[Pt(bpy)(PIP)]+2 ve [Pt(bpy)(HPIP)]+2 Komplekslerinin Sentezi ve DNA Etkileşimlerinin Belirlenmesi Ufuk Yıldız, Burak Çoban, Abdurrahman Şengül Bülent.

Slides:



Advertisements
Benzer bir sunumlar
Her bir kimyasal element, atom çekirdeği içerisindeki proton sayıları veya atom numarası (Z) ile karakterize edilir. Verilen bir elementin tüm atomlarında.
Advertisements

ELEKTRİKSEL ÇİFT TABAKA
Ligantlar Lewis bazlarıdır, merkez atoma verici atomları ile bağlanır.
POLİMERLERDE BAĞLANMA
HİDROJEN MOLEKÜLÜ H2 Karşı bağ E(R) Bağ VBT MOT RAB (kJ/mol)
AFİNİTE KROMATOGRAFİSi
Tavsiye Edilen Kitaplar
Çöktürme Titrimetrisi
BÖLÜM 17: ASİTLER VE BAZLAR
ALETLİ (ENSTRÜMENTAL) ANALİZ
GENEL KİMYA 101- GENEL KİMYA 101 LAB.
(formüller aynı, fiziksel veya kimyasal özellikler farklı)
CTAB’IN PERLİT YÜZEYİNE ADSORPSİYONU
Asitler, Bazlar Ve Tamponlar: pH Ölçülmesi Ve Önemi (1 saat)
Moleküller arasındaki çekim kuvvetleri genel olarak zayıf etkileşimlerdir. Bu etkileşimler, molekül yapılı maddeler ile asal gazların fiziksel hâllerini.
ELEKTRİKSEL ÇİFT TABAKA MODELİ
ALİ DAĞDEVİREN/FEN VE TEKNOLOJİ ÖĞRETMENİ
KOLLOİDAL SİSTEMLERDE IŞIK SAÇILMASI
Nötralleşme Titrasyonları
Potansiyometri Çalışma ilkesi: Karşılaştırma elektrodu ile uygun bir ikinci elektrottan oluşan Elektrokimyasal hücreden akım geçmezken Potansiyel ölçümüne.
SU, ÇÖZELTİLER, ASİT VE BAZLAR III
Kristal Alan Teorisi.
ORGANİK KİMYA VE BİYOKİMYAYA GİRİŞ, LABORATUVAR ARAÇ-GEREÇLERİ II
SPORUN OKUL BAŞARISI ÜZERİNDEKİ ETKİSİ
MÜHENDİSLİK FAKÜLTESİ KİMYA MÜHENDİSLİĞİ BÖLÜMÜ
9. SINIF KİMYA 24 MART-04 NİSAN.
MÜHENDİSLİK FAKÜLTESİ KİMYA MÜHENDİSLİĞİ BÖLÜMÜ
Molekül Orbital Teorisi
9. SINIF KİMYA MART.
BÖLÜM 18: Asit-Baz Dengeleri, Ek Konular
Açısal Örtüşme Modeli İlk ve en basit MO modeli yaklaşımıdır.
NÜKLEİK ASİTLER.
BAĞLAR Atom ya da molekülleri bir arada tutan kuvvete bağ denir. Aynı ya da farklı atomları bir arada tutan kuvvete, molekül içi bağ, aynı ya da farklı.
Soru Fe 2+ ile 1,10-fenantrolin kompleksi ile hazırlanan 0,01, 0,02, 0,03, 0,04 ve 0,05 mM standart çözeltiler için ölçülen absorbanslar sırasıyla 0,14,
GENEL KİMYA I Prof. Dr. Baki Hazer Zonguldak Karaelmas Üniversitesi
Nükleer Manyetik Rezonans Spektroskopisi
ZAYIF ETKİLEŞİMLER.
NaCl’de, Na bir elektron vererek Na+ katyonunu oluşturur ve bu elektron  Cl tarafından alınır ve Cl- anyonunu oluşturur. Böylelikle.
Bölüm 10. Kimyasal Dengelere Elektrolitlerin Etkisi
YÜZÜNCÜ YIL ÜNİVERSİTESİ FEN FAKÜLTESİ KİMYA BÖLÜMÜ
KAYNAKLAR 1. Ravinder, V. Swamy, S. J. SriHari, S. Lingaiah, P. Polyhedron. 4 (1985) Greenhill, J.V. Lue, P. Medicinal Chemistry program.
