AMİNO ASİTLERİN ÖZELLİKLERİ

... konulu sunumlar: "AMİNO ASİTLERİN ÖZELLİKLERİ"— Sunum transkripti:

1 AMİNO ASİTLERİN ÖZELLİKLERİ
Prof. Dr. Esma GÜR

2 COOH H H R – C – NH2 R – C – NH3 COO ZWİTTERİYON
+ R – C – NH R – C – NH3 pH= 7 - COO ZWİTTERİYON İNSAN VÜCUDUNDA -amino asitler hakim

3

4

5

6

7 CO N R CORN prensibi ile L- amino asit (L-Ala)

8 Alifatik amino asitler

9 Aromatik amino asitler

10 Bazik amino asitler

11 Asidik amino asitler

12 Nötral-polar amino asitler

13 Yapısal önemi olan amino asitler

14 Dissosiasyon Kat Sayısı
Denge Sabiti(Ka) Dissosiasyon Kat Sayısı + - Ka = [H ] [A ] [HA] -logKa = pKa -log Ka = -log [H ] - log [A ] [HA] - + pH = pKa + log [A ] [HA] -

15 pI = İzoelektrik Nokta pKa1 + pKa2 pI = 2
Amino asitin 2’den fazla dissosiye olan grubu var ise pI = nötral formun iki tarafındaki pKa’ ların ortalamasıdır.

16 pI = ( ) / 2 = 6.02

17 2.09 3.86 9.8 pI = ( ) / 2 = 2.98

18 Glutamik Asit

19 pKa1=3.2 pKa2=4.25 pKa3=9.67 pI = ( ) / 2 = 3.7

20 pI = ( ) = 10.0 2.16 9.2 10.8

21

22 Amino Acid pKa for a-COOHpKa for a-NH3+ pKa for R group
Glycine   Alanine Leucine Serine   Threonine Glutamine Aspartic acid Glutamic acid Histidine Cysteine Tyrosine Lysine Arginine

23 2 Doğru cevap seçin: PK değerinin altındaki pH’ da iyonize olabilen gruplar protonlanır. Eğer bir molekül düşük pK değerine sahipse, bu molekülün protonlara ilgisi yüksektir. Asetik asitin pK’sı =4.7 dir. pH 7.4 de sadece asetik asit bulunur. Amino asitler gibi moleküllerin sadece 1 pK değeri olur. pK, amino asitlerin birbirine bağlanma şeklini tahmine yarar. Eğer ortamın pH’sı X molekülünün pK sından yüksek ise, X molekülünün proton kaybetmiş formu hakim olur.

24 Proteinlerde Primer Yapının Saptanması
Örnek hidrolizi (6 M HCl 110°C 24 sa.) Sekans (dize) Analizi : protein polipeptidlera.a analizi veya Edman reaksiyonu Br-CN ile parçalanma

25

26

27 Edman reaksiyonu ile a.a. dizesi saptanması
Fenil izotiyosiyanür

28 Amino asid dizesi saptanırken;
Protein zinciri denatüre edilerek çözülür S-S bağları açılır Daha küçük peptidlere parçalanır (proteazlar ile) Küçük peptidlerin (oligopeptidler) dizeleri saptanır. Büyük proteinin a.a. dizesi hesaplanır

29 (H3N-) Gly-Arg-Phe-Ala-Lys-Trp-Val(-COO)
Tripsin (Lys ve Arg C-terminalinden) Gly-Arg Phe-Ala-Lys Trp-Val Gly-Arg Phe-Ala-Lys Trp-Val (H3N-) Gly-Arg-Phe-Ala-Lys-Trp-Val(-COO) Kimotripsin (Aromatik a.a.lerin C-terminalinden) Gly-Arg-Phe + Ala-Lys-Trp + Val(-COO) Gly-Arg Phe-Ala-Lys Trp-Val Gly-Arg-Phe Ala-Lys-Trp Val

30

31 Amino Asitlerin Kullanıldığı Reaksiyonlar
Peptid bağı oluşumu Transaminasyon Dekarboksilasyon Deaminasyon

32 Peptid bağı oluşumu

33

34

35

36

37

38 Peptid zinciri

39 Peptid bağını gösterin.

40 Özel bir bağ: Disülfit bağı (S-S bağı)

41

42

43 Transaminasyon

44 AST (Aspartat Transaminaz)

45 Transaminasyon reaksiyonları
-amino asit Enzim-Piridoksal -amino asit -keto asit Enzim-Piridoksamin -keto asit

46 ALT reaksiyonu Alanin ALT -Piridoksal Glutamat Piruvat
ALT-Piridoksamin -keto glutarat

47 Dekarboksilasyon

48

49

50 Amino acid Amine Fonksiyonu serin ethanolamin Conversion of phosphatidyl serine to phosphatidyl ethanolamine in bacteria lysin cadaverin 1,5-diaminopentane arginin/ornithin putrescin 1,4-diaminobutane spermine and spermidine oluşumu histidin histamin vasodilator, inflamatuvar, mideden asit sekresyonunu uyarır; mast hücrelerinde yapılıp sekrete edilmek üzere depolanır glutamat gamma-aminobutyrat, GABA Beyinde önemli nörotransmitter 3,4-dihydroxyphenylalanine (Dopa) dopamin hydroxytyramin Beyinde inhibitör nörotransmitter catecholaminlerin ve melaninin öncüsü 5-hydroxytryptophan serotonin melatonin’in öncüsü phenylalanin phenylethylamin antidepressan, amfetamin gibi uyarıcı, çikolatada var

51 Glutamat dehidrojenaz sistemi

52 Glutamat Dehidrojenaz sistemi