Hollanda Genetik Bilim= HG = CRV

... konulu sunumlar: "Hollanda Genetik Bilim= HG = CRV"— Sunum transkripti:

1

2 Hollanda Genetik Bilim= HG = CRV
Türkiye Acentası = Demsa

3 CRV Hakkındaki Gerçekler
CRV’nin sahipleri: CR Delta (%80) ve VRV (% 20). CR Delta ve VRV işbirliğidir CR Delta: Hollanda’da 23,000 üye VRV: Belçika’da 7,000 üye (Flanders) > Dünya çapında 2,000 işçi > Dünya çapında 100,000 müşteri 2009/2010’da € 140 milyon € ciro Arnhem’de Merkez Ofis (NL) Ofisler: Oosterzele (BE), Deventer (NL)

4 Dünya Çapında CRV CRV Holding (CRV BV ve CRV International)
Bağlı kuruluşlar (AI station) CRV Lagoa, Brezilya CRV Çek Cumhuriyeti CRV Ambreed, Yeni Zelanda CRV ABD CRV Almanya Bağlı kuruluşlar (satışlar ve hizmet) CRV İspanya CRV Lüksemburg CRV Avustralya CRV Xseed, Güney Afrika

5 Dünya Çapında CRV CRV Holding (CRV BV and CRV International)
Ortak Girişimler (AI station) BBG, Belçika (%33) Profarm, Pakistan (%50) Ortak Girişimler (eşeyli semen) ST Benelux (%50), ST Brezilya (%50) İttifaklar Grassland Alliance (İrlanda) Moskovskoe (Rusya Fed.) Elita (Ukrayna) Distribütörler > 50 ülke

6 CRV’nin DHI faaliyetleri
Soy kütüğü kaydı, Süt kaydı ve Tür sınıflandırması (DHI hizmetleri) Aşağıdakilerle ilgili veri toplama: Yavrulama (doğal çiftleşme/AI/embriyo nakli) Tanımlama & Kayıt Soy: soy kütüğü kaydı Süt kaydı Tür sınıflandırması IRIS yazılımıyla işlem verileri Çiftçilere yönetim bilgileri temin etmek Seçme programları için onları kullanmak Genetik değerlendirme için onları kullanmak Uluslar arası DHI örgütlerine IRIS Takviyesi

7 CRV’nin genetik ürünleri
Yüksek düzeyli yavrulama programlarıyla ortaya çıkan semen, eşeyli semen ve embriyolar Mevcut soylar : B&W Holstein (Hollanda, Çek, ABD) R&W Holstein (Hollanda, Çek) Pasture Breed Holstein (Yeni Zelanda,İrlanda) MRY (Hollanda+Almanya) Simmental (Çek, Almanya) Jersey (Yeni Zelanda) Belgium Blue (Belçika) Gir, Girandola (Brezilya) Nelore (Brezilya)

8 Genomik Seçim

9 Hollanda’da yavrulamanın tarihçesi
Yavrulama soya göre seçilmeye dayalıdır Yavrulama döl testiyle seçilmeye dayalıdır (1970’den beri) Yavrulama Genomik Seçimle seçilmeye dayalıdır (2009’dan beri)

10 2005’te CRV ile döl testi Popülasyonda rasgele 1500 semen dozunun yayılmasıyla boğa yaşıyla 14 aylık 500 tane Siyah & Beyaz ve Kızıl & Beyaz Holstein Friesian boğaların testi Boğalar + 5 yaşındayken ve yavrulama değerleri hesaplandığında eldeki test sonuçları (evlatların performansı) Üretime ilişkin güvenilirlik yavrulama değerleri istenen: 100 çiftlikte 110 evlat ilk testlere dayanarak: + % 80 Boğa yaşıyla 8 yaşındayken: > %90 Yılda boğanın seçimi (1: 15)

11 Geleneksel yavrulama sistemlerinin (Dez)avantajları
Cinse dayalı yavrulama : Düşük güvenirlilik (< %35) (-) yavaşça(-) Döl testine dayalı yavrulama : Yüksek güvenirlilik (+) Yavaşça (-) Uzun oluşum arası (-) Maliyet olarak (-) Yavrulamanın yönünü değiştirmek kolay değildir (-)