3. KİMYASAL BAĞ VE KİMYASAL BAĞ KAVRAMININ GELİŞİMİ
Kapalı Formül ve Mol Kütleleri (g/mol)
Habibe GÜLER1, Nazan ÜZÜM1, Kurtuluş OLGUN1
9-10 HAFTA Titrimetrik Yöntemler; Çöktürme Titrimetrisi
SPEKTROFOTOMETRİ.
(formüller aynı, fiziksel veya kimyasal özellikler farklı)
Tavsiye Edilen Kitaplar
KOLORİMETRE- SPEKTROFOTOMETRE
Su Molekülünün Özellikleri
12 Adet Benzotiyazol Türevinin Ökaryotik DNA Topoizomeraz İnhibisyon Potansiyellerinin Araştırılması Çiğdem Özen1,2, Egemen Foto2, Zeliha Soysal2, Fatma.
Bir gün benim sözlerim bilimle ters düşerse, bilimi seçin.
H. K. KAPLAN, S. SARSICI, S. K. AKAY*
MEDİKAL KİMYA Atom ve Molekül
İYOTLA YAPILAN TİTRASYONLAR
KONU 1 (1.Hafta) İLERİ ORGANİK KİMYA
ÖĞRETİM TEKNOLOJİLERİ VE MATERYAL TASARIMI
KOMPLEKSLEŞME REAKSİYONLARI VE TİTRASYONLARI
Açısal Örtüşme Modeli İlk ve en basit MO modeli yaklaşımıdır.
MADDENİN YAPISI VE ATOM
Amino Asitler ve Proteinler
ANALİTİK KİMYA DERS NOTLARI
IR Spektroskopisi.
Titrimetride Hesaplamalar
Bir gün benim sözlerim bilimle ters düşerse, bilimi seçin.
ANALİTİK KİMYA DERS NOTLARI
ECH 112 Bölüm 1 Doç. Dr. Yasemin G. İŞGÖR
T.C ONDOKUZ MAYIS ÜNİVERSİTESİ ZİRAAT FAKÜLTESİ REAL-TİME PCR İLKER TOKLUCU MEHMET HAN BAŞTÜRK TARIMSAL BİYOTEKNOLOJİ BÖLÜMÜ    2019-SAMSUN  
BÖLÜM 4: Hidroloji (Sızma) / Prof. Dr. Osman YILDIZ (Kırıkkale Üniversitesi)
Sunum transkripti:

[Pt(bpy)(PIP)]+2 ve [Pt(bpy)(HPIP)]+2 Komplekslerinin Sentezi ve DNA Etkileşimlerinin Belirlenmesi Ufuk Yıldız, Burak Çoban, Abdurrahman Şengül Bülent Ecevit Üniversitesi, Fen Edebiyat Fakültesi, Kimya Bölümü, Zonguldak. GİRİŞ Son yıllarda küçük moleküllerin DNA’ya bağlanmalarının incelenmesi çok ilgi çeken bir çalışma alanı olmuştur. Spesifik DNA hedefli ilaçların sentezi için bu moleküllerin DNA’ya bağlanma türünü belirlenmesi son derece önemlidir. Moleküller DNA’ya interkalasyon, kovalent bağ, boşluk bağlayıcı ve elektrostatik olarak bağlanabilirler. Cis-platinin DNA etkinliğinin keşfedilmesinden sonra birçok platin kompleksi sentezlenmiş ve DNA etkileşimleri çalışılmıştır. PIP ve HPIP ligandlarının kobalt ve rutenyum kompleksleri yoğun bir şekilde çalışılmış ancak platin kompleksleri çalışılmamıştır [1, 2]. (2,2′-bipiridin)(2-fenilimidazo[4,5-f][1,10]fenantrolin)Platin(II) ([Pt(bpy)(PIP)]+2) (kompleks 1) ve (2,2′-bipiridin)(2-(2-hidroksifenil)imidazo[4,5-f][1,10]fenantrolin)Platin(II) ([Pt(bpy)(HPIP)]+2 (kompleks 2) platin metalinin sağladığı kare düzlem yapı ve ligandlar sayesinde tamamen düzlemseldir. Bu sayede her iki kompleksin de DNA baz çiftleri arasına interkalasyon yapması beklenmektedir. Ligantda bulunan geniş p sistemi, DNA baz çiftlerinin sahip olduğu p sistemi ile örtüşerek yapıya kararlılık sağlayacaktır. Yarışmalı Floresans Çalışması: Floresans spektroskopisi moleküllerin DNA etkileşimlerinin belirlenmesinde kullanılan diğer bir önemli metottur. DNA’ya interkalasyon yaptığı kesin olarak bilinen etidyum bromür molekülünün DNA baz çitlerinin arasından itilmesi takip edilerek molekülün DNA’ya interkalasyon yapıp yapmadığı belirlenebilir. Şekil 3. 