKAN ÇAM HASAN KESKİN DANIŞMAN

Slides:



Advertisements
Benzer bir sunumlar
EVRİMSEL DEĞİŞİM MEKANİZMALARI
Advertisements

MOLEKÜLER GENETİK II.
TOPRAĞIN HİKAYESİ HORİZON: Toprağı meydana getiren katmanlara horizon adı verilir. TOPRAK: Toprak taşların parçalanması ve ayrışmasıyla meydana gelen,
Mayoz Bölünme.
BİYOÇEŞİTLİLİK NEDİR Biyoçeşitlilik, bir bölgedeki genlerin, türlerin, ekosistemlerin ve ekolojik olayların oluşturduğu bir bütündür. Başka bir deyişle.
Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı , Bahar, Trakya Üniv Tıp Fak 6. Kurul, Neşe Akış, PhD, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı
EĞİTSEL OYUNLAR DOÇ. DR. GÜLTEN HERGÜNER BÖLÜM: 4
Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı Somatik Reseptör Geni Üretimi , Bahar, Trakya Üniv Tıp Fak 6. Kurul, Neşe Akış, PhD, Tıbbi Mikrobiyoloji.
Plazmitler Plazmitler kromozom dışı ekstra genetik materyallerdir. Hemen hemen tüm bakteri cinslerinde bulunmuşsa da bakteriler için mutlaka gerekli değildir.
EĞİTSEL OYUNLAR DOÇ. DR. GÜLTEN HERGÜNER BÖLÜM: 2
Arasınav ders ve temaları. Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı , Bahar, Trakya Üniv Tıp Fak 6. Kurul, Neşe Akış, PhD, Tıbbi Mikrobiyoloji.
DİŞLİ ÇARKLARDA MEYDANA GELEN HASAR MEKANİZMALARI
MAYOZ BÖLÜNME. Mayoz bölünme bitki, insan ve hayvanlarda üreme hücrelerinin (sperm, yumurta ve polen) oluşturulmasını sağlar. Canlıların üreme organlarında.
MAYOZ BÖLÜNME. MAYOZ BÖLÜNME:Bitki, insan ve hayvanlarda üreme hücrelerinin (Sperm, Yumurta ve Polen) oluşturulmasını sağlar. Canlıların üreme organlarında.
BAKTERİLER ALEMİ. BAKTERİLER ALEMİ BAKTERİLER ALEMİ Prokaryot hücre yapısı taşırlar. Birçok farklı kimyasal ve fiziksel ortamda yaşayabilirler. Çok.
EKOLOJİ ve SÜRDÜRÜLEBİLİRLİK
PLASMİDLER Bir çok bakteri, kromozomlarından hariç, plasmid olarak adlandırılan küçük non-kromozomal DNA moleküllerine sahiptir. Plasmidler, genellikle.
Hazırlayan: Meltem ÖZCAN
FNP GRUBU: fatma ışık, nagehan öztürk, pınar sevindik
B- GENETİK MÜHENDİSLİĞİ ve REKOMBİNANT ÜRÜNLER
Mayoz Bölünme. Mayoz Bölünme MAYOZ BÖLÜNMESİ Canlıların çoğu diploit kromozom sayısına sahiptir. Ancak bitki bitleri, erkek arılar vb. canlılarda haploit.
Plazmitler Plazmitler kromozom dışı ekstra genetik materyallerdir. Hemen hemen tüm bakteri cinslerinde bulunmuşsa da bakteriler için mutlaka gerekli değildir.
Sekonder boğum ve SAT kromozomlar
C Elementi.
Moleküler Mikrobiyoloji
II.BÖLÜM GELİŞİM İLE İLGİLİ TEMEL KAVRAMLAR
GENİN TEMEL FONKSİYONLARI: 2. TRANSKRİPSİYON
Genetik mühendisliğinin pratik uygulamaları
Epistase.
GENETİK MÜHENDİSLİĞİ VE YAŞAMIMIZDAKİ YERİ
GEN MUTASYONU, DNA ONARIMI VE YER DEĞİŞTİREN GENETİK ELEMENTLER
Tek-gen Hastalıkları.
LETHAL GENLER.
C-KONJUGASYON Genetik bakımdan seks ayrıcalığı gösteren iki bakteri hücresinin yan yana gelip aralarında oluşacak geçici bir hücre birleşmesi ile bakteriden.
Faj Vektörler 8-25 kb arası fragmentleri etkin olarak taşıyabilirler
Gen Mühendisliği ve Veteriner Hekimlikte Biyoteknoloji
1. sağlık ve sağlığın girdileri
Tek-gen Hastalıkları II
Kalıtsal madde (kalıtsal molekül, genetik materyal)
Proje Risk Yönetimi YRD. DOÇ. DR. KENAN GENÇOL.
Fare Biyomedikal çalışmalarda için uygun ve en çok kullanılan türdür. 400’ün üzerinde farklı soyu vardır. Başlıca kanser, antikor, ilaç ve aşı araştırmalarında.
ÇOKGENLER.
Yatay Gen Transferinin Hesaplanması
Biyoinformatik.
MBG Gelişim Biyolojisi
GENETİK MATERYAL DNA ve RNA’dır. DNA nedir? RNA nedir?
BAKTERİLERDE GENETİK MADDE AKTARILMASI
BAKTERİLERDE EKSTRAKROMOZAL GENETİK ELEMENTLER
Bitki Doku Kültürlerini Etkileyen Bitkisel Faktörler
Sağlık Bilimleri Fakültesi
Problemler – Kültür Sırasında Problemler
PROTEİN SENTEZİ. PROTEİN SENTEZİ Protein Sentezi’nin Basamakları TRANSKRİPSİYON TRANSLASYON.
KARIŞIMLAR Karışım, birden fazla maddenin yalnız fiziksel özellikleri değişecek şekilde bir araya getirilmesiyle oluşturulan madde topluluğudur. Karışımın.
KALITIM VE ÇEVRE I. Kalıtım II. Çevre
ARACILI GEN AKTARMA YÖNTEMİ - Agrobacterium tumefaciens -
MAYOZ HÜCRE BÖLÜNMESİ.
Gelişim ve Temel Kavramlar
Canlıların Büyüme ve Yaşamasına Etki Eden Faktörler
Hastalıkların Biyokimyasal Temeli
Biyoteknoloji İçin Mikrobiyoloji 1
Agrobacterium tumefaciens Aracılığıyla Bitkilere Gen Aktarımı
Biyoteknoloji İçin Mikrobiyoloji 1
3. BÖLÜM GENLER VE EVRİM. 3. BÖLÜM GENLER VE EVRİM.
Çiçekli Bitkilerde Üreme 2
GENOMİK.
Genetiği Değiştirilmiş Organizmalar ile Terapötik Protein Üretimi
HÜCRE BÖLÜNMESİ.
ONDOKUZ MAYIS ÜNİVERSİTESİ ZİRAAT FAKÜLTESİ TARIMSAL BİYOTEKNOLOJİ ANABİLİM DALI GENOMİKLER DERSİ Tarımsal Biyoteknolojide Mobil Genetik Elementlerin.
(INVESTIGATIONS ON LONG NON-CODING RNAS IN BARLEY)
Sunum transkripti:

