Hollanda Genetik Bilim= HG = CRV Türkiye Acentası = Demsa
CRV Hakkındaki Gerçekler CRV’nin sahipleri: CR Delta (%80) ve VRV (% 20). CR Delta ve VRV işbirliğidir CR Delta: Hollanda’da 23,000 üye VRV: Belçika’da 7,000 üye (Flanders) > Dünya çapında 2,000 işçi > Dünya çapında 100,000 müşteri 2009/2010’da € 140 milyon € ciro Arnhem’de Merkez Ofis (NL) Ofisler: Oosterzele (BE), Deventer (NL)
Dünya Çapında CRV CRV Holding (CRV BV ve CRV International) Bağlı kuruluşlar (AI station) CRV Lagoa, Brezilya CRV Çek Cumhuriyeti CRV Ambreed, Yeni Zelanda CRV ABD CRV Almanya Bağlı kuruluşlar (satışlar ve hizmet) CRV İspanya CRV Lüksemburg CRV Avustralya CRV Xseed, Güney Afrika
Dünya Çapında CRV CRV Holding (CRV BV and CRV International) Ortak Girişimler (AI station) BBG, Belçika (%33) Profarm, Pakistan (%50) Ortak Girişimler (eşeyli semen) ST Benelux (%50), ST Brezilya (%50) İttifaklar Grassland Alliance (İrlanda) Moskovskoe (Rusya Fed.) Elita (Ukrayna) Distribütörler > 50 ülke
CRV’nin DHI faaliyetleri Soy kütüğü kaydı, Süt kaydı ve Tür sınıflandırması (DHI hizmetleri) Aşağıdakilerle ilgili veri toplama: Yavrulama (doğal çiftleşme/AI/embriyo nakli) Tanımlama & Kayıt Soy: soy kütüğü kaydı Süt kaydı Tür sınıflandırması IRIS yazılımıyla işlem verileri Çiftçilere yönetim bilgileri temin etmek Seçme programları için onları kullanmak Genetik değerlendirme için onları kullanmak Uluslar arası DHI örgütlerine IRIS Takviyesi
CRV’nin genetik ürünleri Yüksek düzeyli yavrulama programlarıyla ortaya çıkan semen, eşeyli semen ve embriyolar Mevcut soylar : B&W Holstein (Hollanda, Çek, ABD) R&W Holstein (Hollanda, Çek) Pasture Breed Holstein (Yeni Zelanda,İrlanda) MRY (Hollanda+Almanya) Simmental (Çek, Almanya) Jersey (Yeni Zelanda) Belgium Blue (Belçika) Gir, Girandola (Brezilya) Nelore (Brezilya)
Genomik Seçim
Hollanda’da yavrulamanın tarihçesi Yavrulama soya göre seçilmeye dayalıdır Yavrulama döl testiyle seçilmeye dayalıdır (1970’den beri) Yavrulama Genomik Seçimle seçilmeye dayalıdır (2009’dan beri)
2005’te CRV ile döl testi Popülasyonda rasgele 1500 semen dozunun yayılmasıyla boğa yaşıyla 14 aylık 500 tane Siyah & Beyaz ve Kızıl & Beyaz Holstein Friesian boğaların testi Boğalar + 5 yaşındayken ve yavrulama değerleri hesaplandığında eldeki test sonuçları (evlatların performansı) Üretime ilişkin güvenilirlik yavrulama değerleri istenen: 100 çiftlikte 110 evlat ilk testlere dayanarak: + % 80 Boğa yaşıyla 8 yaşındayken: > %90 Yılda 30-40 boğanın seçimi (1: 15)
Geleneksel yavrulama sistemlerinin (Dez)avantajları Cinse dayalı yavrulama : Düşük güvenirlilik (< %35) (-) yavaşça(-) Döl testine dayalı yavrulama : Yüksek güvenirlilik (+) Yavaşça (-) Uzun oluşum arası (-) Maliyet olarak (-) Yavrulamanın yönünü değiştirmek kolay değildir (-)
Genomik Seçim (GS) İnkılapçı yeni yavrulama tekniği Genler üzerinde işaretleyici tanımlamaya (SNP’s) dayalıdır; genetik manipülasyon yoktur Cinse ve işaretleyicilere dayanan erkek ve dişilerin yavrulama değerinin hesaplanması Erken dönemde yavrulama değerinin yüksek güvenirliliği
Genomik Seçim (GS) Genomic selection Genetik belirleyiciler (SNP’s) genlere yakın uzanan DNA’nın küçük fark edilebilir parçalarıdır. Kromozom 1 Kromozom 29 Kromozom 3
DNA çipleriyle genotipleme ...CAGTCAGTCGTACCAGTCT... ...CAGTCAGTAGTACCAGTCT...