12 Genomik Seçim (GS) İnkılapçı yeni yavrulama tekniği
Genler üzerinde işaretleyici tanımlamaya (SNP’s) dayalıdır; genetik manipülasyon yoktur Cinse ve işaretleyicilere dayanan erkek ve dişilerin yavrulama değerinin hesaplanması Erken dönemde yavrulama değerinin yüksek güvenirliliği

13 Genomik Seçim (GS) Genomic selection
Genetik belirleyiciler (SNP’s) genlere yakın uzanan DNA’nın küçük fark edilebilir parçalarıdır. Kromozom 1 Kromozom 29 Kromozom 3

14 DNA çipleriyle genotipleme
...CAGTCAGTCGTACCAGTCT... ...CAGTCAGTAGTACCAGTCT...

15 Genomik Seçim (GS) Genomik Seçim’de yapılacak adımlar
Belirleyicilerin tanınması (SNP’s) Döl testi yapılmış ve genotiplenmiş referans boğalar ile belirleyici etkilerinin tanınması Doğrulama boğaları  % güvenirlilik Daha fazla SNPler ve daha fazla referans boğalarla daha yüksek güvenirlilik Yavrulama programlarında/doğrudan satışlarda GS kullanımı

16 Genomik Seçim (GS) Genomic selection
Genomik Seçim’in Geliştirilmesi (GS) 2006: + 3,000 SNP’s (belirleyiciler) ve 1,500 referans boğa (Holstein Friesian) 2007: + 60,000 SNP’s ve 1,500 referans boğa 2008: + 60,000 SNP’s ve 4,000 referans boğa 2010: + 60,000 SNP’s ve 16,000 referans boğa (EuroGenomics) 2011: + 800,000 SNP’s ve 18,000 referans boğa (EuroGenomics)

17

18 Genomik Seçim (GS) Ortaklar EuroGenomics
UNCEIA (Fransa) CRV (Hollanda) DHV and VIT (Almanya) Viking Genetics (Danimarka, İsveç, Finlandiya) INRA (Fransa) University of Liège (Belçika) Nordic Cattle Genetic Evaluation (İsveç) Aarhus University (Danimarka)

19 Genomik Seçim (GS) 2009’da genotip referans popülasyonlar
Ülke Holstein Diğer cinsler ABD & Kanada Almanya Hollanda/Fla Danimarka/İsveç/Finlandiya Fransa Avustralya Yeni Zelanda İtalya UK Polonya İrlanda

20 Genomik Seçim (GS) EuroGenomics’in Hedefi
Bilgileri ve verileri paylaşınız: - Genomik Yavrulama Değerleri (GBV)nin güvenirliğini artırmak - Tahmin yöntemlerini geliştirmek 2010’da veri değişimi : - Tahmini Yavrulama Değerleri - Döl testi yapılmış > Holstein boğanın genotipleri Sonuç: GBV güvenirliğinde artış : %10

21 Genomik Seçim (GS) Yasal yönleri
Genomik Yavrulama Değerleri (GBV’s) Ağustos 2010’da ICAR/Interbull tarafından onaylanmış CRV’nin GS sistemi AB onaylanmış GS sistemleriyle GBV’lerin hesaplandığı boğaları damızlık boğa olarak görmektedir. Ağustos 2010’da NL/FL’de milli BV tahminindeki GBVler

22 Genomik Seçim (GS) İki öz kardeşle bir örnek
Genç baba 9335 (seçilmiş) Belirleyici etki üretimi +646,-.15, -.06,+15,+17,+ 43 inet inSire yavrulama değeri (cins + belirleyici bilgileri) +941,-.03,+,08,+33,+33,+103 inet Belirleyici etki diğer özellikler ve inSire yavrulama değeri vücut meme ayaklar Toplam puan Hücre sayımı ömrü Genç baba 7185 (seçilmemiş) Belirleyici etki üretimi -304,+.09, -.03, -6, -13, -39 inet inSire yavrulama değeri (cins + belirleyici bilgileri) +59,+.32,+.10,+28, +8, +49 inet Belirleyici etki diğer özellikler ve inSire yavrulama değeri vücut meme ayaklar Toplam puan Hücre sayımı ömrü

23 Genomik Seçim (GS) CRV 2008 – 2010 Yavrulama programı
Boğa annelerinin seçilmesi (1:5) Boğa ve düve danaların seçilmesi (1:5) Genç GS boğalarının semenlerinin satılması Boğa babası olarak GS boğalarının kullanılması (%25)