TRANSPOZONLAR HAZIRLAYANLAR SERKAN ÇAM HASAN KESKİN DANIŞMAN DR. ÖĞR. ÜYESİ YILMAZ KAYA

İÇİNDEKİLER Transpozon nedir? Transpozonların Biyolojik Önemi Transpozonların Sınıflandırılması Retrotranspozonlar  DNA Transpozonları Transpozonların Hareketlilik Açısından Sınıflandırılması Transpozonların Temel Özellikleri  Transpozonların Fonksiyonları Transpozonların Kullanım Alanları İÇİNDEKİLER

Transpozonlar genom içinde yer değiştirebilme yeteneğine sahip DNA dizileridir. Bu yer değiştirebilen tekrarlı diziler, transpozisyon aracılığı ile bir kromozomal bölgeden diğerine hareket ederler. Ökaryotlarda ve neredeyse tüm prokaryotlarda bulunan transpozonlar, genomların büyük bir yüzdesini oluşturmaktadır. Transpozonlar

Transpozonlar,  Bitki genomlarının ortalama %50-90  Hayvan genomlarının da %3-45   İnsanda %45  Prokaryotların çoğunluğunda ise %1-3 oranı kadardır.

Barbara McClintock, mısırda kromozom kırılmaları ve bunun genetik sonuçları ile ilgili yaptığı çalışmada kontrol elementleri (“controlling elements”) olarak adlandırdığı transpozonları keşfetmiştir.

Transpozonların Biyolojik Önemi Transpozonlar hem prokaryotlarda hem de ökaryotlarda mutasyonda insersiyon, delesyon ve yeniden düzenlenmelerde rol almaktadır. Transpozonlar çeşitli mekanizma ve yapılarda bulunabilen hareketli genetik elementlerdir. Ökaryotik genomların büyük bir kısmını oluştururlar ve hareketleriyle genlerin ve genomların şekillenmesinde büyük rol oynarlar. 