Genomik Seçim (GS) Genomik Seçim’de yapılacak adımlar Belirleyicilerin tanınması (SNP’s) Döl testi yapılmış ve genotiplenmiş referans boğalar ile belirleyici etkilerinin tanınması Doğrulama boğaları % güvenirlilik Daha fazla SNPler ve daha fazla referans boğalarla daha yüksek güvenirlilik Yavrulama programlarında/doğrudan satışlarda GS kullanımı
Genomik Seçim (GS) Genomic selection Genomik Seçim’in Geliştirilmesi (GS) 2006: + 3,000 SNP’s (belirleyiciler) ve 1,500 referans boğa (Holstein Friesian) 2007: + 60,000 SNP’s ve 1,500 referans boğa 2008: + 60,000 SNP’s ve 4,000 referans boğa 2010: + 60,000 SNP’s ve 16,000 referans boğa (EuroGenomics) 2011: + 800,000 SNP’s ve 18,000 referans boğa (EuroGenomics)
Genomik Seçim (GS) Ortaklar EuroGenomics UNCEIA (Fransa) CRV (Hollanda) DHV and VIT (Almanya) Viking Genetics (Danimarka, İsveç, Finlandiya) INRA (Fransa) University of Liège (Belçika) Nordic Cattle Genetic Evaluation (İsveç) Aarhus University (Danimarka)
Genomik Seçim (GS) 2009’da genotip referans popülasyonlar Ülke Holstein Diğer cinsler ABD & Kanada 9000 1300 Almanya 4500 4000 Hollanda/Fla 4500 0 Danimarka/İsveç/Finlandiya 4000 5000 Fransa 4000 1500 Avustralya 2000 0 Yeni Zelanda 4200 2500 İtalya 3000 0 UK 2000 0 Polonya 1200 0 İrlanda 1200 0
Genomik Seçim (GS) EuroGenomics’in Hedefi Bilgileri ve verileri paylaşınız: - Genomik Yavrulama Değerleri (GBV)nin güvenirliğini artırmak - Tahmin yöntemlerini geliştirmek 2010’da veri değişimi : - Tahmini Yavrulama Değerleri - Döl testi yapılmış > 16.000 Holstein boğanın genotipleri Sonuç: GBV güvenirliğinde artış : %10
Genomik Seçim (GS) Yasal yönleri Genomik Yavrulama Değerleri (GBV’s) Ağustos 2010’da ICAR/Interbull tarafından onaylanmış CRV’nin GS sistemi AB onaylanmış GS sistemleriyle GBV’lerin hesaplandığı boğaları damızlık boğa olarak görmektedir. Ağustos 2010’da NL/FL’de milli BV tahminindeki GBVler
Genomik Seçim (GS) İki öz kardeşle bir örnek Genç baba 9335 (seçilmiş) Belirleyici etki üretimi +646,-.15, -.06,+15,+17,+ 43 inet inSire yavrulama değeri (cins + belirleyici bilgileri) +941,-.03,+,08,+33,+33,+103 inet Belirleyici etki diğer özellikler ve inSire yavrulama değeri vücut +3.8 104 meme +4.6 110 ayaklar +5.0 109 Toplam puan +5.8 112 Hücre sayımı +0.9 104 ömrü +102 446 Genç baba 7185 (seçilmemiş) Belirleyici etki üretimi -304,+.09, -.03, -6, -13, -39 inet inSire yavrulama değeri (cins + belirleyici bilgileri) +59,+.32,+.10,+28, +8, +49 inet Belirleyici etki diğer özellikler ve inSire yavrulama değeri vücut -3.4 104 meme -4.2 104 ayaklar -2.3 106 Toplam puan -4.2 107 Hücre sayımı -1.6 106 ömrü -107 134
Genomik Seçim (GS) CRV 2008 – 2010 Yavrulama programı Boğa annelerinin seçilmesi (1:5) Boğa ve düve danaların seçilmesi (1:5) Genç GS boğalarının semenlerinin satılması Boğa babası olarak GS boğalarının kullanılması (%25)
Genomik Seçim (GS) CRV 2008 – 2010 Yavrulama Programı Delta Nucleus 100 GS seçilmiş düve ve 20 Deltadonor Eurodonor 250 GS seçilmiş potansiyel boğa annesi Genotiplenecek 1300 yüksek düzeyli boğa danaları 260 GS seçilmiş boğa 40 seçilmiş damızlık boğa