20 mM EtBr ve 100 mM sığır DNA’ sı içeren çözeltinin artan [Pt(bpy)(PIP)]+2 ve [ Pt(bpy)(HPIP)]+2 derişimiyle elde edilen floresans spektrumu Eklenen kompleks miktarı arttıkça interkalasyon yapmış etidyum bromür molekülünün miktarının azaldığı yani her iki kompleksinde etidyum bromür moleküllerini DNA baz çiftleri arasından iterek kendisinin yerleştiği anlaşılmaktadır. Transkripsiyon İnhibisyonu: DNA’ya bağlanan küçük moleküllerin antitümör olarak kabul edilebilmesi için transkripsiyon inhibisyonu gerçekleştirebilmesi gerekmektedir5 Şekil 4. Artan kompleks 1 ve 2 varlığında m-RNA sentezinin inhibisyonu: 1 pozitif kontrol; 2-5 100, 150, 200 ve 300 mM kompleks 2; 6-9 100, 150, 200, 300 mM kompleks 1 Şekil 4’te görüldüğü gibi her iki kompleks de transkripsiyonu inhibe edebilmektedir. Ancak kompleks 2 aynı derişimde daha fazla inhibe ederek daha az m-RNA sentezlenebilmesine neden olmaktadır. Buda kompleks 2’nin daha kuvvetli bir anti-kanser olduğunu göstermektedir. KOMPLEKSLERİN SENTEZİ Şekil 1. [Pt(bpy)(PIP)]+2 ve [Pt(bpy)(HPIP)]+2 Sentezi DNA ETKİLEŞİMLERİNİN BELİRLENMESİ UV Titrasyon: Elektronik absorpsiyon spektroskopisi metal komplekslerinin DNA ile olan etkileşimlerinin niteliğini öğrenmek için geçerli bir metotdur. Eğer etkileşim bir interkalasyon ise, yani metal kompleksinin düzlemsel aromatik halkaya ait olan kısmının komşu iki DNA baz çiftinin arasına girmesi ve DNA’nın yapısını bozması durumunda ligandın p orbitali ile DNA baz çiftlerine ait p orbitali girişimde bulunarak hem dalga boyunda hem de absorpsiyon yoğunluğunda değişimler meydana gelecektir.4 Şekil 2. 10 mM kompleks 1 ve 2’nin 0,5-40 mM DNA ile titrasyonundan elde edilen UV absorbsiyon spektrumu Şekil 2’de kompleksin DNA’ya bağlanma sabiti hesaplamasında kullanılan eşitlik 1 kullanılarak çizilmiş grafik görülmektedir. Grafiklerin eğiminden bağlanma sabiti değeri kompleks 1 için (Kb) 2,88 x 104 kompleks 2 için 5,38 x 104 olarak hesaplanmıştır. [DNA] / (eA - ef) = [DNA] / (eB - ef) + 1 / Kb (eB - ef) Eşitlik 1. SONUÇ UV titrasyon ve yarışmalı floresans çalışmaları sonucunda her iki kompleksinde DNA ile baz çiftleri arasına interkalasyon yaparak etkileşitiği anlaşılmıştır. Hesaplanan bağlanma sabiti değerleri kompleksin 2’nin DNA’ya kompleks 1’den daha kuvvetli bağlandığını göstermektedir. Bu sonuç kompleks 2’de bulunan molekül içi hidrojen bağı sayesinde daha düzlemsel bir yapı ve daha geniş p sistemine sahip olmasından ileri gelmektedir. Transkripsiyon inhibisyon çalışması ile her iki yapının da antitümör etki gösterdiği ancak kompleks 2’nin daha düşük konsantrasyonlarda inhibisyon yaparak diğer sonuçları desteklediği görülmektedir. Kaynaklar: [1]. U. Maheswari, M. Palaniandavar, Journal of Inorganic Biochemistry, 98 (2004) 219-230. [2]. T.-F. Miao et al., Biophysical Chemistry, 140 (2009) 1-8. [3] Jamieson, E.R. and S.J. Lippard, Structure, recognition, and processing of cisplatin-DNA adducts. Chemical Reviews, 1999. 99(9): p. 2467-2498.