Transpozonların Sınıflandırılması Transpozonlar Retrotranspozonlar ve DNA transpozonları olmak üzere iki sınıfı vardır. Retrotranspozonlar kendilerini RNA’ya kopyalarlar ve bu RNA ters transkripsyon ile yeniden DNA’ya dönüşerek genom üzerinde yeni bölgelere yerleşmektedirler.  DNA transpozonları RNA aracısına ihtiyaç duymazlar; transpozas enzimleriyle katalize olurlar. Transpozonların Sınıflandırılması

Transpozisyon aracı olarak RNA’yı kullanan RNA transpozonlarıdır.  Bir RNA polimeraz enzimi aracılığı ile transpozonun mRNA’ya transkripsiyonu yapılır ve ardından ters transkriptaz aracılığı ile bu mRNA cDNA’ya dönüştürülür. Sentezlenen cDNA genomdaki hedef bölgeye yerleşerek yeni konumunu alır.  Bu mekanizma yaygın olarak kopyala- yapıştır ‘copypaste’ mekanizması olarak bilinmektedir. Retrotranspozonlar

Retrotranspozonlar

Retrotranspozonlar Penelope benzeri elementler (PLEs) LINE ile SINE dizileri  LTR retrotranspozonları.  Retrotranspozonlar

DNA Transpozonları Transpozisyon aracı olarak  RNA’yı kullanmayan DNA transpozonlarıdır.  DNA transpozonları iki farklı tipte hareket ederler;  Kendilerini bulundukları lokustan kesip çıkararak (konservatif)  Kendilerini replike ederek (replikatif) genomun başka bir bölgesine yerleşirler. 

Transpozonların Hareketlilik Açısından Sınıflandırılması Transpozonlar hareketlilikleri açısından aktif transpozonlar ve inaktif transpozonlar olmak üzere iki kategoriye ayrılırlar. Ancak transpozonların aktif veya inaktif olması tamamen kalıcı bir durum değildir ve tersine döndürülebilir. Çevresel koşulların değişmesi ve başka faktörler, bu elementleri aktive veya inaktive eden epigenetik yapılanmayı değiştirebilmektedir.

Transpozonların Temel Özellikleri Tüm transpozonlar iki temel özellik taşırlar. Birincisi, genom içinde bir yerden diğerine hareket edebilme özelliği (transpozisyon),  İkincisi de genomdaki kopya sayılarını arttırabilme (replikasyon) özelliğidir. Transpozonların Temel Özellikleri

Transpozonların Temel Özellikleri Transpozonlar, transpozisyonları sonucu genomların birçok farklı bölgelerine insersiyon yapabilmektedirler.  Özellikle eksonlara veya gen yakınındaki bölgelere yerleştiklerinde; Nokta mutasyonu Çerçeve-kayma mutasyonu Delesyon Düplikasyon inversiyon  gibi birçok mutasyonlara yol açmaktadırlar.  Transpozonların Temel Özellikleri

Transpozonların Fonksiyonları Ekleme Mutasyonu Gen Ekspresyonunun Düzenlenmesi Silme, Çoğaltma ve Ters çevirme Mutasyonları Yeni genomlar ve Fonksiyonları Evrim Transpozonların Fonksiyonları

Transpozonların Kullanım Alanları Prokaryotlarda klasik antibiyotik–direnç markırı. Plazmit vektörler kullanılarak bakteri transformasyonunda kullanılmaktadır.

Transpozonların Kullanım Alanları Ökaryotlarda ise; Gen klonlama Genetik haritalama Transgenik organizmaların eldesi Kanser çalışmaları Ekleme mutasyonu Mutasyon aracı olarak kullanılmaktadır. Transpozonların Kullanım Alanları

Bizi Dinlediğiniz İçin Teşekkür Ederiz...

S.1. Genom içerisinde yer değiştirebilme yeteneğine sahip DNA dizilerine……………… adı verilir. (transpozon) S.2. Transpozonlar ………………… ve …………………… olmak üzere iki gruba ayrılır. ( retrotranspozonlar- DNA transpozonları) S.3. Transpozonların fonksiyonları nelerdir? Ekleme Mutasyonu Gen Ekspresyonunun Düzenlenmesi Silme, Çoğaltma ve Ters çevirme Mutasyonları Yeni genomlar ve Fonksiyonları Evrim

S.4. transpozonların kullanım alanları nelerdir? Prokaryotlarda klasik antibiyotik–direnç markırı. Plazmit vektörler kullanılarak bakteri transformasyonunda kullanılmaktadır. Ökaryotlarda ise; Gen klonlama Genetik haritalama Transgenik organizmaların eldesi Kanser çalışmaları Ekleme mutasyonu Mutasyon aracı olarak kullanılmaktadır.

S.5. RNA yı transpozisyon aracı olarak kullanan transpozonlara ………………….. denir. (retrotranspozonlar) S.6.Transpozonların iki temel özelliği nedir ? Tüm transpozonlar iki temel özellik taşırlar. Birincisi, genom içinde bir yerden diğerine hareket edebilme özelliği (transpozisyon),  İkincisi de genomdaki kopya sayılarını arttırabilme (replikasyon) özelliğidir.