24 Genomik Seçim (GS) CRV 2008 – 2010 Yavrulama Programı
Delta Nucleus 100 GS seçilmiş düve ve 20 Deltadonor Eurodonor 250 GS seçilmiş potansiyel boğa annesi Genotiplenecek 1300 yüksek düzeyli boğa danaları 260 GS seçilmiş boğa 40 seçilmiş damızlık boğa

25 Genomik Seçim (GS) CRV 2010 – 2012 Yavrulama programı
Genişletilmiş yavrulama programı 1300  2600 genotiplenmiş boğa danaları Daha fazla ön seçim 1:5  1:15 seçim 260  GS boğaları Üç bölüm 100 Siyah & Beyaz: NVI (NL (Hollanda) yavrulama indeksi) 40 Kızıl & Beyaz: NVI (NL (Hollanda) yavrulama indeksi) 30 Siyah & Beyaz: TPI (ABD yavrulama indeksi)

26 Genomik Seçim (GS) CRV 2010 – 2012 Yavrulama programı
Delta Nucleus 100 GS seçilmiş düve ve 20 Deltadonor Eurodonor 250 GS seçilmiş potansiyel boğa annesi Genotiplenecek 2,600 yüksek düzeyli boğa danaları 170 GS seçilmiş boğalar ? Seçilmiş damızlık boğalar

27 Genomik Seçim Avantajlar
Döl testi Doğumda Yavrulama Değeri’nin %35 güvenirliği Boğa yaşıyla 5 yaşındaki yüksek güvenirlik fakat, Yavaş sistem / uzun oluşum arası Maliyet olarak (seçim 1:15) Genomik Seçim Doğumda Yavrulama Değeri’nin %65 güvenirliği Daha doğru seçim Kısa oluşum arası Yıllık 2x daha yüksek genetik edinim

28 Genomik Seçim Genomik Yavrulama Değerlerinin Güvenirliği
Voor Genomic Selection is een referentiepopulatie nodig bestaande uit stieren die EN een gerealiseerde fokwaarde hebben, EN getypeerd zijn voor de merkers. Op basis van de referentiepopulatie kunnen de merkereffecten worden geschat. Op basis van deze merkereffecten kan dan de GS fokwaarde van getypeerde kalveren worden bepaald. 1300 stieren met fokwaarde zijn getypeerd. Een validatiestudie is uitgevoerd. In de validatiestudie wordt van een deel van de stieren de gerealiseerde fokwaarde weggegooid, en wordt vervolgens bekeken hoe goed de merkerfokwaarde van de stier dan de gerealiseerde fokwaarde voorspelt. Op basis van de validatiestudie is de conclusie dat GS fokwaarden met een betrouwbaarheid van 50% realistisch is voor de huidige stand van de techniek. Deze 50% geldt voor dieren zonder eigen prestatie en zonder nakomelingen. Het is (afhankelijk van het kenmerk) een % hoger dan de traditionele verwachtingswaarde. Voor dieren die al wel eigen prestatie of nakomelingen hebben is de toegevoegde waarde van GS minder (zie de tabel).

29 31 32 28 33 37 35 19 25 27 18 10 20 30 40 50 60 70 80 Toplam yetenek (nvi) Süt verimi Protein verimi meme Ayak & bacaklar Nihai sonuç Yaşam ömrü Eşeysiz hücre sayımı 1. İnsem doğurma Pedigree EBV Genomic EBV

30 Genomik Seçim Reliability of Genomic Breeding Value (%) for production
Met de extra informatie van de merkers is de Btbh van de jonge InSire stieren al enorm toegenomen. In merkers merkers merkers en ruim 4000 fokstieren in de referentiepopulatie ruim fokstieren in de referentiepopulatie bij merkers Betrouwbaarheid fokstier met een eerste fokwaarde bv. Cricket is voor NVI 75%. Betrouwbaarheid fokstier na één jaar b.v Bertil is voor NVI 83% Betrouwbaarheid fokstier second crop stier bv. Win 395 is voor NVI 98%

31 Genomik Seçim Faydaları
Artan genetik gelişim (%30-40/yıl) Daha kısa oluşum arası Test boğalarının daha yüksek genetik düzeyi Embriyonun daha yüksek genetik düzeyi Ticari boğaların & daha yüksek düzeyin daha geniş portfolyosu Daha fazla farklı türden yavrulama; daha az aynı türden yavrulama

32 Genomik Seçim Büyük bir adım ileri!