Mutasyon Analiz Teknikleri III

... konulu sunumlar: "Mutasyon Analiz Teknikleri III"— Sunum transkripti:

1 Mutasyon Analiz Teknikleri III
Hafta IX PCR Temelli Genetik Analiz Yaklaşımları Mutasyon Analiz Teknikleri III Doç. Dr. Hilâl Özdağ

2 Bir sonraki aşama…. 1. SSCP, HA, DHPLC, TGCE benzeri bir teknikle saptadığınız ve incelediğiniz DNA fragmentinde konformasyonel değişime neden olan dizi değişiminin ne olduğunu ortaya çıkarmak, 2. İncelediğiniz DNA fragmentini bir indirekt yöntemle analiz etmeden doğrudan dizi bazında değerlendirmek, 3. Klonlamak üzere hazırladığınız DNA fragmentine klonlama öncesi aşamalarda (PCR) hatalı bir baz girip girmediğinden emin olmak için Bir sonraki aşama DNA dizi analizidir.

3 DNA DİZİ ANALİZİ

4 PCR TEMELLİ MUTASYON ANALİZ YÖNTEMLERİ
MUTASYONU ÖNCEDEN BİLİYOR VE YENİ BİR ÖRNEK GRUBUNDA VARLIĞINI SORGULAMAK İSTİYORSANIZ RFLP ( Restriction Fragment Length Polymorphism) ASA (Allele Specific Amplification) Primer Extension

5 PCR TEMELLİ MUTASYON ANALİZ YÖNTEMLERİ
RFLP Yabanıl Tip Allel AGATCT TCTAGA RE kesim bölgesi Mutant allel AGAGCT TCTCGA RE bölgesi kaybolmuş

6 PCR TEMELLİ MUTASYON ANALİZ YÖNTEMLERİ
ASA

7 Primere bir nt eklenmesi
Primer Extension : Saptama: Floresans Bağlanma: Primere bir nt eklenmesi Uzama:

8 Primer Extension :