Amino asit ve Peptid Yapısı

... konulu sunumlar: "Amino asit ve Peptid Yapısı"— Sunum transkripti:

1 Amino asit ve Peptid Yapısı
Prof. Dr. Serenay Elgün Ülkar

2 Amino asitler Proteinler, DNA tarafından kodlanan 20 amino asitten meydana gelen lineer, dallanmamış polimerlerdir. Amino asitler, proteinlerin monomerik birimleridir ve peptid bağlarıyla bağlanırlar. Hepsi de -amino asitlerdir, amino grubu  -karbon atomuna (karboksilat grubunun yanındaki karbon atomu) bağlıdır. S.Elgün Ülkar

3 Fizyolojik pH’da (7.4) karboksil grubu iyonize olmuştur.
Karboksil grubunun (-COOH) pK’sı ~2, amino grubununki (-NH3) ise ~9.5’dur. Çözelti içinde zwitterion şeklinde bulunurlar. Bu yüklü gruplar su molekülleriyle H bağı kurduğu için tüm a.a.ler suda çözünürdürler. Fizyolojik pH’da (7.4) karboksil grubu iyonize olmuştur. Amino asitler R grubunun kimyasal özelliklerine göre sınıflandırılırlar. En kullanışlı olan sınıflandırma R grubunun çözünürlüğüne göre yapılandır. Buna göre 4 grup vardır. Karboksil grubu Amino grubu -karbon Yan zincir

4 Nonpolar (Hidrofobik) Yan Zincirliler
Birbirleriyle hidrofobik etkileşime girerler, yüklü gruplarla bağ yapamazlar, proteinin iç kısmında yerleşerek üç boyutlu yapının kurulmasına yardımcı olurlar. Glisin (Gly-G); en küçük, asimetrik karbonu yok, optik aktivitesi yok, D-L izomerleri (stereoizomer, enantiomer) yok (R=H). Kollajen, hem, pürin, kreatin, glutatyon Safra asidi konjugasyonunda taurinle birlikte Protein yapısında esneklik sağlar Spinal kordda inhibitör, serebral kortekste eksitatuar nörotransmitter S.Elgün Ülkar

5 Alanin (Ala-A); insan proteinlerinde en yaygın
Diğer a.a.ler yapısal olarak alaninin türevi gibi A.a. ve karbonhidrat met arasında bağlantı Glukoz-alanin döngüsü Valin (Val-V), lösin (Leu-L), izolösin (Ile-I); dallı zincirliler Esansiyel İzolösinin 2 asimetrik karbonu var S.Elgün Ülkar

6 Fenilalanin (Phe-F); aromatik fenil halkası
U.V absorbsiyonu Esansiyel Tirozin sentezi Fenilketonüri Triptofan (Trp-W); aromatik indol halkası U.V. absorbsiyonu Nikotinamid 340 nm.de absorbans vermez, NADH verir), melatonin, serotonin Tirozinle birlikte floresans verir

7 Metiyonin (Met-M); kükürtlü,
Kükürde bağlı metil grubu Esansiyel S-adenozilmetiyonin (SAM)’in öncüsü (epinefrin, kreatin, poliaminler, melatonin) Hemen tüm kükürtlü bileşiklerin öncüsü Sistein Prolin (Pro-P); imino asit Katı halka yapısı Protein yapısında esnekliği sınırlar Hidroksiprolin Kollajen ve elastin