Genomik Seçim (GS) CRV 2010 – 2012 Yavrulama programı Genişletilmiş yavrulama programı 1300 2600 genotiplenmiş boğa danaları Daha fazla ön seçim 1:5 1:15 seçim 260 170 GS boğaları Üç bölüm 100 Siyah & Beyaz: NVI (NL (Hollanda) yavrulama indeksi) 40 Kızıl & Beyaz: NVI (NL (Hollanda) yavrulama indeksi) 30 Siyah & Beyaz: TPI (ABD yavrulama indeksi)
Genomik Seçim (GS) CRV 2010 – 2012 Yavrulama programı Delta Nucleus 100 GS seçilmiş düve ve 20 Deltadonor Eurodonor 250 GS seçilmiş potansiyel boğa annesi Genotiplenecek 2,600 yüksek düzeyli boğa danaları 170 GS seçilmiş boğalar ? Seçilmiş damızlık boğalar
Genomik Seçim Avantajlar Döl testi Doğumda Yavrulama Değeri’nin %35 güvenirliği Boğa yaşıyla 5 yaşındaki yüksek güvenirlik fakat, Yavaş sistem / uzun oluşum arası Maliyet olarak (seçim 1:15) Genomik Seçim Doğumda Yavrulama Değeri’nin %65 güvenirliği Daha doğru seçim Kısa oluşum arası Yıllık 2x daha yüksek genetik edinim
Genomik Seçim Genomik Yavrulama Değerlerinin Güvenirliği Voor Genomic Selection is een referentiepopulatie nodig bestaande uit stieren die EN een gerealiseerde fokwaarde hebben, EN getypeerd zijn voor de merkers. Op basis van de referentiepopulatie kunnen de merkereffecten worden geschat. Op basis van deze merkereffecten kan dan de GS fokwaarde van getypeerde kalveren worden bepaald. 1300 stieren met fokwaarde zijn getypeerd. Een validatiestudie is uitgevoerd. In de validatiestudie wordt van een deel van de stieren de gerealiseerde fokwaarde weggegooid, en wordt vervolgens bekeken hoe goed de merkerfokwaarde van de stier dan de gerealiseerde fokwaarde voorspelt. Op basis van de validatiestudie is de conclusie dat GS fokwaarden met een betrouwbaarheid van 50% realistisch is voor de huidige stand van de techniek. Deze 50% geldt voor dieren zonder eigen prestatie en zonder nakomelingen. Het is (afhankelijk van het kenmerk) een 10 - 20% hoger dan de traditionele verwachtingswaarde. Voor dieren die al wel eigen prestatie of nakomelingen hebben is de toegevoegde waarde van GS minder (zie de tabel).
31 32 28 33 37 35 19 25 27 18 10 20 30 40 50 60 70 80 Toplam yetenek (nvi) Süt verimi Protein verimi meme Ayak & bacaklar Nihai sonuç Yaşam ömrü Eşeysiz hücre sayımı 1. İnsem doğurma Pedigree EBV Genomic EBV
Genomik Seçim Reliability of Genomic Breeding Value (%) for production Met de extra informatie van de merkers is de Btbh van de jonge InSire stieren al enorm toegenomen. In 2005 5 merkers. 2007 3000 merkers. 2009 60.000 merkers en ruim 4000 fokstieren in de referentiepopulatie. 2011 ruim 10.000 fokstieren in de referentiepopulatie bij 60.000 merkers Betrouwbaarheid fokstier met een eerste fokwaarde bv. Cricket is voor NVI 75%. Betrouwbaarheid fokstier na één jaar b.v Bertil is voor NVI 83% Betrouwbaarheid fokstier second crop stier bv. Win 395 is voor NVI 98%
Genomik Seçim Faydaları Artan genetik gelişim (%30-40/yıl) Daha kısa oluşum arası Test boğalarının daha yüksek genetik düzeyi Embriyonun daha yüksek genetik düzeyi Ticari boğaların & daha yüksek düzeyin daha geniş portfolyosu Daha fazla farklı türden yavrulama; daha az aynı türden yavrulama
Genomik Seçim Büyük bir adım ileri!